研究背景：唇腭裂(Cleft Lip and/or Palate, CL/P)是一種常見但不致命的出生缺陷,屬于主要的顱面發(fā)育畸形之一,具有復(fù)雜病因和遺傳異質(zhì)性的特點(diǎn)。大約70%的唇腭裂患者具有獨(dú)立的癥狀,并未涉及到其他明顯或可辨別的結(jié)構(gòu)畸形,稱為非綜合征性唇腭裂(Non-syndromic cleft lip and or palate,NSCL/P)。作為一種復(fù)雜的多基因遺傳病,非綜合征性唇腭裂是遺傳因素和環(huán)境因素共同作用的結(jié)果。鋅指蛋白在基因的表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞分化、胚胎發(fā)育等生命過程中發(fā)揮重要作用。目前,一些報(bào)道指出鋅指蛋白基因與非綜合征性唇腭裂有關(guān)。前期工作中對(duì)唇腭裂家系進(jìn)行外顯子組測序得到候選基因鋅指蛋白347(ZNF347)和鋅指蛋白426(ZNF426),本文探討了這兩個(gè)基因的多態(tài)性與非綜合征性唇腭裂(NSCL/P)之間的關(guān)系,為了解NSCL/P形成的分子機(jī)制、尋找有臨床意義的遺傳易感標(biāo)記提供了基礎(chǔ)理論依據(jù)。方法：本文采用的是病例-對(duì)照研究,樣本包括502例唇腭裂患者和482例健康對(duì)照者；涉及三個(gè)基因位點(diǎn),其中rs10417172和rs2195310屬于基因ZNF347上的位點(diǎn),rs2042199則屬于ZNF426基因上的位點(diǎn),兩個(gè)基因均是本實(shí)驗(yàn)室前期通過外顯子組測序得到的候選基因。實(shí)驗(yàn)采用PCR-RFLP的方法對(duì)所有樣本進(jìn)行基因分型,所得結(jié)果通過統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件SPSS 19.0和在線軟件SHEsis進(jìn)行統(tǒng)計(jì),分析得到的P值經(jīng)過Bonferroni校正,P值仍然小于0.05的數(shù)據(jù)被認(rèn)為是具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的；P值大于0.05的數(shù)據(jù),再經(jīng)過多重檢驗(yàn)陽性發(fā)現(xiàn)錯(cuò)誤率(FDR校正法),未超過閾值的可以看做仍然具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果：在病例組和對(duì)照組中,rs10417172位點(diǎn)的突變型雜合子CT型和最小等位基因C表現(xiàn)出明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義：CT型(P=0.004, OR=1.657,95%置信區(qū)間CI:0.936-1.628), C等位基因(P=0.002, OR=1.648,95% CI:1.202～2.260);rs2195310位點(diǎn)的突變型雜合子GA基因型也表現(xiàn)出明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.005, OR=1.582,95% CI:1.145-2.186)。性別分層后,rs10417172位點(diǎn)的C等位基因在男性中存在著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.008, OR=1.696,95% CI:1.144～2.515)；對(duì)于rs2195310位點(diǎn),攜帶GA基因型和等位基因A的個(gè)體具有更高患唇腭裂的風(fēng)險(xiǎn)：(GA基因型：p=0.014, OR=1.627,95% CI:1.103-2.399),(等位基因A:p=0.030,OR=1.452,95%CI:1.036-2.037).唇腭裂病例分型分層后,在CPO組,rs10417172位點(diǎn)的CT型和等位基因C存在著顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,(CT型：p=281281177144373E-4,OR=1.584,95%CI:1.032-2.433),(等位基因C：p=4.6804035508758566E.4,OR=,2.548,95%CI:1.484-4.376)；rs2195310位點(diǎn)的GA基因型也存在著顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p=0.027,OR=1.706,95%CI：1.060-2.745)。結(jié)論：本文是首例研究鋅指蛋白家族成員的ZNF347和ZNF426基因多態(tài)性與非綜合征性唇腭裂的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果表明ZNF347基因上的rs10417172位點(diǎn),CT基因型和C等位基因與非綜合征性唇腭裂的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有顯著的相關(guān)性；ZNF347基因上的另一位點(diǎn)rs2195310位點(diǎn),GA基因型和A等位基因與非綜合征性唇腭裂的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有明顯的關(guān)聯(lián)性,本文的結(jié)果從分子流行病學(xué)角度為非綜合征性唇腭裂(NSCL/P)的發(fā)病機(jī)制提供一定的理論依據(jù),所發(fā)現(xiàn)的多態(tài)位點(diǎn)有可能作為臨床轉(zhuǎn)化研究中的分子檢測標(biāo)記。
【學(xué)位單位】：蘭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2013
【中圖分類】：R782.2
【文章目錄】：
縮略詞表
中文摘要
Abstract
前言
    1 唇腭裂
        1.1 唇腭裂概述
        1.2 唇腭裂分類
        1.3 影響非綜合征性唇腭裂的因素
    2 ZNF347和ZNF426基因概述
        2.1 鋅指蛋白
        2.2 ZNF347和ZNF426基因
材料和方法
    1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.1 研究對(duì)象
        1.2 主要試劑和儀器
    2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 基因組DNA的提取
        2.2 DNA樣本質(zhì)檢
        2.3 SNP選擇
        2.4 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR擴(kuò)增）和基因分型
        2.5 測序
        2.6 PCR產(chǎn)物及基因分型結(jié)果質(zhì)量控制
        2.7 數(shù)據(jù)分析
結(jié)果
    1 不同位點(diǎn)基因型和等位基因頻率檢測結(jié)果
        1.1 ZNF347和ZNF426基因位點(diǎn)PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果
        1.2 ZNF347基因rs104171712位點(diǎn)的基因多態(tài)性
        1.3 ZNF347基因rs2195310位點(diǎn)的基因多態(tài)性
        1.4 ZNF426基因rs2195310位點(diǎn)的基因多態(tài)性
    2 單倍型分析
討論
    1 ZNF347基因與非綜合征性唇腭裂的關(guān)系
        1.1 rs10417172位點(diǎn)與非綜合征性唇腭裂的關(guān)系
        1.2 rs2195310位點(diǎn)與非綜合征性唇腭裂的關(guān)系
    2 ZNF426基因與非綜合征性唇腭裂的關(guān)系
    3 19號(hào)染色體與唇腭裂的關(guān)系
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
在學(xué)期間的研究成果
致謝

【共引文獻(xiàn)】

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1 郭思遠(yuǎn);陳仁吉;;環(huán)境因素與基因交互作用和非綜合征性唇腭裂關(guān)系研究進(jìn)展[J];北京口腔醫(yī)學(xué);2015年05期

2 張小芳;要跟東;李守霞;;非綜合征性唇腭裂的研究進(jìn)展[J];中國優(yōu)生與遺傳雜志;2015年07期

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2 張婷婷;中國西北人群NOTCH3，JAG2基因多態(tài)性與非綜合征性唇腭裂的關(guān)聯(lián)研究[D];蘭州大學(xué);2012年

3 雷婷纓;染色體微陣列技術(shù)在先天性唇腭裂畸形患者中的應(yīng)用[D];廣州醫(yī)科大學(xué);2014年

本文編號(hào)：2862518