本文關(guān)鍵詞：牙囊干細(xì)胞成骨分化基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 牙囊干細(xì)胞 成骨分化 調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 生物信息學(xué)分析

【摘要】：目的:應(yīng)用生物信息學(xué)分析牙囊干細(xì)胞(DFSCs)成骨分化過程中基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。方法:從GEO Datasets數(shù)據(jù)庫獲取在DFSCs成骨分化過程中差異表達(dá)的基因。應(yīng)用DAVID和Gene MANIA數(shù)據(jù)庫對這些基因的關(guān)系進(jìn)行分析。結(jié)果:從GEO Datasets數(shù)據(jù)庫獲得了大量DFSCs成骨分化過程中差異表達(dá)的基因,對差異表達(dá)明顯(P0.05)的289個基因進(jìn)行分析,富集到"細(xì)胞分化"、"細(xì)胞增殖"、"骨骼系統(tǒng)發(fā)育"、"鈣信號通路"等基因子集。其中ALPL、CTSK、TUFT1、TGFBR2、FHL2、ROR2、STC1、POSTN,ZBTB16、FRZB、PRELP、IGFBP5等12個基因被富集在"骨骼系統(tǒng)發(fā)育"子集,這12個基因通過共表達(dá)、共定位、遺傳學(xué)相互作用等彼此關(guān)聯(lián)并與其它信號通路相聯(lián)系。結(jié)論:DFSCs成骨分化中許多差異表達(dá)的基因間存在相互作用的分子網(wǎng)路。需要從WNT、TGFbeta、MAPK等信號通路、同源盒轉(zhuǎn)錄因子及成骨分化標(biāo)記物基因的整體關(guān)系上來認(rèn)識DFSCs成骨分化。
【作者單位】： 上海市徐匯區(qū)大華醫(yī)院口腔科;上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院(古北)口腔科;復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院口腔科;
【關(guān)鍵詞】： 牙囊干細(xì)胞 成骨分化 調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 生物信息學(xué)分析
【分類號】：R781
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本文編號：1064479