目的研究阿爾茲海默癥相關(guān)基因在肝臟中受高脂飲食的調(diào)控。方法通過提取肝臟總RNA進(jìn)行測序,深入分析MS小鼠肝臟AD通路基因的表達(dá)變化,并通過PPI網(wǎng)絡(luò)分析挖掘AD通路關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)基因,利用薈萃分析檢驗(yàn)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)基因在MS人群中的表達(dá)情況,結(jié)合mRNA水平與生化指標(biāo)的相關(guān)性闡明MS誘導(dǎo)AD發(fā)病的機(jī)制。結(jié)果與正常小鼠比較,MS小鼠肝臟AD通路基因的表達(dá)模式明顯不同。利用PPI網(wǎng)絡(luò)分析發(fā)現(xiàn)高節(jié)點(diǎn)度基因Uqcrh、Cyc1和Uqcrq。薈萃分析結(jié)果表明三個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)基因在MS人群體內(nèi)的表達(dá)會(huì)發(fā)生顯著改變。結(jié)論高脂飲食對AD通路基因的影響可能是包括肝臟等外周器官在內(nèi)全身性的而并非僅僅局限于大腦,Uqcrh、Cyc1、Uqcrq等高節(jié)點(diǎn)度基因可能成為研究MS誘發(fā)AD的重要靶點(diǎn)。 

【文章來源】：遵義醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,43(02)

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【部分圖文】：

AD通路基因在肝臟的轉(zhuǎn)錄輪廓分析

如圖2所示,通過列舉小鼠肝臟AD通路部分發(fā)生顯著變化的基因表達(dá)水平,結(jié)果顯示代謝綜合征小鼠肝臟中,Apoe、App、Psen2和Psenen等典型的AD相關(guān)基因的表達(dá)水平發(fā)生顯著變化,其中Apoe和App的表達(dá)水平在代謝綜合征小鼠肝臟中顯著上升,Psenen和Psen2的表達(dá)水平在代謝綜合征小鼠肝臟中顯著降低。2.3 小鼠肝臟AD通路基因的表達(dá)模式

利用分層聚類熱圖分析肝臟AD相關(guān)基因的表達(dá)水平,觀察到對照組和模型組小鼠肝臟AD相關(guān)基因的表達(dá)水平有明顯區(qū)別。如圖3所示,紅色方塊表示高表達(dá)基因,綠色方塊表示低表達(dá)基因,黑色方塊表示無效值。圖中每一列代表一個(gè)基因,其中對照組小鼠肝臟AD通路高表達(dá)基因大都聚集在左側(cè),而MS小鼠肝臟AD通路高表達(dá)基因大都聚集在右側(cè);圖中每一行代表一只小鼠,如圖3所示,所有對照組小鼠聚為一類,所有模型組小鼠聚為一類,組間差異明顯,組內(nèi)層次分明,表明MS小鼠肝臟AD通路基因已經(jīng)具備與正常小鼠不同的表達(dá)模式。2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析


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