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中國漢族人群精神分裂癥和2型糖尿病共享易感基因及其致病機制研究

發(fā)布時間:2020-07-26 13:19
【摘要】:精神分裂癥與2型糖尿病都是世界公認(rèn)的重大公共衛(wèi)生問題。二者都屬于遺傳異質(zhì)性多基因疾病,精神分裂癥患者容易出現(xiàn)2型糖尿病癥狀,40%的精神分裂癥患者有2型糖尿病家庭史,精神分裂癥患者2型糖尿病的患病率明顯高于一般人群,但是兩者潛在的相關(guān)性未知。分子遺傳學(xué)和GWAS研究也提示二者之間可能存在共同的遺傳學(xué)基礎(chǔ),即存在共享易感基因。現(xiàn)至今對于精神分裂癥和2型糖尿病共享易感基因的研究主要是通過全基因組掃描,轉(zhuǎn)錄組和蛋白組表達,雖獲得不少陽性結(jié)果,但兩者疾病關(guān)系極其復(fù)雜,在不同地區(qū)和種族中重復(fù)性較差,結(jié)果爭議很大。 目的 本項目利用生物信息學(xué)、分子遺傳學(xué)及生物統(tǒng)計學(xué)方法,以GWAS鑒定的2型糖尿病易感基因作為候選基因,以中國漢族人群單純精神分裂癥、單純2型糖尿病、精神分裂癥合并2型糖尿病和健康對照為研究對象,在gDNA和mRNA水平分別研究這些候選基因與精神分裂癥、2型糖尿病發(fā)病的相關(guān)性,鑒定共享易感基因并探討其可能的致病機制。 方法 本研究以中國北方漢族人群837例精神分裂癥患者(SCZ組);166例精神分裂合并2型糖尿病患者(SCZ+T2DM組);229例單純2型糖尿病患者(T2DM組),1109例健康對照個體(Control組)為研究對象。所有精神分裂癥患者要符合ICD-10的診斷標(biāo)準(zhǔn),2型糖尿病患者符合2型糖尿病診斷標(biāo)準(zhǔn)。 受試者在知情同意的情況下,采集外周靜脈血5ml,用DNA提取試劑盒提取全血中基因組DNA。以GWAS鑒定的IGF2BP2(rs4402960)、SLC30A8(rs13266634)、FTO(rs8050136)、CDKN2A/B(rs10811661)、CDKAL1(rs7754840)、HHEX(rs1111875)、KCNJ11(rs5219)和MTNR1B(rs1387153)等8個2型糖尿病易感基因作為候選基因,分別采用PCRRFLP和高通量TaqMan探針方法(ABI PRISM7900HT sequence detectionsystem)進行基因分型,建立基因分型數(shù)據(jù)庫。 采用Real-time QPCR方法檢測檢測外周血中IGF2BP2基因及其2種選擇性剪切產(chǎn)物isoform a和isoform b表達水平。以GAPDH作為內(nèi)參基因較正RNA含量的變異,每份樣品均進行3次重復(fù)獨立實驗。采用相對定量方法(2-Δ Δ Ct)分析IGF2BP2基因及其2種選擇性剪切產(chǎn)物isoform a和isoform b的mRNA表達量。應(yīng)用在線遺傳統(tǒng)計SHEsis軟件計算基因型頻率分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律;分析候選基因SNPs位點與精神分裂癥的關(guān)聯(lián)性;分析基因各個位點與2型糖尿病的關(guān)聯(lián)性;應(yīng)用SPSS17.0軟件分析IGF2BP2基因及其2種選擇性剪切產(chǎn)物isoform a和isoform b表達水平在精神分裂癥組與對照組之間的差異。 結(jié)果 1Hardy-Weinberg平衡檢驗 IGF2BP2(rs4402960)、SLC30A8(rs13266634)在病例組和對照組中基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。 FTO(rs8050136)、CDKN2A/B(rs10811661)、 CDKAL1(rs7754840)、 HHEX(rs1111875)、KCNJ11(rs5219)和MTNR1B(rs1387153)位點基因型分布在健康對照組、單純精神分裂癥組、精神分裂癥合并2型糖尿病組以及單純2糖尿病組等4個群體中大部分符合Hardy-Weinberg為平衡定律(P>0.05),說明本研究抽樣樣本來自隨機婚配的群體。其中rs1387153位點的基因型分布在健康對照組中偏離H-W平衡;在單純精神分裂癥組中的rs5219位點以及單純2型糖尿病組中的rs7754840位點,也均偏離H-W平衡;說明這些位點可能是疾病易感SNPs位點或與易感SNPs連鎖。 2IGF2BP2(rs4402960)和SLC30A8(rs13266634)與精神分裂癥、2型糖尿病的遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)研究 采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)的方法,檢測790例中國北方漢族精神分裂癥患者和1083例健康人對照組的IGF2BP2基因rs4402960位點和SLC30A8基因rs13266634位點基因型。遺傳學(xué)分析結(jié)果示:SLC30A8基因rs13266634位點等位基因、基因型頻率在病例組和對照組中差異均不顯著(P>0.05),提示SLC30A8基因與中國漢族人群精神分裂癥發(fā)病無關(guān)聯(lián)。 IGF2BP2基因rs4402960位點基因型和等位基因頻率在病例組和對照組中差異顯著(χ2=7.316,P=0.026;χ2=7.056,P=0.008,OR=1.221)。性別分組示:男性rs4402960位點基因型頻率和等位基因頻率(χ2=8.39,P=0.015;χ2=8.08.P=0.004,OR=1.324)在病例組和對照組中也差異顯著,提示IGF2BP2基因與中國漢族人群精神分裂癥發(fā)病相關(guān)聯(lián)。 精神分裂癥病人IGF2BP2基因表達水平及isoform a表達水平與健康人相比較呈增高趨勢,但差異不顯著。而isoform b在精神分裂癥病例組(1.136±0.324)顯著高于健康對照組(0.885±0.227,t=3.540,P=0.0008或Z=-3.532,P=0.0004)。提示IGF2BP2基因選擇性剪切產(chǎn)物isoform b表達增加可能是其導(dǎo)致精神分裂癥的機制之一。以IGF2BP2基因總體表達(isoform a+isoform b)作為自身對照,則精神分裂癥病人isoform a表達水平與健康對照組比較無顯著差異,而isoform b表達水平在精神分裂癥病例組(1.090±0.271)顯著高于健康對照組(0.916±0.180,t=2.981,P=0.004或Z=-2.779,P=0.005)。 3FTO、CDKN2A/B、CDKAL1、HHEX、KCNJ11和MTNR1B與精神分裂癥、2型糖尿病的遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)研究 (1)候選基因與精神分裂癥的關(guān)系 研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)TO(rs8050136)、CDKN2A/B(rs10811661)、CDKAL1(rs7754840)、HHEX(rs1111875)、KCNJ11(rs5219)和MTNR1B(rs1387153)等6個2型糖尿病易感基因位點可能與中國漢族人群精神分裂癥無關(guān)聯(lián)(all, P>0.05)。CDKN2A/B(rs10811661)、CDKAL1(rs7754840)、HHEX(rs1111875)位點與中國漢族人群2型糖尿病相關(guān)聯(lián),與精神分裂癥合并2型糖尿病相關(guān)聯(lián)(rs10811661:χ2=10.09,P=0.002;OR=0.723; rs7754840: χ2=9.372,P=0.002,OR=1.364;rs1111875:χ2=4.853,P=0.028;OR=1.273)。 (2)候選基因與2型糖尿病的關(guān)系 CDKN2A/B基因rs10811661位點基因型和等位基因頻率在糖尿病組和非糖尿病組中差異顯著(χ2=10.821,P=0.004;χ2=10.821,P=0.001,OR=0.744)。CDKAL1基因rs7754840位點基因型和等位基因頻率在糖尿病組和非糖尿病組中差異顯著(χ2=9.704,P=0.008;χ2=8.534,P=0.003,OR=1.296)。HHEX基因rs1111875位點基因型和等位基因頻率在糖尿病組和非糖尿病組中差異顯著(χ2=11.769,P=0.003;χ2=12.018,P=0.001,OR=1.395)。FTO基因rs8050136位點和KCNJ11基因rs5219位點等位基因、基因型頻率在2型糖尿病各組對比中差異均不顯著(P>0.05),提示FTO和KCNJ11基因與中國北方漢族人群2型糖尿病發(fā)病無關(guān)聯(lián)。 結(jié)論: 1.2型糖尿病易感基因IGF2BP2(rs4402960)與中國北方漢族人群精神分裂癥相關(guān)聯(lián),可能是中國漢族人群精神分裂癥和2型糖尿病的共享易感基因之一。 2. IGF2BP2基因選擇性剪切產(chǎn)物isoform b表達增加可能是其導(dǎo)致精神分裂癥的機制之一。 3.2型糖尿病易感基因SLC30A8(rs13266634)可能與中國北方漢族人群精神分裂癥發(fā)病無關(guān)聯(lián)。 4. CDKN2A/B、CDKAL1、HHEX基因與中國北方漢族精神分裂癥合并的2型糖尿病相關(guān)聯(lián),而與中國北方漢族人群精神分裂癥發(fā)病無關(guān)聯(lián)。 5. CDKN2A/B、CDKAL1、HHEX基因與中國北方漢族2型糖尿病相關(guān)聯(lián)。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R587.1;R749.3

【參考文獻】

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本文編號:2770811

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