【摘要】：目的探討小鼠燒傷后外周血免疫細胞基因表達差異,并對差異基因行生物信息分析,從分子水平全面探討燒傷后免疫細胞功能變化情況,為臨床治療提供新靶點。方法在GEO數(shù)據(jù)庫中下載基因芯片數(shù)據(jù)(GSE7404,小鼠,25%TBSA,3度),經(jīng)過芯片質(zhì)量評估后,獲取差異基因,分別應用go-function數(shù)據(jù)集及DAVID Bioinformatics Resources 6.7對差異基因進行基因本體、生物學通路分析,獲得差異基因相關功能的功能富集類。結(jié)果在燒傷后第1天篩選到1 825個差異基因,其中上調(diào)基因658個,下調(diào)基因1 167個。Gene Ontology分析顯示小鼠燒傷后免疫細胞與免疫系統(tǒng)過程、細胞過程、代謝過程、應對刺激反應、生物調(diào)節(jié)及死亡等功能高度相關。KEGG通路分析顯示上調(diào)基因主要富集到免疫系統(tǒng)、細胞生長與死亡及代謝相關通路;而下調(diào)基因則主要與免疫及代謝通路相關。結(jié)論燒傷是一個復雜的病理生理過程,會引起多種基因表達調(diào)控的改變�；蛐酒磉_譜的生物信息學分析可以在轉(zhuǎn)錄水平反映免疫細胞在燒傷后的分子生物學過程,有助于全面認識燒傷后免疫細胞功能紊亂的發(fā)生機制。
[Abstract]:Objective to investigate the difference of gene expression in peripheral blood immunocytes after burn in mice, and to analyze the biological information of the differentially expressed genes, so as to explore the changes of immune cell function at the molecular level in order to provide a new target for clinical treatment. Methods GeneChip data (GSE7404, mouse 25 TBSAA 3 degrees) were downloaded from GEO database. After chip quality assessment, differentially expressed genes were obtained. Gene ontology and biological pathway analysis were performed by using go-function dataset and david Bioinformatics Resources 6.7, respectively. Functional enrichment classes of differential gene related functions were obtained. Results on the first day after burn, 1 825 differentially expressed genes were screened, including 658 up-regulated genes, and 11167 down-regulated genes. Gene Ontology analysis showed that the immune cells and immune system, cellular processes, metabolic processes and response to stimuli were observed in mice after burn. KEGG pathway analysis showed that the up-regulated gene was mainly enriched into the immune system, cell growth was related to death and metabolism, while down-regulated gene was mainly related to immune and metabolic pathway. Conclusion Burn is a complex pathophysiological process, which can change the regulation of gene expression. Bioinformatics analysis of gene microarray expression profile can reflect the molecular biological process of immune cells after burn at the transcriptional level, which is helpful to fully understand the mechanism of immune cell dysfunction after burn.
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院燒傷科;
【基金】：廣東省科技計劃項目(編號:2014A020212189) 南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院院長基金(編號:2014B013)
【分類號】：R644

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