目的分析云南省不同感染來(lái)源間日瘧原蟲(chóng)環(huán)子孢子蛋白(Pvcsp)基因序列,揭示當(dāng)?shù)豍vcsp基因的種群結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性。方法收集中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病網(wǎng)絡(luò)直報(bào)系統(tǒng)中2014-2017年報(bào)告的云南省本地和輸入性間日瘧病例流行病學(xué)資料及血樣。提取血樣中瘧原蟲(chóng)基因組DNA,巢式PCR擴(kuò)增并測(cè)序。采用MEGA 5.04、Arlequin 3.5.2.2軟件進(jìn)行單倍型、期望雜合度(He)分析,DnaSP 5.10計(jì)算核苷酸多樣性(TT)、同義置換率(Ks)、錯(cuò)義置換率(Ka)及群體間遺傳分化指數(shù)(Fst)。結(jié)果共檢測(cè)間日瘧病例血樣969份,擴(kuò)增獲得650～750 bp大小的目的條帶759份,包括云南本地感染者血樣39份、非洲16份、緬甸688份、老撾13份、柬埔寨2份、巴基斯坦1份。單倍型分析結(jié)果顯示,759條Pvcsp基因序列存在90個(gè)單倍型,其中29個(gè)為PV-I型溫帶族(類似VK210型),50個(gè)為PV-Ⅰ型熱帶族(類似VK210型),11個(gè)為PV-Ⅱ型(類似VK247型);3種基因型所占比例分別為51.4%(390/759)、41.1%(312/759)、7.5%(57/759),分布于...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣本來(lái)源
    1.2 主要試劑
    1.3 Pvcsp基因擴(kuò)增及測(cè)序
    1.4 Pvcsp基因型和多態(tài)性分析
2 結(jié)果
    2.1 Pvcsp基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
    2.2 Pvcsp基因型和氨基酸序列分析
    2.4 Pvcsp基因遺傳分化的群體差異
3 討論



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