發(fā)布時(shí)間：2023-10-29 12:37

　　為進(jìn)行結(jié)核分枝桿菌(MTB)Rv2462c蛋白的理化性質(zhì)分析和T細(xì)胞的表位預(yù)測(cè),首先在NCBI上查詢Rv2462c蛋白的氨基酸序列,運(yùn)用NCBI Blast對(duì)Rv2462c蛋白和人類(lèi)蛋白進(jìn)行同源性分析,用ExPASY(ProtParam)分析軟件對(duì)Rv2462c蛋白進(jìn)行理化性質(zhì)分析,用Expasyde的Protscale程序?qū)v2462c蛋白進(jìn)行疏水性分析,用SignalP和TMHMM軟件對(duì)Rv2462c蛋白進(jìn)行信號(hào)肽和跨膜區(qū)預(yù)測(cè)分析;NetMHCⅡpan3.2Server軟件預(yù)測(cè)Rv2462c蛋白的CD4⁺T細(xì)胞表位的分布情況;分別用NetMHC、NetCTL和SYFPEITHI三種分析軟件預(yù)測(cè)Rv2462c蛋白的CD8⁺T細(xì)胞表位的分布情況,綜合分析預(yù)測(cè)結(jié)果,最終篩選出T細(xì)胞優(yōu)勢(shì)表位。結(jié)果:綜合CD4⁺T和CD8⁺T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)結(jié)果,得到一條優(yōu)勢(shì)表位RLPGFRPGK_40-48。預(yù)測(cè)出的T細(xì)胞優(yōu)勢(shì)表位可以為結(jié)核病特異性診斷和結(jié)核病疫苗開(kāi)發(fā)提供參考。

【文章頁(yè)數(shù)】：4 頁(yè)

【文章目錄】：
1 引言
2 材料與方法
    2.1 材料
    2.2 方法
        2.2.1 同源性分析
        2.2.2 結(jié)核分枝桿菌Rv2462c蛋白的理化性質(zhì)分析
        2.2.3 結(jié)核分枝桿菌Rv2462c蛋白結(jié)構(gòu)分析
        2.2.4 CD4+ T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)
        2.2.5 CD8+ T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)
            (1)NetMHC的CD8+ T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)。
            (2)NetCTL的CD8+ T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)。
            (3)SYFPEITHI的CD8+ T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)。
3 結(jié)果
    3.1 同源性分析結(jié)果
    3.2 結(jié)核分枝桿菌Rv2462c蛋白的理化性質(zhì)分析結(jié)果
    3.3 結(jié)核分枝桿菌Rv2462c蛋白結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
    3.4 CD4+ T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)結(jié)果
    3.5 CD8+ T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)結(jié)果
    3.6 CD4+ T和CD8+ T細(xì)胞表位綜合分析結(jié)果
4 結(jié)果



本文編號(hào)：3858093