Hfq(host factor for RNA phage QB replicase)蛋白是一個(gè)全局性調(diào)節(jié)因子,廣泛參與細(xì)菌生長(zhǎng)、趨化、毒力、耐藥及應(yīng)對(duì)外界選擇壓力等方面的調(diào)節(jié),但在肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)中的功能尚不清楚。本研究從臨床病例中分離到59株KP,將其hfq基因與11例常見(jiàn)臨床感染菌株hfq基因[從美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)數(shù)據(jù)庫(kù)下載]進(jìn)行了比較。所有hfq基因經(jīng)EMBOSS Transeq翻譯成氨基酸序列,用MAFFT軟件進(jìn)行多序列比對(duì),并通過(guò)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中的保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)Hfq蛋白結(jié)構(gòu)域。分別采用ESPript3.0、Phyre2分析Hfq蛋白的二、三級(jí)結(jié)構(gòu)。59株KP中僅3株hfq基因的5個(gè)密碼子位點(diǎn)存在差異,而其蛋白質(zhì)氨基酸序列完全一致。KP與大腸埃希菌、陰溝腸桿菌、痢疾志賀菌之間,Hfq蛋白的氨基酸序列相似度較高,主要區(qū)別在C末端上;與金黃色葡萄球菌、產(chǎn)單核細(xì)胞李斯特菌相比,KP Hfq蛋白在N末端和C末端上差別較大;所...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 菌株
        1.1.2 基因分析軟件
        1.1.3 實(shí)驗(yàn)材料
    1.2 方法
        1.2.1 菌株hfq核酸序列分析
        1.2.2 Hfq氨基酸序列分析
        1.2.3 KP hfq基因的敲除
        1.2.4 菌株耐藥性測(cè)定
        1.2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 臨床分離KP hfq基因密碼子相對(duì)保守
    2.2 Hfq氨基酸理化性質(zhì)
    2.3 Hfq蛋白序列C末端呈酸性
    2.4 KP Hfq蛋白R(shí)NA結(jié)合位點(diǎn)
    2.5 β4-β5區(qū)是Hfq蛋白的重要功能區(qū)域
    2.6 KP hfq基因敲除菌株的耐藥能力下降
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