目的高通量測(cè)序分析日本血吸蟲(chóng)童蟲(chóng)的微小RNA（microRNA,miRNA）,鑒定已知miRNA的表達(dá)水平,預(yù)測(cè)分析miRNA靶基因及其生物學(xué)功能。方法體外制備日本血吸蟲(chóng)童蟲(chóng),提取童蟲(chóng)的總RNA構(gòu)建文庫(kù)進(jìn)行Illumina高通量測(cè)序。采用DEGseq R語(yǔ)言包,結(jié)合perl腳本進(jìn)行miRNA表達(dá)量的差異分析;分別利用miRanda、Blast軟件和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異miRNA進(jìn)行靶基因及其生物學(xué)功能預(yù)測(cè)。結(jié)果構(gòu)建文庫(kù)中,日本血吸蟲(chóng)童蟲(chóng)表達(dá)的miRNAs與最新miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)結(jié)果顯示,共有38 483條匹配序列,鑒定到已知miRNA 60個(gè);其中,sja-miR-125b表達(dá)量最高,其次為sja-miR-61、sja-miR-71a、sja-miR-36-3p和sja-miR-10-5p,上述5種miRNA表達(dá)量占總miRNA的91%（3 263/3 585）。共預(yù)測(cè)到靶基因7 176個(gè),基因功能集中在核苷酸轉(zhuǎn)移酶活性、細(xì)胞氮復(fù)合代謝、分子功能、生物學(xué)過(guò)程、生物合成、等離子體膜及蛋白質(zhì)成熟;功能富集分析顯示,高表達(dá)的miRNA主要參與致病過(guò)程、生物進(jìn)展及多條代謝途徑通路。結(jié)論日... 

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【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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