microRNA（miRNA）是真核生物中存在的一類小分子RNA,通常為18-24nt,廣泛參與基因表達的調(diào)控。紅色毛癬菌是重要的病原真菌,也是淺表感染真菌研究的模式生物。本論文利用二代測序技術(shù),通過構(gòu)建紅色毛癬菌孢子和菌絲的小RNA的文庫,研究miRNA在紅色毛癬菌中的存在情況,并對miRNA調(diào)控的靶基因進行預(yù)測;結(jié)合miRNA與對應(yīng)的靶基因在孢子和菌絲中表達差異對miRNA參與紅色毛癬菌基因表達及生長發(fā)育的調(diào)控進行初步研究。對紅色毛癬菌孢子和菌絲中小RNA高通量測序發(fā)現(xiàn)了 158條保守的miRNAs和12條新發(fā)現(xiàn)的miRNAs。這些miRNA非常保守,屬于92個miRNA家族（miRNA families）,在包括植物、動物等多個物種中都存在。對紅色毛癬菌中miRNA調(diào)控的靶基因進行預(yù)測表明,170條miRNAs調(diào)控的靶基因為5470個。超過一半以上的靶基因?qū)?yīng)2個或2個以上的miRNAs,其中33條miRNAs調(diào)控100個以上的靶基因表達;12個靶基因?qū)?yīng)8條miRNAs。這與一個miRNA可以調(diào)控多個（甚至上千個）基因表達;幾個miRNAs也可以調(diào)節(jié)同一個基因表達的報道相一致。... 

【文章頁數(shù)】：94 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
ABSTRACT
中英文對照表
第一章 引言
    一、miRNA介紹
        1.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)
        1.2 miRNA合成及生物學(xué)特征
        1.3 miRNA的作用機制
        1.4 miRNA的生物學(xué)功能
        1.5 miRNA檢測技術(shù)
        1.6 miRNA生物信息學(xué)分析
        1.7 真菌中miRNA研究進展
    二、紅色毛癬菌研究
    三、立項依據(jù)
第二章 實驗材料與方法
    2.1 實驗材料
    2.2 實驗方法
第三章 實驗結(jié)果和討論
    3.1 紅色毛癬菌孢子和菌絲中miRNA的檢測及特點分析
    3.2 紅色毛癬菌中miRNA的鑒定及其特征分析
    3.3 紅色毛癬菌中miRNA的靶基因預(yù)測及靶基因功能分析
    3.4 紅色毛癬菌中的miRNA在其它表皮癬菌中的保守性
    3.5 紅色毛癬中miRNA表達水平以及差異表達分析
    3.6 miRNA靶基因在孢子和菌絲中表達水平分析
    3.7 mRNA差異表達的關(guān)聯(lián)分析
    3.8 miRNA和mRNA表達水平的RT-qPCR驗證
    3.9 討論
    3.10 總結(jié)
參考文獻
附表
致謝



本文編號：3694594