結(jié)腸炎癌轉(zhuǎn)化小鼠模型的數(shù)據(jù)分析及LEF1/TCFs成員在其中的作用機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2022-02-11 18:49
炎癥性腸病(IBD)作為一種反復(fù)發(fā)作的慢性炎癥,是結(jié)直腸癌發(fā)生的重要高危因素之一。炎癌轉(zhuǎn)化是一個(gè)涉及到許多通路、分子的復(fù)雜過(guò)程,目前確切的機(jī)制研究不多。本研究首先建立了結(jié)腸炎相關(guān)結(jié)腸癌的小鼠模型,獲得了炎癌轉(zhuǎn)化小鼠模型的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),并對(duì)其進(jìn)行了分析和挖掘;此外,用生物信息學(xué)的方法探討了可能參與結(jié)腸炎癌轉(zhuǎn)化的腸道干細(xì)胞及其微環(huán)境相關(guān)基因;最后,重點(diǎn)探討了LEF1/TCFs家族成員在結(jié)腸炎相關(guān)的結(jié)腸癌發(fā)生中的不同作用及其可能的機(jī)制。(第一部分)AOM-DSS小鼠模型是目前研究結(jié)腸炎相關(guān)結(jié)腸癌的一個(gè)重要模型,但是對(duì)此模型的分子機(jī)制研究不多。我們通過(guò)建立小鼠模型,進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜芯片實(shí)驗(yàn)。通過(guò)對(duì)不同組的表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行比較分析,包括腫瘤組織VS正常組織(AD3VSCon)、腫瘤組織VS瘤旁組織(AD3VSAD3N)、炎癌轉(zhuǎn)化晚期VS早期(AD3VSAD2)、腺癌VS腺瘤(AD4VSAD3),我們發(fā)現(xiàn)在小鼠結(jié)腸炎癌轉(zhuǎn)...
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市211工程院校985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:223 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1.?AOM-DSS小鼠模型的建立??
6.小鼠結(jié)腸全基因組表達(dá)譜巧片實(shí)驗(yàn)??使用的試劑盆為?Whole?Mouse?Genome?Microarray?Kit,?4?X44K?(Agilent,??G4122F)。??(1)取?RNAlOOng,使其體積為?2.5ul,與?2ulspik:e3?和?0.8ulT7primer'混合,總體??積為5.3ul,?65。仁水。欤希恚椋睿糜诒喜簧儆冢担恚椋;??(2)每管中分別加入?2ul?5XFS?bu帶r,lul?0.1M?的?DTT,0.5ul?dNTPs?和?1.2ul??A街script,共4.7ul,使管中總、體積為lOul,?40°C水洛2hr,?70°C水裕15min;??(3)避光標(biāo)記,分別加入民Nase-freewater0.:75ul,5XTB3?2ul,DTT0.6uI,NTPs??lul,?T7polymerase?0.21?ul?和?Cy3?0.24ul,共?6ul,4°C水洛?2hr,置于冰上不少于?5min;??(4)分別加入RNase-斤ee?water?84ul,?RLT350ul,無(wú)水乙醇250ul,使終體積為700ul,??上柱,4T:離也,13000rpmX30sec;丟棄收集管,將柱子置于新的收集管中,加入??RPE500U1,41:離也,13000rpmXlmin;棄濾液,4X:空轉(zhuǎn),13000rpmX30sec;棄??收集管,將柱子置于1.5mlEp管中,加入30ul?RNase-free?water,?4°C離必,13000rpm??X30?60sec,收集cRNA,定量;??(5)。保叮担酰纾悖遥危粒尤胂鄳(yīng)體積的RNase-ftee?water,使體積為41.8ul;分別
中均未見(jiàn)明思異常(表1-1)。HE染色的病理診斷巧果顯示,小鼠結(jié)腸從AD1期的??急性炎痛恢復(fù)期發(fā)展為AD2期的輕度不典型增生巧,再發(fā)展到AD3的中、重度不??典型增生或腺瘤階段(圖1-3)。這一系列序貫的改變,與人類結(jié)腸炎相關(guān)結(jié)腸癌發(fā)??生的生理病理過(guò)程類似。因此,AOM-DSS模型能有效模巧人的結(jié)版炎相關(guān)結(jié)腸癌??的發(fā)病過(guò)程。???表1-1.?AOM-DSS模型中各組小鼠的造模結(jié)果分析???組別?數(shù)目?死f:率(%)?成煙率(%)?病理診斷??.??Con?(NaiVe)組?8?0?0?正常??AOMonly?組?5?0?0?正常??DSSonly組?8?12.5(1巧)?0?慢性炎癥??AD3組?20?15。。0)?94.12?(腦7)?中、重度不典型増生或腺瘤??Hm ̄??職哪■??圖1-3.各組HE染色結(jié)果??21??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Pathogenesis of Crohn’s disease: Bug or no bug[J]. Marta Maia Bosca-Watts,Joan Tosca,Rosario Anton,Maria Mora,Miguel Minguez,Francisco Mora. World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology. 2015(01)
[2]MicroRNAs as novel predictive biomarkers and therapeutic targets in colorectal cancer[J]. Verena Stiegelbauer,Samantha Perakis,Alexander Deutsch,Hui Ling,Armin Gerger,Martin Pichler. World Journal of Gastroenterology. 2014(33)
[3]Role of microRNAs in the immune system,inflammation and cancer[J]. Jennifer Raisch,Arlette Darfeuille-Michaud,Hang Thi Thu Nguyen. World Journal of Gastroenterology. 2013(20)
本文編號(hào):3620777
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市211工程院校985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:223 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1.?AOM-DSS小鼠模型的建立??
6.小鼠結(jié)腸全基因組表達(dá)譜巧片實(shí)驗(yàn)??使用的試劑盆為?Whole?Mouse?Genome?Microarray?Kit,?4?X44K?(Agilent,??G4122F)。??(1)取?RNAlOOng,使其體積為?2.5ul,與?2ulspik:e3?和?0.8ulT7primer'混合,總體??積為5.3ul,?65。仁水。欤希恚椋睿糜诒喜簧儆冢担恚椋;??(2)每管中分別加入?2ul?5XFS?bu帶r,lul?0.1M?的?DTT,0.5ul?dNTPs?和?1.2ul??A街script,共4.7ul,使管中總、體積為lOul,?40°C水洛2hr,?70°C水裕15min;??(3)避光標(biāo)記,分別加入民Nase-freewater0.:75ul,5XTB3?2ul,DTT0.6uI,NTPs??lul,?T7polymerase?0.21?ul?和?Cy3?0.24ul,共?6ul,4°C水洛?2hr,置于冰上不少于?5min;??(4)分別加入RNase-斤ee?water?84ul,?RLT350ul,無(wú)水乙醇250ul,使終體積為700ul,??上柱,4T:離也,13000rpmX30sec;丟棄收集管,將柱子置于新的收集管中,加入??RPE500U1,41:離也,13000rpmXlmin;棄濾液,4X:空轉(zhuǎn),13000rpmX30sec;棄??收集管,將柱子置于1.5mlEp管中,加入30ul?RNase-free?water,?4°C離必,13000rpm??X30?60sec,收集cRNA,定量;??(5)。保叮担酰纾悖遥危粒尤胂鄳(yīng)體積的RNase-ftee?water,使體積為41.8ul;分別
中均未見(jiàn)明思異常(表1-1)。HE染色的病理診斷巧果顯示,小鼠結(jié)腸從AD1期的??急性炎痛恢復(fù)期發(fā)展為AD2期的輕度不典型增生巧,再發(fā)展到AD3的中、重度不??典型增生或腺瘤階段(圖1-3)。這一系列序貫的改變,與人類結(jié)腸炎相關(guān)結(jié)腸癌發(fā)??生的生理病理過(guò)程類似。因此,AOM-DSS模型能有效模巧人的結(jié)版炎相關(guān)結(jié)腸癌??的發(fā)病過(guò)程。???表1-1.?AOM-DSS模型中各組小鼠的造模結(jié)果分析???組別?數(shù)目?死f:率(%)?成煙率(%)?病理診斷??.??Con?(NaiVe)組?8?0?0?正常??AOMonly?組?5?0?0?正常??DSSonly組?8?12.5(1巧)?0?慢性炎癥??AD3組?20?15。。0)?94.12?(腦7)?中、重度不典型増生或腺瘤??Hm ̄??職哪■??圖1-3.各組HE染色結(jié)果??21??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Pathogenesis of Crohn’s disease: Bug or no bug[J]. Marta Maia Bosca-Watts,Joan Tosca,Rosario Anton,Maria Mora,Miguel Minguez,Francisco Mora. World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology. 2015(01)
[2]MicroRNAs as novel predictive biomarkers and therapeutic targets in colorectal cancer[J]. Verena Stiegelbauer,Samantha Perakis,Alexander Deutsch,Hui Ling,Armin Gerger,Martin Pichler. World Journal of Gastroenterology. 2014(33)
[3]Role of microRNAs in the immune system,inflammation and cancer[J]. Jennifer Raisch,Arlette Darfeuille-Michaud,Hang Thi Thu Nguyen. World Journal of Gastroenterology. 2013(20)
本文編號(hào):3620777
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