目的了解東南亞十二節(jié)段雙鏈RNA病毒（South-East Asian dodeca RNA viruses,Seadornavirus）的分子進(jìn)化規(guī)律及遺傳差異。方法基于Seadornavirus衣殼蛋白基因組序列進(jìn)行同源性、系統(tǒng)進(jìn)化、理化性質(zhì)、抗原表位預(yù)測(cè)以及三級(jí)結(jié)構(gòu)和表面電荷分布的分析。結(jié)果 Seadornavirus的最近共同祖先大約于2 359年前,分為3個(gè)進(jìn)化簇,其進(jìn)化時(shí)間分別為約距今1 338、499、253年前,其平均核苷酸替換率為3.6×10-4n/s/y。Seadornavirus 3種病毒之間的核苷酸與氨基酸同源性分別是31.3%～100%（μ=68.0%）和11.9%～100%（μ=56.0%）。理化性質(zhì)和抗原表位分析顯示,版納病毒（Banna virus, BAV）衣殼蛋白為酸性疏水性蛋白質(zhì),存在6個(gè)B細(xì)胞表位和2個(gè)Th抗原表位,而遼寧病毒（Liaoning virus, LNV）和卡迪皮諾病毒（Kadipiro virus, KDV）為堿性親水性蛋白質(zhì),分別存在3和5個(gè)B細(xì)胞抗原表位,其中LNV僅有1個(gè)Th抗原表位,KDV病毒則不存在。三級(jí)結(jié)構(gòu)以及蛋白表面電... 

【文章來源】：中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志. 2020,34(03)CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3619816