本文關(guān)鍵詞：面向疾病分類的人類互作網(wǎng)絡(luò)拓?fù)淠K的功能同質(zhì)性分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：鑒于網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)中尚未有對疾病分類與功能蛋白模塊功能同質(zhì)性分析之間關(guān)系的研究,展開以下研究工作:首先,利用Mesh、String9等數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)構(gòu)建了基因關(guān)系網(wǎng)絡(luò);其次,采用基于優(yōu)化模塊度的模塊劃分方法(如BGLL、非負(fù)矩陣分解(NMF)等聚類算法)對基因關(guān)系網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了劃分;再次,對劃分出來的模塊進(jìn)行了GO富集分析,通過對高致病拓?fù)淠K和低致病拓?fù)淠K的GO富集分析的比較,發(fā)現(xiàn)了疾病分類和蛋白模塊功能特性在生物過程、細(xì)胞組分、分子功能等方面存在重要的生物學(xué)提示;最后,分析了疾病分類的拓?fù)淠K的功能特性,通過對網(wǎng)絡(luò)拓?fù)湫再|(zhì)如平均度、密度、平均最短路徑長度等方面的分析得到了各模塊的功能特點(diǎn)數(shù)據(jù),進(jìn)一步揭示了疾病分類和功能模塊之間的相關(guān)關(guān)系。
【作者單位】： 北京交通大學(xué)計(jì)算機(jī)與信息技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué) 疾病分類 GO富集分析 蛋白功能模塊 拓?fù)淠K Mesh String
【分類號】：R-05;O157.5
【正文快照】： 0引言近年來,隨著復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用逐步廣泛,網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)為疾病分子層面的研究提供了平臺。隨著遺傳學(xué)和基因組學(xué)的進(jìn)步和發(fā)展,高通量蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)的產(chǎn)生推進(jìn)了疾病和致病基因之間的關(guān)聯(lián)研究。由于人類細(xì)胞內(nèi)的分子組件間在功能上具有相互依賴性,所以很少有疾

【相似文獻(xiàn)】

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 王惠欣;面向疾病分類的人類互作網(wǎng)絡(luò)拓?fù)淠K的功能同質(zhì)性分析[D];北京交通大學(xué);2015年

  本文關(guān)鍵詞：面向疾病分類的人類互作網(wǎng)絡(luò)拓?fù)淠K的功能同質(zhì)性分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

，

本文編號：348498