流行病學(xué)顯示,骨質(zhì)疏松與初潮年齡存在表型相關(guān)和遺傳相關(guān),它們可能共享相同的遺傳風(fēng)險(xiǎn)因子,但是到目前為止只有很少的多效基因被報(bào)道。本研究運(yùn)用條件錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(cFDR)方法分析腰椎骨密度(LS BMD)、前臂骨密度(FA BMD)和股骨頸骨密度(FN BMD)全基因組關(guān)聯(lián)(GWAS)數(shù)據(jù)與初潮年齡的GWAS數(shù)據(jù),鑒定骨質(zhì)疏松和初潮年齡的共享多效遺傳位點(diǎn)和基因。通過(guò)分層條件Q-Q圖來(lái)評(píng)估骨質(zhì)疏松和初潮年齡之間的多效基因富集情況,結(jié)果顯示FA BMD、FN BMD、LS BMD和AAM之間存在多效富集現(xiàn)象。當(dāng)分別以FA BMD、FN BMD、LS BMD為條件性狀時(shí),分別鑒定出1203、1197、1195個(gè)變異位點(diǎn)與AAM關(guān)聯(lián);當(dāng)以AAM為條件性狀時(shí),分別鑒定到3個(gè)位點(diǎn)與FA BMD關(guān)聯(lián)、21個(gè)位點(diǎn)與FN BMD關(guān)聯(lián)、24個(gè)位點(diǎn)與LS BMD關(guān)聯(lián)(cFDR<0.05)。聯(lián)合cFDR分析發(fā)現(xiàn),5個(gè)位點(diǎn)同時(shí)與骨質(zhì)疏松和初潮年齡關(guān)聯(lián)(ccFDR<0.05),分別是CCDC170 rs12197879、ATE1 rs2420970、SMAD3 rs7173811、TRPC7rs889012...

【文章來(lái)源】： 湖南師范大學(xué)湖南省 211工程院校

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【文章目錄】：
中文摘要
ABSTRACT
1.文獻(xiàn)綜述
    1.1 引言
    1.2 復(fù)雜疾病和多效基因
    1.3 骨質(zhì)疏松
        1.3.1 骨質(zhì)疏松的定義和影響因素
        1.3.2 如何診斷骨質(zhì)疏松以及骨質(zhì)疏松的危害
        1.3.3 與骨質(zhì)疏松相關(guān)的候選基因
    1.4 初潮年齡
    1.5 骨質(zhì)疏松和初潮年齡相關(guān)性研究
2.材料與方法
    2.1 樣本
    2.2 統(tǒng)計(jì)分析
        2.2.1 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
        2.2.2 分層條件Q-Q圖評(píng)估AAM和 BMD之間的多效富集情況·
        2.2.3 錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率
        2.2.4 cFDR(Conditional FDR):鑒定與一個(gè)性狀相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)
        2.2.5 ccFDR(conjunction cFDR)：鑒定多效位點(diǎn)
        2.2.6 曼哈頓圖的繪制
        2.2.7 蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)和eQTL分析
        2.2.8 雙性狀的精細(xì)定位
        2.2.9 RegulomeDB評(píng)分
3.結(jié)果與分析
    3.1 初潮年齡與BMD各表型之間的分層條件Q-Q圖
    3.2 cFDR鑒定的與AAM相關(guān)聯(lián)的遺傳位點(diǎn)
    3.3 cFDR鑒定的與BMD相關(guān)聯(lián)的遺傳位點(diǎn)
    3.4 AAM與OP之間的多效基因位點(diǎn)、蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)結(jié)果和eQTL分析結(jié)果
    3.5 精細(xì)定位、RegulomeDB評(píng)分和HaploReg分析結(jié)果
4.討論
論文結(jié)論和創(chuàng)新性
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3481051