紅鰭東方鲀SIRT3基因的功能研究
發(fā)布時間:2021-10-24 18:10
背景Sirtuins家族是賴NAD+依組蛋白去乙;讣易宓牡冖箢惾ヒ阴;,在細(xì)胞活動的很多方面都有重要的作用。去乙;3(SIRT3)是主要的線粒體內(nèi)的去乙;,去乙酰化酶能使許多氧化通路活化,從而在細(xì)胞的主要代謝中發(fā)揮作用。SIRT3能夠參與線粒體蛋白的表達(dá)與激活,降低氧化應(yīng)激作用產(chǎn)生的ROS水平,其缺失會導(dǎo)致代謝異常,并引起氧化應(yīng)激反應(yīng)和一系列與衰老相關(guān)的病理癥狀。這可能為臨床上相關(guān)疾病的研究提供重要靶點。在實驗中當(dāng)老鼠血液干細(xì)胞灌輸SIRT3,將再生形成新的血液細(xì)胞,呈現(xiàn)細(xì)胞功能性衰老退化的逆轉(zhuǎn)現(xiàn)象。紅鰭東方鲀是具有最小基因組大小的脊椎動物,但基因數(shù)目卻與人相近,外顯子/內(nèi)含子、啟動子等調(diào)控區(qū)域也是非常保守,也是常用的模式生物之一。因此,在本研究我們擬獲得SIRT3的重組蛋白,為進(jìn)一步在動物試驗中研究代謝性相關(guān)疾病及抗衰老等功能研究提供可靠的基礎(chǔ)材料。目的獲得紅鰭東方鲀SIRT3基因的序列,并與哺乳動物的SIRT3進(jìn)行生物信息學(xué)分析。構(gòu)建了SIRT3基因的原核表達(dá)載體并進(jìn)行蛋白的表達(dá)及純化,為進(jìn)一步在活體上研究SIRT3抗衰老等功能奠定基礎(chǔ)。方法1.采集紅鰭東方鲀肝臟組織...
【文章來源】:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院河南省
【文章頁數(shù)】:46 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
紅鰭東方鲀SIRT3基因RT-PCR擴增電泳圖譜
19一致的、高保守度的和低保守度的氨基酸序列分別用“*”“:”“.”標(biāo)出;KIV、GIP基序用方框標(biāo)明圖2 紅鰭東方鲀與其他物種SIRT3的氨基酸比對表 1 紅鰭東方鲀與其他物種 SIRT3 的同源性物種 同源性% 氨基酸序列號大黃魚(Larimichthys crocea) 78.3 XP_010752299.1尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus) 76.5 XP_005470975.1梭子魚 (Esox lucius) 73.8 XP_010888638.1半滑舌鰨 (Cynoglossus semilaevis) 69.5 XP_008310223
及人的同源性分別為78.3%、76.5%、73.8%、69.5%、55.1%、55.1%、49.5%、49.4%、48.0%、47.1%及46.6%(表1)。利用Mega5.0構(gòu)建NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖3)發(fā)現(xiàn):分子進(jìn)化利分為兩支,一支為魚類的,另一支為非洲爪蟾和哺乳動物類。魚類這支首先紅鰭東方鲀SIRT3與大黃魚及梭子魚聚為一小支然后再與半滑舌鰨及尼羅羅非魚構(gòu)成一分支。故紅鰭東方鲀SIRT3與大黃魚、梭子魚的親緣性最為親密,與哺乳動物及非洲爪蟾的親緣性較為疏遠(yuǎn)。圖3 紅鰭東方鲀SIRT3與其他生物的系統(tǒng)進(jìn)化樹2.1.3 紅鰭東方鲀SIRT3蛋白的親/疏水性分析圖4 紅鰭東方鲀SIRT3基因編碼蛋白的親/疏水性分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Sirtuin蛋白家族和糖脂代謝[J]. 周犇,翟琦巍. 生命科學(xué). 2013(02)
[2]Sirt3在心肌保護方面的研究進(jìn)展[J]. 鄔云斌,劉新偉,劉玲. 臨床麻醉學(xué)雜志. 2012(10)
[3]SirT3調(diào)節(jié)氧化應(yīng)激作用[J]. 王國恩,翟羽佳,何蓉蓉,栗原博. 中國藥理學(xué)通報. 2012(10)
[4]SIRT3抗癌變作用的研究進(jìn)展[J]. 陳鳳華,樊飛躍. 中華腫瘤防治雜志. 2012(15)
[5]紅鰭東方鲀Sirt1基因的克隆及其原核表達(dá)[J]. 張偉,楊志軍,王群,渡部終五. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(08)
[6]Sirtuin:依賴NAD+的去乙;竅J]. 霍曉芳,張俊武. 生命的化學(xué). 2005(03)
[7]河鲀魚綜合利用研究初探[J]. 林連升,彭珊,繆為民. 北京水產(chǎn). 2005(01)
[8]河豚魚與人類基因組計劃[J]. 周巍,楊煥明,劉國仰. 遺傳. 1997(06)
[9]21世紀(jì)醫(yī)學(xué)、生物學(xué)的藍(lán)圖──人類基因組計劃[J]. 楊煥明. 科技導(dǎo)報. 1996(09)
碩士論文
[1]河豚魚肝腎蛋白組技術(shù)體系的建立及蛋白表達(dá)譜初步分析[D]. 鄭建洲.江蘇大學(xué) 2010
本文編號:3455739
【文章來源】:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院河南省
【文章頁數(shù)】:46 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
紅鰭東方鲀SIRT3基因RT-PCR擴增電泳圖譜
19一致的、高保守度的和低保守度的氨基酸序列分別用“*”“:”“.”標(biāo)出;KIV、GIP基序用方框標(biāo)明圖2 紅鰭東方鲀與其他物種SIRT3的氨基酸比對表 1 紅鰭東方鲀與其他物種 SIRT3 的同源性物種 同源性% 氨基酸序列號大黃魚(Larimichthys crocea) 78.3 XP_010752299.1尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus) 76.5 XP_005470975.1梭子魚 (Esox lucius) 73.8 XP_010888638.1半滑舌鰨 (Cynoglossus semilaevis) 69.5 XP_008310223
及人的同源性分別為78.3%、76.5%、73.8%、69.5%、55.1%、55.1%、49.5%、49.4%、48.0%、47.1%及46.6%(表1)。利用Mega5.0構(gòu)建NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖3)發(fā)現(xiàn):分子進(jìn)化利分為兩支,一支為魚類的,另一支為非洲爪蟾和哺乳動物類。魚類這支首先紅鰭東方鲀SIRT3與大黃魚及梭子魚聚為一小支然后再與半滑舌鰨及尼羅羅非魚構(gòu)成一分支。故紅鰭東方鲀SIRT3與大黃魚、梭子魚的親緣性最為親密,與哺乳動物及非洲爪蟾的親緣性較為疏遠(yuǎn)。圖3 紅鰭東方鲀SIRT3與其他生物的系統(tǒng)進(jìn)化樹2.1.3 紅鰭東方鲀SIRT3蛋白的親/疏水性分析圖4 紅鰭東方鲀SIRT3基因編碼蛋白的親/疏水性分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Sirtuin蛋白家族和糖脂代謝[J]. 周犇,翟琦巍. 生命科學(xué). 2013(02)
[2]Sirt3在心肌保護方面的研究進(jìn)展[J]. 鄔云斌,劉新偉,劉玲. 臨床麻醉學(xué)雜志. 2012(10)
[3]SirT3調(diào)節(jié)氧化應(yīng)激作用[J]. 王國恩,翟羽佳,何蓉蓉,栗原博. 中國藥理學(xué)通報. 2012(10)
[4]SIRT3抗癌變作用的研究進(jìn)展[J]. 陳鳳華,樊飛躍. 中華腫瘤防治雜志. 2012(15)
[5]紅鰭東方鲀Sirt1基因的克隆及其原核表達(dá)[J]. 張偉,楊志軍,王群,渡部終五. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(08)
[6]Sirtuin:依賴NAD+的去乙;竅J]. 霍曉芳,張俊武. 生命的化學(xué). 2005(03)
[7]河鲀魚綜合利用研究初探[J]. 林連升,彭珊,繆為民. 北京水產(chǎn). 2005(01)
[8]河豚魚與人類基因組計劃[J]. 周巍,楊煥明,劉國仰. 遺傳. 1997(06)
[9]21世紀(jì)醫(yī)學(xué)、生物學(xué)的藍(lán)圖──人類基因組計劃[J]. 楊煥明. 科技導(dǎo)報. 1996(09)
碩士論文
[1]河豚魚肝腎蛋白組技術(shù)體系的建立及蛋白表達(dá)譜初步分析[D]. 鄭建洲.江蘇大學(xué) 2010
本文編號:3455739
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