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青藏高原藏羚羊糞便中兩個(gè)細(xì)菌新種的分類鑒定和基因組分析

發(fā)布時(shí)間:2021-08-28 05:41
  目的許多野生動(dòng)物是重要人類傳染病病原體的自然宿主,尤其是分布在高原和熱帶等特殊環(huán)境和氣候條件的野生動(dòng)物,可能攜帶和傳播已知和未知病原體。這些病原體一旦接觸并感染人類,可能引起新發(fā)傳染病,造成重大公共衛(wèi)生事件。青藏高原藏羚羊糞便標(biāo)本中含有大量的細(xì)菌新種和未培養(yǎng)的細(xì)菌類群,本課題利用培養(yǎng)組學(xué)的思路設(shè)計(jì)培養(yǎng)方案,對(duì)藏羚羊糞便標(biāo)本中含有的未知細(xì)菌和病原體進(jìn)行分離和鑒定,這有助于擴(kuò)寬我們對(duì)青藏高原野生動(dòng)物糞便(腸道)菌群多樣性的研究,還為應(yīng)對(duì)、預(yù)防控制未來可能發(fā)生的新傳染病提供科學(xué)依據(jù)。方法(1)借鑒培養(yǎng)組學(xué)的方法,通過多組合方式設(shè)計(jì)72種培養(yǎng)條件對(duì)2014年5月13至15日采集于青海可可西里國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)的104份藏羚羊糞便進(jìn)行細(xì)菌分離培養(yǎng)。根據(jù)菌落形態(tài)多樣性原則(菌落顏色,大小,質(zhì)地,邊緣狀況等)進(jìn)行單菌落的挑取和傳代純化。細(xì)菌分離株基因組核酸制備后,擴(kuò)增16S rRNA基因和進(jìn)行序列測(cè)定。通過GeneBank和EzTaxon數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)獲得的菌株16S rRNA基因序列進(jìn)行比對(duì),完成菌株初步鑒定。根據(jù)以上結(jié)果,按照菌株多樣性原則進(jìn)行菌株甘油管的長(zhǎng)期保存。(2)根據(jù)菌株初步鑒定結(jié)果,對(duì)所分離的... 

【文章來源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】:131 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

青藏高原藏羚羊糞便中兩個(gè)細(xì)菌新種的分類鑒定和基因組分析


藏羚羊糞便中分離菌株的分類學(xué)分析

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圖 1-2. 藏羚羊糞便中可培養(yǎng)細(xì)菌屬水平分析Figure 1-2. The genus analysis of cultured strains isolated from the feces of Tibetan antelope如圖 1-3 所示,根據(jù) 16S rRNA 基因序列和數(shù)據(jù)庫(kù)多條序列的 16S rRNA 基因序列的一致性低于 98.7%,有 67 株菌鑒定為疑似細(xì)菌新種,包含 21 個(gè)菌種 , 隸 屬 于 14 個(gè) 菌 屬 ( Cellulomonas, Georgenia, Microbacterium,Mycobacterium, Nocardioides, Rhodococcus, Bacillus, Paraliobacillus,Streptococcus, Devosia, Pseudescherichia, Nevskia, Roseomonas, Shimwellia)。其中有 28 株菌可能具有醫(yī)學(xué)意義,可分為 6 個(gè)菌種,4 個(gè)菌屬(Streptococcus,Mycobacterium, Rhodococcus 和 Roseomonas)。

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圖 1-3. 藏羚羊糞便分離的疑似細(xì)菌新種Figure 1-3. The potential new species isolated from the feces of Tibetan antelope.發(fā)現(xiàn)和命名侯云德類諾卡氏菌.1 菌株分離類諾卡氏菌屬(Nocardioides)是一類進(jìn)化相近、形態(tài)相似的放線菌。分類學(xué)地位屬于放線菌門,放線菌綱,放線菌目,丙酸桿菌亞目,類諾氏菌科,是類諾卡氏菌科中的典型屬。本次研究我們從兩份不同地理位(經(jīng)緯度為:35°21 55.7″N/93°26 38″E 和 35°30 0″N/93°51 35.9″E)采集藏羚羊糞便樣本中,取 1g 樣本加 200μL 無菌水稀釋并涂布于 BHI-5%脫

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]藏羚羊種群資源及其保護(hù)[J]. 吳曉民,張洪峰.  自然雜志. 2011(03)
[2]東祁連山不同高寒草地類型土壤表層碳、氮、磷密度特征[J]. 楊成德,龍瑞軍,陳秀蓉,徐長(zhǎng)林,王進(jìn)明.  中國(guó)草地學(xué)報(bào). 2008(01)
[3]青藏高原喜馬拉雅旱獺鼠疫疫源地簡(jiǎn)介[J]. 朱錦沁,李超,慕有.  地方病通報(bào). 1996(03)
[4]微生物數(shù)值分類法簡(jiǎn)介[J]. 徐浩.  微生物學(xué)通報(bào). 1974(03)



本文編號(hào):3367914

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