副溶血弧菌擬核相關(guān)蛋白H-NS間接抑制VP1687-1686的啟動子區(qū)轉(zhuǎn)錄
發(fā)布時(shí)間:2021-07-09 08:15
為了探討副溶血弧菌擬核相關(guān)蛋白H-NS對Ⅲ型分泌系統(tǒng)(T3SS) VP1687-1686基因位點(diǎn)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,本研究提取副溶血弧菌hns突變株(Δhns)和野生株(WT)的總RNA,采用引物延伸實(shí)驗(yàn)研究靶基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),并根據(jù)產(chǎn)物的豐度判斷H-NS對靶基因的調(diào)控關(guān)系;采用實(shí)時(shí)定量RT-PCR研究靶基因mRNA在WT和Δhns中轉(zhuǎn)錄豐度,以判定H-NS對靶基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控關(guān)系;將靶基因啟動子區(qū)域DNA序列克隆至lacZ基因上游,將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入WT和Δhns中,得到相應(yīng)的LacZ菌株,通過LacZ報(bào)告基因融合實(shí)驗(yàn)研究H-NS對靶基因的調(diào)控關(guān)系;用PCR擴(kuò)增靶基因的啟動子區(qū)DNA序列,并純化His-H-NS蛋白,通過凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)(EMSA)研究His-H-NS是否對靶基因啟動子區(qū)具有直接的結(jié)合作用。研究結(jié)果顯示,T3SS的VP1687-1686只含有一個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),位于翻譯起始位點(diǎn)上游82 bp處,且H-NS能夠抑制其轉(zhuǎn)錄活性,但不能直接結(jié)合到VP1687-1686區(qū)的啟動子區(qū)。另外,H-NS對calR的轉(zhuǎn)錄無調(diào)控作用,His-H-NS也不能結(jié)合到其啟動子區(qū)。本研究的結(jié)果初步說明,H-NS...
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
FGF/FGFR信號通路
H-NS抑制VP1687的轉(zhuǎn)錄
首先采用引物延伸實(shí)驗(yàn)研究H-NS對calR基因的調(diào)控關(guān)系,結(jié)果顯示calR的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)為T,位于起始密碼子ATG上游156 bp,且WT和Δhns中calR基因的mRNA表達(dá)量沒有差異(圖3A)。然后利用qRT-PCR研究calR基因的m RNA在WT和Δhns中轉(zhuǎn)錄豐度,qRT-PCR鑒定結(jié)果顯示(圖3B):WT和Δhns中VP1687 m RNA豐度沒有明顯差異,表明H-NS不調(diào)控calR基因的轉(zhuǎn)錄,此結(jié)果與引物延伸結(jié)果一致。進(jìn)一步在體外進(jìn)行的Lac Z報(bào)告基因融合實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:Δhns中測得的β-半乳糖苷酶活性與WT基本相同,無顯著性差異(圖3C),這同樣說明H-NS不調(diào)控calR基因的轉(zhuǎn)錄。最后利用EMSA實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證H-NS是否對calR的啟動子區(qū)DNA具有直接的結(jié)合作用,結(jié)果顯示H-NS不與calR基因的啟動子區(qū)結(jié)合(圖3D)。綜合上述結(jié)果:H-NS不調(diào)控calR的轉(zhuǎn)錄,也不能結(jié)合到calR的啟動區(qū),表明H-NS不能通過調(diào)控calR的轉(zhuǎn)錄來調(diào)控T3SS1的表達(dá)。
本文編號:3273380
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
FGF/FGFR信號通路
H-NS抑制VP1687的轉(zhuǎn)錄
首先采用引物延伸實(shí)驗(yàn)研究H-NS對calR基因的調(diào)控關(guān)系,結(jié)果顯示calR的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)為T,位于起始密碼子ATG上游156 bp,且WT和Δhns中calR基因的mRNA表達(dá)量沒有差異(圖3A)。然后利用qRT-PCR研究calR基因的m RNA在WT和Δhns中轉(zhuǎn)錄豐度,qRT-PCR鑒定結(jié)果顯示(圖3B):WT和Δhns中VP1687 m RNA豐度沒有明顯差異,表明H-NS不調(diào)控calR基因的轉(zhuǎn)錄,此結(jié)果與引物延伸結(jié)果一致。進(jìn)一步在體外進(jìn)行的Lac Z報(bào)告基因融合實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:Δhns中測得的β-半乳糖苷酶活性與WT基本相同,無顯著性差異(圖3C),這同樣說明H-NS不調(diào)控calR基因的轉(zhuǎn)錄。最后利用EMSA實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證H-NS是否對calR的啟動子區(qū)DNA具有直接的結(jié)合作用,結(jié)果顯示H-NS不與calR基因的啟動子區(qū)結(jié)合(圖3D)。綜合上述結(jié)果:H-NS不調(diào)控calR的轉(zhuǎn)錄,也不能結(jié)合到calR的啟動區(qū),表明H-NS不能通過調(diào)控calR的轉(zhuǎn)錄來調(diào)控T3SS1的表達(dá)。
本文編號:3273380
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/jichuyixue/3273380.html
最近更新
教材專著