目的探討淡色庫蚊溴氰菊酯敏感品系與抗性種群成蚊腸道菌群多樣性和組成結(jié)構(gòu)。方法分離淡色庫蚊溴氰菊酯敏感品系與抗性種群成蚊腸道并提取總基因組DNA,對(duì)敏感品系與抗性種群成蚊腸道菌群16S rDNA基因的V3+V4區(qū)進(jìn)行測(cè)序,分析其物種組成結(jié)構(gòu)、菌群多樣性及相對(duì)豐度;通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-qPCR)技術(shù)驗(yàn)證細(xì)菌相對(duì)豐度以檢測(cè)測(cè)序數(shù)據(jù)的可靠性。結(jié)果通過優(yōu)化剪切得到216 022條有效序列,根據(jù)序列相似性進(jìn)行聚類分析共獲取766個(gè)操作分類單元,分別注釋到31個(gè)門,62個(gè)綱,132個(gè)目,215個(gè)科和339個(gè)屬。樣本覆蓋度均接近99%,表明測(cè)序量基本覆蓋所有細(xì)菌物種。敏感品系的Chao1指數(shù)、香農(nóng)指數(shù)和辛普森指數(shù)分別為374.53±40.27、2.56±0.59和0.36±0.11,抗性種群分別為201.58±29.34、1.14±0.13和0.55±0.07。淡色庫蚊敏感品系與抗性種群腸道菌群均以變形菌門和厚壁菌門居多;在目分類水平上,敏感品系的優(yōu)勢(shì)菌目分別為紅螺菌目、腸桿菌目及伯克霍爾德氏菌目,而抗性種群的優(yōu)勢(shì)菌目為紅螺菌目、氣單胞菌目及乳酸桿菌目;在屬分類水平上,敏感品系的優(yōu)勢(shì)菌屬為未...

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圖1淡色庫蚊敏感品系與抗性種群腸道的OTUs分布維恩圖

通過IlluminaMiSeq高通量測(cè)序?qū)γ舾衅废蹬c抗性種群腸道細(xì)菌16SrDNA基因V3+V4可變區(qū)進(jìn)行測(cè)序分析，共產(chǎn)生435843條原始序列，經(jīng)過兩端序列拼接優(yōu)化后得到216022條有效序列。樣本中99.99%的序列在400～600bp之間，平均長(zhǎng)度為429b....

圖2稀釋曲線和Rank-abundance曲線

通過隨機(jī)抽取測(cè)序序列與其所代表的OTU數(shù)目繪制稀釋曲線來分析測(cè)序數(shù)據(jù)的飽和程度（圖2），結(jié)果顯示，隨著測(cè)序深度加深，敏感品系腸道測(cè)序的稀釋曲線趨于平緩并接近飽和，表明獲得的測(cè)序量能夠客觀反映敏感品系腸道的所有細(xì)菌類群；抗性種群的稀釋曲線在97%相似水平下曲線斜率逐漸降低，但尚未完....

圖3非度量多維標(biāo)度（NMDS）圖

圖2稀釋曲線和Rank-abundance曲線2.3敏感品系與抗性種群腸道菌群的種類組成及相對(duì)豐度

圖4敏感品系與抗性種群腸道菌群相對(duì)豐度

在目分類階元水平上（圖4B），敏感品系中腸道菌群相對(duì)豐度最高的前3位依次為紅螺菌目（Rhodospirillales）、腸桿菌目（Enterobacteriles）及伯克霍爾德氏菌目（Burkholderiales），其相對(duì)豐度分別為（65.92±8.94）%、（3.20±1.1....

本文編號(hào)：3997305