小鼠高糖記憶模型中足細(xì)胞向上皮間質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)化的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-21 04:59
目的探討小鼠高糖記憶模型中足細(xì)胞向上皮間質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)化(EMT)的機(jī)制。方法將小鼠腎小球足細(xì)胞分為4組:正糖組(5.5 mmol/L D-葡萄糖)、高糖組(30 mmol/L D-葡萄糖)、記憶組(先30 mmol/L D-葡萄糖,后5.5 mmol/L D-葡萄糖)、滲透壓組(5.5 mmol/LD-葡萄糖+24.5 mmol/L甘露醇),除記憶組作用96 h外,其余組均作用48 h。Western blotting及免疫熒光檢測各組足細(xì)胞EMT指標(biāo)腎病蛋白(Nephrin)及α-平滑肌肌動(dòng)蛋白(α-SMA)的表達(dá)。采用Illumina HiSeq 2000進(jìn)行正糖組、高糖組及記憶組的轉(zhuǎn)錄組測序,DESeq鑒定差異表達(dá)基因,并對差異表達(dá)基因進(jìn)行GO及KEGG富集分析。最后采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測差異表達(dá)基因的表達(dá)。結(jié)果與正糖組相比,Western blotting與免疫熒光檢測均顯示高糖組與記憶組的足細(xì)胞Nephrin表達(dá)減少、α-SMA表達(dá)增加(P<0.05),而滲透壓組與正糖組,記憶組與高糖組足細(xì)胞Nephrin、α-SMA的表達(dá)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。RNA...
【文章來源】:解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2020,45(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【圖文】:
小鼠足細(xì)胞實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測差異基因的表達(dá)
分別抽提正糖組、高糖組及記憶組的足細(xì)胞RNA,并行轉(zhuǎn)錄組測序。熱圖反映了差異表達(dá)基因及樣本的垂直聚類結(jié)果,紅色代表上調(diào),綠色為下調(diào)(圖3)。與正糖組相比,高糖組共有194個(gè)基因存在差異表達(dá),其中119個(gè)上調(diào),75個(gè)下調(diào)(圖4A),記憶組共有532個(gè)基因存在差異表達(dá),其中316個(gè)上調(diào),216個(gè)下調(diào)(圖4B)。因高糖記憶的分子本質(zhì)系高糖誘導(dǎo)的細(xì)胞基因表達(dá)異常,在血糖正常后仍然持續(xù)存在,故對上述兩組差異表達(dá)的基因進(jìn)行再分析,發(fā)現(xiàn)108個(gè)基因(35個(gè)上調(diào),73個(gè)下調(diào))在高糖組及記憶組存在相似的表達(dá)規(guī)律,并將這些基因稱為共有差異表達(dá)基因。圖2 各組小鼠足細(xì)胞Nephrin蛋白(A)及α-SMA蛋白(B)的免疫熒光染色(×400)
各組小鼠足細(xì)胞Nephrin蛋白(A)及α-SMA蛋白(B)的免疫熒光染色(×400)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]地塞米松對內(nèi)毒素誘導(dǎo)的小鼠葡萄膜炎的治療效果及轉(zhuǎn)錄組分析(英文)[J]. 余鵬,邱一果,林茹,符馨予,郝冰濤,雷博. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(08)
[2]黏著斑信號通路調(diào)控腫瘤上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化的研究進(jìn)展[J]. 吳藝舟,嚴(yán)雨欣,孫杰. 醫(yī)學(xué)理論與實(shí)踐. 2015(19)
本文編號:3240027
【文章來源】:解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2020,45(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【圖文】:
小鼠足細(xì)胞實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測差異基因的表達(dá)
分別抽提正糖組、高糖組及記憶組的足細(xì)胞RNA,并行轉(zhuǎn)錄組測序。熱圖反映了差異表達(dá)基因及樣本的垂直聚類結(jié)果,紅色代表上調(diào),綠色為下調(diào)(圖3)。與正糖組相比,高糖組共有194個(gè)基因存在差異表達(dá),其中119個(gè)上調(diào),75個(gè)下調(diào)(圖4A),記憶組共有532個(gè)基因存在差異表達(dá),其中316個(gè)上調(diào),216個(gè)下調(diào)(圖4B)。因高糖記憶的分子本質(zhì)系高糖誘導(dǎo)的細(xì)胞基因表達(dá)異常,在血糖正常后仍然持續(xù)存在,故對上述兩組差異表達(dá)的基因進(jìn)行再分析,發(fā)現(xiàn)108個(gè)基因(35個(gè)上調(diào),73個(gè)下調(diào))在高糖組及記憶組存在相似的表達(dá)規(guī)律,并將這些基因稱為共有差異表達(dá)基因。圖2 各組小鼠足細(xì)胞Nephrin蛋白(A)及α-SMA蛋白(B)的免疫熒光染色(×400)
各組小鼠足細(xì)胞Nephrin蛋白(A)及α-SMA蛋白(B)的免疫熒光染色(×400)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]地塞米松對內(nèi)毒素誘導(dǎo)的小鼠葡萄膜炎的治療效果及轉(zhuǎn)錄組分析(英文)[J]. 余鵬,邱一果,林茹,符馨予,郝冰濤,雷博. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(08)
[2]黏著斑信號通路調(diào)控腫瘤上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化的研究進(jìn)展[J]. 吳藝舟,嚴(yán)雨欣,孫杰. 醫(yī)學(xué)理論與實(shí)踐. 2015(19)
本文編號:3240027
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