一株H3N2亞型流感病毒株的全基因序列測定及其分子特征分析
發(fā)布時間:2021-04-03 19:09
目的了解1株人流感H3N2毒株的全基因組序列特征、遺傳進化及生物學特性。方法對浙江省麗水市分離的1株H3N2流感毒株進行全基因組測序,從美國國立生物信息中心(NCBI)和全球倡議分享流感數據庫(GISAD)獲取其他流感毒株基因組全序列,通過BioEdit7.0.9將該毒株8節(jié)段基因與其他序列比對,MEGA7.0軟件鄰接法構建進化樹,并全面分析該毒株的進化、致病力和抗原性等特征。結果測序得到該毒株為人流感分離株A/Homo sapien/China/LS340/2019(H3N2)株(LS340),LS340為典型的季節(jié)性人流感病毒,血凝素基因屬于3C.2a1進化分支,具備人際傳播能力,部分位點呈現高傳播性和高致病性特征,對金剛烷胺耐藥。與當季推薦疫苗株相比,抗原區(qū)出現涉及A、B兩個表位3個位點突變。結論 LS340未出現重組、缺失等較大變異,但與當季推薦疫苗株相比已經發(fā)生抗原漂變,應及時更新疫苗,同時加強此類病毒變異監(jiān)測,防止流感大流行發(fā)生。
【文章來源】:國際流行病學傳染病學雜志. 2020,47(04)
【文章頁數】:5 頁
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2015—2018年廣東省H3N2亞型流感病毒分子特征研究[J]. 景藝,宋穎超,梁麗君,鄒麗容,武婕,陸靖,張寶,柯昌文. 國際病毒學雜志. 2019 (03)
[2]2012-2017年杭州地區(qū)甲型H3N2流感病毒HA和NA基因遺傳進化分析[J]. 錢昕,于新芬,李鈞,寇宇,周銀燕,文艷蘋,王旭初. 中華微生物學和免疫學雜志. 2019 (01)
[3]2007—2017年中國甲型H3N2流感病毒HA基因特征分析[J]. 徐姿,柯美霞,崔大偉,王勝軍. 臨床檢驗雜志. 2018(12)
[4]甲型流感病毒基因組的進化與變異[J]. 陳聞天,黃鶴,于漢杰,李錚. 中國病毒病雜志. 2018(05)
[5]H3N2亞型流感病毒分離株遺傳進化分析及其生物特性[J]. 沃恩康,楊新燕,徐琦,方迪,劉亞輝,郭潮潭. 國際流行病學傳染病學雜志. 2017 (06)
本文編號:3116915
【文章來源】:國際流行病學傳染病學雜志. 2020,47(04)
【文章頁數】:5 頁
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2015—2018年廣東省H3N2亞型流感病毒分子特征研究[J]. 景藝,宋穎超,梁麗君,鄒麗容,武婕,陸靖,張寶,柯昌文. 國際病毒學雜志. 2019 (03)
[2]2012-2017年杭州地區(qū)甲型H3N2流感病毒HA和NA基因遺傳進化分析[J]. 錢昕,于新芬,李鈞,寇宇,周銀燕,文艷蘋,王旭初. 中華微生物學和免疫學雜志. 2019 (01)
[3]2007—2017年中國甲型H3N2流感病毒HA基因特征分析[J]. 徐姿,柯美霞,崔大偉,王勝軍. 臨床檢驗雜志. 2018(12)
[4]甲型流感病毒基因組的進化與變異[J]. 陳聞天,黃鶴,于漢杰,李錚. 中國病毒病雜志. 2018(05)
[5]H3N2亞型流感病毒分離株遺傳進化分析及其生物特性[J]. 沃恩康,楊新燕,徐琦,方迪,劉亞輝,郭潮潭. 國際流行病學傳染病學雜志. 2017 (06)
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