埃博拉病毒（Ebola virus,EBOV）宿主廣泛,其遺傳進(jìn)化關(guān)系復(fù)雜,影響埃博拉病毒密碼子偏愛性的因素眾多。為了明確人埃博拉病毒密碼子使用的偏愛性,揭示影響其偏愛性的影響因素和不同宿主來源的埃博拉病毒間的遺傳進(jìn)化關(guān)系。本研究通過計(jì)算有效密碼子數(shù)（Effective number of codons,ENC）,同義密碼子相對使用頻率（Relative synonymous codon usage,RSCU）和其他指標(biāo),對人埃博拉病毒的密碼子使用模式進(jìn)行綜合分析。結(jié)果顯示,人埃博拉病毒各蛋白的ENC均值分布于55.66～55.77,RSCU>1的密碼子中77%以上都是以A/U結(jié)尾。中性繪圖分析和PR2繪圖分析等相關(guān)分析表明,自然選擇是影響密碼子使用模式的主要因素,突變壓力的影響相對較小。聚類分析結(jié)果表明,豬和人來源的埃博拉病毒親緣關(guān)系最近,提示豬來源的埃博拉病毒感染人的風(fēng)險(xiǎn)最大。新發(fā)現(xiàn)的bombali型埃博拉病毒與人的親緣關(guān)系距離較遠(yuǎn),在大多數(shù)蛋白中均單獨(dú)聚類。本研究結(jié)果對深入了解人埃博拉病毒的遺傳進(jìn)化關(guān)系,進(jìn)而研究埃博拉疫苗和制備抗體具有重大意義。 

【文章來源】：病毒學(xué)報(bào). 2020,36(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

人埃博拉病毒各蛋白中性分析

基于密碼子偏愛性的不同宿主來源埃博拉病毒的聚類分析

人埃博拉病毒各蛋白有效密碼子數(shù)（ENC）和GC3的相關(guān)性分析

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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本文編號：3098793