人多臟器組織基因表達(dá)分析SARS-CoV-2易感性
發(fā)布時間:2021-01-22 13:29
目的目前新型冠狀病毒SARS-CoV-2感染宿主及其致病機制仍不清晰,通過對人體正常臟器組織基因組表達(dá)分析探討病毒的易感組織。方法通過生物信息學(xué)方法分析SARS-CoV-2病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞受體蛋白等的組織表達(dá)譜,以及病毒受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)基因高表達(dá)的臟器組織中宿主細(xì)胞病毒感染、轉(zhuǎn)錄、復(fù)制等病毒處理相關(guān)基因表達(dá)在各臟器平均水平以上的基因數(shù)和表達(dá)量差異。結(jié)果 SARS-CoV-2病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞受體分子ACE2、跨膜絲氨酸蛋白酶2(TMPRSS2)、CD147及潛在受體分子G蛋白偶連受體血管緊張素Ⅱ受體(AGTR2)、窖蛋白(CAV1/2)和網(wǎng)格蛋白(Clathrin)等主要在人肺、腎、腸道、睪丸、脂肪、胃、甲狀腺等組織中高表達(dá);在主要表達(dá)ACE2的人組織臟器中,肺、脂肪、甲狀腺、睪丸、小腸和結(jié)腸中病毒結(jié)合、轉(zhuǎn)錄復(fù)制、受體活性以及防御反應(yīng)相關(guān)基因的表達(dá)數(shù)相對較多,肝、腎和胃中病毒復(fù)制、轉(zhuǎn)錄翻譯和防御反應(yīng)相關(guān)基因表達(dá)數(shù)較少,心臟中所有病毒相關(guān)基因表達(dá)均極少。此外,宿主細(xì)胞中病毒相關(guān)基因的表達(dá)量也顯示出與病毒相關(guān)基因數(shù)量類似的趨勢。結(jié)論肺、腎、小腸、結(jié)腸、睪丸、脂肪和甲狀腺等可...
【文章來源】:軍事醫(yī)學(xué). 2020,44(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1材料與方法
1.1冠狀病毒受體表達(dá)分析數(shù)據(jù)庫
1.2數(shù)據(jù)分析
2結(jié)果
2.1從SARS-CoV-2病毒感染相關(guān)受體基因的表達(dá)分析組織易感性
2.2從宿主細(xì)胞中病毒相關(guān)基因表達(dá)數(shù)量分析RNA病毒易感性
2.3從宿主細(xì)胞中病毒相關(guān)基因表達(dá)水平分析RNA病毒易感性
3討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新型冠狀病毒公認(rèn)受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2的單細(xì)胞RNA表達(dá)情況[J]. 劉青,葉鵬,Zhao Y,Zhao Z,Wang Y,Zhou Y,Ma Y,Zuo W. 中華高血壓雜志. 2020(03)
[2]新型冠狀病毒肺炎死亡尸體系統(tǒng)解剖大體觀察報告[J]. 劉茜,王榮帥,屈國強,王云云,劉盼,朱英芝,費耿,任亮,周亦武,劉良. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2020(01)
[3]Clinical and biochemical indexes from 2019-nCoV infected patients linked to viral loads and lung injury[J]. Yingxia Liu,Yang Yang,Cong Zhang,Fengming Huang,Fuxiang Wang,Jing Yuan,Zhaoqin Wang,Jinxiu Li,Jianming Li,Cheng Feng,Zheng Zhang,Lifei Wang,Ling Peng,Li Chen,Yuhao Qin,Dandan Zhao,Shuguang Tan,Lu Yin,Jun Xu,Congzhao Zhou,Chengyu Jiang,Lei Liu. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[4]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[5]上呼吸道病毒感染相關(guān)亞急性甲狀腺炎發(fā)病機制的研究現(xiàn)狀[J]. 劉迎春,胡曼青,謝建軍. 臨床肺科雜志. 2019(08)
[6]SARS病毒蛋白中caveolin推測的結(jié)合位點(英文)[J]. 蔡全才,姜慶五,趙根明,郭強,曹廣文,陳騰. Acta Pharmacologica Sinica. 2003(10)
本文編號:2993310
【文章來源】:軍事醫(yī)學(xué). 2020,44(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1材料與方法
1.1冠狀病毒受體表達(dá)分析數(shù)據(jù)庫
1.2數(shù)據(jù)分析
2結(jié)果
2.1從SARS-CoV-2病毒感染相關(guān)受體基因的表達(dá)分析組織易感性
2.2從宿主細(xì)胞中病毒相關(guān)基因表達(dá)數(shù)量分析RNA病毒易感性
2.3從宿主細(xì)胞中病毒相關(guān)基因表達(dá)水平分析RNA病毒易感性
3討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新型冠狀病毒公認(rèn)受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2的單細(xì)胞RNA表達(dá)情況[J]. 劉青,葉鵬,Zhao Y,Zhao Z,Wang Y,Zhou Y,Ma Y,Zuo W. 中華高血壓雜志. 2020(03)
[2]新型冠狀病毒肺炎死亡尸體系統(tǒng)解剖大體觀察報告[J]. 劉茜,王榮帥,屈國強,王云云,劉盼,朱英芝,費耿,任亮,周亦武,劉良. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2020(01)
[3]Clinical and biochemical indexes from 2019-nCoV infected patients linked to viral loads and lung injury[J]. Yingxia Liu,Yang Yang,Cong Zhang,Fengming Huang,Fuxiang Wang,Jing Yuan,Zhaoqin Wang,Jinxiu Li,Jianming Li,Cheng Feng,Zheng Zhang,Lifei Wang,Ling Peng,Li Chen,Yuhao Qin,Dandan Zhao,Shuguang Tan,Lu Yin,Jun Xu,Congzhao Zhou,Chengyu Jiang,Lei Liu. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[4]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[5]上呼吸道病毒感染相關(guān)亞急性甲狀腺炎發(fā)病機制的研究現(xiàn)狀[J]. 劉迎春,胡曼青,謝建軍. 臨床肺科雜志. 2019(08)
[6]SARS病毒蛋白中caveolin推測的結(jié)合位點(英文)[J]. 蔡全才,姜慶五,趙根明,郭強,曹廣文,陳騰. Acta Pharmacologica Sinica. 2003(10)
本文編號:2993310
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