病毒宏基因組學(Viral metagenomics,VM)無需知曉核酸序列,直接以環(huán)境中的病毒群落為研究對象,對研究環(huán)境中病毒的多樣性、快速鑒定出已知和未知病毒,實時監(jiān)測特定病毒的動態(tài)變化等具有重要價值。下一代測序(Next-generation sequencing,NGS)平臺具備快速、自動化和高通量等綜合優(yōu)勢,因此相對于一代Sanger測序技術,其測序能力大大提高。同時,近年來測序技術的不斷改進、成本的不斷降低、數(shù)據(jù)分析流程的普及以及對數(shù)據(jù)深入挖掘能力的顯著性改進表明,在可預見的未來,病毒宏基因組測序?qū)蔀槌Ｒ?guī)檢測項目,為未知病毒檢測提供新的技術手段和思路。本文將從病毒宏基因組學的興起,研究過程和在醫(yī)學領域中的應用等方面進行綜述。
【文章目錄】：
1 病毒宏基因組學（Viral metagenomics,VM）的興起
2 病毒宏基因組學的研究過程
    2.1 樣品處理和病毒濃縮
    2.2 核酸提取和擴增
    2.3 高通量測序
        2.3.1 文庫構(gòu)建
        2.3.2 文庫測序
    2.4 生物信息學分析
3 病毒宏基因組學的應用
    3.1 在臨床檢測中的應用
    3.2 在公共衛(wèi)生領域的應用
4 總結(jié)和展望

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