目的了解新疆新源縣和四川石渠縣棘球絳蟲線粒體細胞色素。氧化酶亞基1 (cox1)基因的遺傳多態(tài)性,探討棘球絳蟲在我國的傳播動力和傳播方向。方法 2014-2018年,在新疆新源縣、四川石渠縣捕捉嚙齒類動物并采集其肝組織樣品,收集家畜病變臟器。提取肝組織和病變臟器組織的DNA,PCR擴增棘球絳蟲cox1基因片段,經(jīng)分子克隆、測序后,在NCBI數(shù)據(jù)庫中比對以確定所感染的蟲種。使用Clustal X2和MEGA 7剪輯序列,使用DnaSP v5和Arlequin 3.5計算核苷酸多態(tài)性和中性檢驗,分析新源縣和石渠縣棘球絳蟲的遺傳多樣性。以石渠棘球絳蟲為外群,用MrBayes 3.2.4建立基于cox1基因的貝葉斯系統(tǒng)進化樹,總結(jié)分析蟲種的基因型。采用Network 5.0繪制棘球絳蟲cox1基因的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖,分析單倍型結(jié)構(gòu)。結(jié)果在新疆新源縣捕獲普通田鼠122只,收集綿羊病變臟器5個;在四川石渠縣捕獲青海田鼠144只、經(jīng)營田鼠44只和高原鼠兔135只,收集牦牛病變臟器6個。其中從5只綿羊、4頭牦牛的病變臟器樣品DNA擴增獲得細粒棘球絳蟲cox1基因片段40條(新源縣26條,石渠縣14條),從8只普通田鼠、14只青海田鼠、5只經(jīng)營田鼠和2只高原鼠兔獲得多房棘球絳蟲線粒體cox1基因59條(新源縣20條,石渠縣39條),擴增產(chǎn)物長度均為875 bp。細粒棘球絳蟲在兩地的遺傳分化程度(Fst=0.088 63)高于多房棘球絳蟲(Fst=0.000 88),新源縣細粒棘球絳蟲遺傳多樣性(0.002 58±0.000 46)低于石渠縣(0.005 88±0.000 58),而其多房棘球絳蟲遺傳多樣性(0.002 28±0.000 46)高于石渠縣(0.001 37±0.000 30)。貝葉斯系統(tǒng)進化樹顯示,兩地的細粒棘球絳蟲基因型為G1型,多房棘球絳蟲為亞洲型。序列比對發(fā)現(xiàn)25個細粒棘球絳蟲cox1基因單倍型(新源縣15個,石渠縣9個,共同單倍型1個)和29個多房棘球絳蟲cox1基因單倍型(新源縣13個,石渠縣15個,共同單倍型1個),兩種棘球絳蟲的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖均為環(huán)繞主單倍型(共同單倍型)的輻射狀結(jié)構(gòu),新源縣的細粒棘球絳蟲序列中有9條為主單倍型(34.6%,9/26),而石渠縣僅有1條(1/14),顯示出新源縣在細粒棘球絳蟲單倍型結(jié)構(gòu)中的核心位置;石渠縣的多房棘球絳蟲基因序列中有23條為主單倍型(58.9%,23/39),而新源縣為7條(35.0%,7/20),表明石渠縣在多房棘球絳蟲的單倍型結(jié)構(gòu)中更具有主導(dǎo)地位。結(jié)論新源縣和石渠縣的棘球絳蟲線粒體cox1基因型一致,但遺傳多態(tài)性存在一定差異,同等空間跨度上細粒棘球絳蟲的遺傳分化程度要高于多房棘球絳蟲,這些差異為探討棘球絳蟲傳播方向和動力提供了重要參考依據(jù)。
【部分圖文】：

圖1 基于線粒體cox1基因構(gòu)建的新疆新源縣和四川石渠縣棘球絳蟲貝葉斯系統(tǒng)進化樹新疆和青藏高原地區(qū)地域廣闊，但相鄰的地理位置上，棘球絳蟲的傳播顯示出明顯的關(guān)聯(lián)性。本研究僅討論了以新源縣為代表的北疆地區(qū)和以石渠縣為代表的青藏高原東部地區(qū)的遺傳分化現(xiàn)象，后續(xù)仍需更加全面的數(shù)據(jù)加以論證和深入討論。

石渠縣和新源縣多房棘球絳蟲cox1基因的遺傳分化程度較低（Fst=0.000 88），表明兩個地區(qū)的遺傳關(guān)系非常接近。兩地細粒棘球絳蟲cox1基因的固定指數(shù)（Fst=0.088 63）要明顯高于多房棘球絳蟲，遺傳距離更遠一些，這可能和傳播動力的不同存在一定關(guān)系。細粒棘球絳蟲的傳播依靠于以牛、羊等家畜貿(mào)易為主的人為活動，而多房棘球絳蟲的傳播則以野生犬科動物的活動為主。在更長的時間跨度上，人類活動會受到經(jīng)濟、政治、宗教和地緣關(guān)系等諸多因素影響，而野生動物活動所受到的限制則較少，因此，在不存在完全阻隔的情況下，多房棘球絳蟲的基因擴散速度可能也更快，基因交流頻率更高，同等空間跨度上遺傳分化程度也更低。圖2 基于cox1基因構(gòu)建的新疆新源縣和四川石渠縣棘球絳蟲單倍型網(wǎng)絡(luò)圖
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