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耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌同源性分析及傳播機制研究

發(fā)布時間:2020-10-21 13:44
   背景肺炎克雷伯菌是腸桿菌科中的最常見的細菌之一,也是醫(yī)院內和社區(qū)感染的重要致病源。近年來臨床上檢出多重耐藥肺炎克雷伯菌日益增多,而碳青霉烯類抗生素是治療多重耐藥肺炎克雷伯菌的最常用的抗生素之一,因此肺炎克雷伯菌對碳青霉烯類抗生素耐藥率也逐年提高。然而不同國家和地區(qū)間耐碳青霉烯類的肺炎克雷伯菌流行病學特征存在較大差異,因此通過研究此類耐藥菌株的同源性及其傳播機制,對控制本地區(qū)菌株耐藥性傳播擴散具有重要意義。目的通過系統(tǒng)的收集及研究我院耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌的臨床分布特征及耐藥性傳播機制,為臨床治療此類菌株引起的感染及控制耐藥性的傳播提供初步的實驗室依據。方法采用WHONET軟件收集2012-2017年由莆田學院附屬醫(yī)院臨床分離的腸桿菌科細菌資料及分析。采用法國梅里埃VITEK 2-compact分析儀進行菌株鑒定和藥敏試驗,改良Hodge試驗和EDTA協(xié)同試驗檢測耐藥表型,ERIC-PCR法及MLST法進行同源性分析及分子分型。PCR法擴增檢測碳青霉烯酶基因和膜孔蛋白基因,采用菌株耐藥性接合實驗對細菌的質粒進行轉移,使用質粒提取試劑盒對接合實驗成功的接合子進行質粒提取,采用PCR法擴增檢測質粒DNA的碳青霉烯酶類基因。采用PCR法對接合實驗成功的供體菌插入序列ISCR1、ISEcp1、IS2、IS26及Ⅰ類整合子基因int11、int12、int13等周圍可移動元件進行檢測。結果2012-2017年共收集到腸桿菌科9968株,分離出來的腸桿菌主要以肺炎克雷伯菌為主,共有5596株,占56.1%(5596/9968)。進一步統(tǒng)計分析顯示耐碳青霉烯類的腸桿菌有1326,其中肺炎克雷伯菌1276株,占96.47%(1276/1326)。本研究選取的33株耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌細菌藥敏檢測顯示除了米諾環(huán)素外,對其他15種抗生素的耐藥率均在70%以上;耐藥表型結果顯示32株改良Hodge試驗結果陽性和1株EDTA協(xié)同試驗陽性;ERIC-PCR法及MLST法結果顯示29株為ST11/A型,2株ST15/B型、ST11/C和ST2193/D各1株,經PCR擴增法檢測結果顯示32株攜帶KPC基因,30株攜帶SHV基因,1株攜帶NDM-1基因,1株ompk35膜孔蛋白基因缺失和3株ompk36膜孔蛋白基因缺失未檢測出VIM、IMP、OXA-48、GES、GIM等其他耐藥基因;。細菌耐藥性接合實驗結果顯示33株受試菌株有1株接合實驗成功,PCR法擴增供體菌和接合子質粒結果均為NDM-1基因陽性。未檢測到供體菌的插入序列ISCR1、ISEcp1、IS2、IS26和Ⅰ類整合子基因int11、int12、int13等周圍可移動元件存在。結論本院耐碳青霉烯類腸桿菌以肺炎克雷伯菌為主,且對多種β-內酰胺類抗生素耐藥,耐藥機制以產KPC酶為主,分子分型以ST11型為主,主要流行株為A克隆群,同源性程度高。1株肺炎克雷伯菌耐藥性接合實驗成功,進一步研究顯示該菌株耐藥性接合成功主要由質粒介導完成,未發(fā)現插入序列ISCR1、ISEcp1、IS2、IS26及Ⅰ類整合子基因int11、int12、int13參與。
【學位單位】:南方醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:R446.5;R378
【部分圖文】:

分布圖,腸桿菌科細菌,碳青霉烯類,分布圖


1、2)??2012年-2017年腸桿菌科細菌分布情況??■?1.90J5-1?H1.669S??□?1.?90K-i?j??■?2.47SS-i?/??□?4.12?^?\?1?/?|?■肺炎克雷伯菌??^?')、?□陰溝腸桿菌??^■^■44.?94SS?]?f?氣腸桿菌??■苛異變形菌??.?84SS?■產酸克雷伯菌??■其他腸桿菌??圖1:?2012-2017年臨床分離的腸桿菌科細菌分布圖??2012年-2017年砑碳青梅春烯類揚桿菌分布,況??

趨勢圖,碳青霉烯類,肺炎克雷伯菌,檢出率


2013年2月為19.2%,2013年2月至2014年2月為23.8%,2014年2月至2015??年2月為28.5%,2015年2月至2016年2月為25.0%及2016年2月至2017年??2月為17.5%。(趨勢如圖3)??2012年-2017年耐碳青霉稀類肺炎克雷伯菌檢出率趨勢圖??30.00%?2S.50%??25.00%?23.80%??|?■??■?■?■?■?|??_■■■■■??0.00%??2012.02-2013.02?2013.02-2014.02?2014.02-2015.02?2015.02-201S.02?2018.02-2017.02??圖3:?2012-2017年的耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌檢出率趨勢圖??2.2?33株CRKP臨床資料分析結果??2.2.1?33株CRKP菌株來源:33株菌株中有14株來源于肺泡灌洗液,13??株來源于上呼吸道的痰液,3株來源于尿液,1株來源于血液,1株來源于腦脊??液及1株來源于各類導管標本。??2.2.2?33株CRKP菌株科室分布:33株菌株中來源于7個不同的科室,其??中重癥監(jiān)護病區(qū)17株,呼吸內科7株,神經外科3株,神級內科2株,心胸外??科2株,泌尿外科及肝膽外科各1株。??2.2.3?33名患者患病情況:33例患者患有肺部感染及肺部相關的基礎病得??18??

菌株,試驗結果,碳青霉烯類,碳青霉烯


?第二章?耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌耐藥表型檢測及同源性分析???呋喃妥因?當32?64?蓋128?33?0?0?100??復方新諾明?含?2/3?8?-?§4/76?22?1?10?69.7??左旋氧氟沙星?含2?4?差8?33?0?0?100??優(yōu)立新?S8?16?S32?33?0?0?100??2.4改良Hodge試驗結果??改良Hodge試驗陽性的菌株30株,陽性率為90.?9%?(30/33),提示可能??產碳青霉烯酶。(如圖4)??
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本文編號:2850189

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