PIWI蛋白相互作用RNA(piRNAs),是一種特異的小非編碼RNA亞類,2006年首次在果蠅黑色素生殖細胞中被發(fā)現(xiàn)。這類RNA的長度約24-31個核苷酸,其特征是5'端是U(尿苷),3'端有2'-O-甲基修飾,第10號位置是A(腺苷),并能夠結(jié)合特定類別的PIWI家族蛋白。自它們在生殖細胞中發(fā)現(xiàn)以來,人們發(fā)現(xiàn)piRNA的功能特異性限定于生殖細胞中,能夠維持生殖細胞的基因組完整性和結(jié)構(gòu),尤以在精子發(fā)生,排卵過程和早期發(fā)育過程中為甚。近些年高通量測序方法(small RNA-seq等)的發(fā)展揭示了piRNA在體細胞中也有表達,其表達和功能具有時空特異性。除體細胞之外,piRNA還在發(fā)育過程的表觀遺傳調(diào)控中發(fā)揮重要的作用。近些年許多疾病相關(guān)的研究表明,piRNA能夠調(diào)控疾病相關(guān)的關(guān)鍵基因而發(fā)揮重要的作用,與疾病的預后密切相關(guān)。目前有一些可用的piRNAs集群的數(shù)據(jù)庫,例如pirnabank,piRNAQuest,piRbase,它們提供了 piRNA在各種生物體中的序列和位置信息,但是還沒有與疾病關(guān)聯(lián)的piRNA數(shù)據(jù)庫。因此我們手動收集了文獻報道過的疾病相關(guān)的piRNA信息,進行審閱,篩選,整理,同步化和分類,從而建立一個基于piRNAs與疾病間聯(lián)系的新型綜合數(shù)據(jù)庫。性別二態(tài)性一直是一個亟待解決的問題,1980年的早期研究以表型和生理學方法為基礎(chǔ),發(fā)現(xiàn)兩性之間存在明顯的性別差異。近年來,基因型方法結(jié)合高通量方法進一步揭示了與性偏倚基因相關(guān)的機制。但性別二態(tài)性與衰老有關(guān)的性偏倚研究仍然有限,因此我們檢測了4個年老和年輕小鼠的嗅球(OB),下丘腦(HT),海馬(HC)和小腦(CB),對雄性和雌性中差異表達的mRNA和lncRNA的表達量進行了分析。我們觀察到雄性小鼠OB中的mRNAs和lncRNAs的M/F性別偏倚比顯著高于雌性,而在其他三個腦區(qū)HT,HC和CB中,雌性小鼠的性別偏倚比偏高。后期的表達偏倚,GO,進化和共表達網(wǎng)絡分析也進一步揭示了在雄性和雌性小鼠不同腦區(qū)中mRNA和lncRNA的表達存在明顯的性別二態(tài)性。
【學位單位】：中國科學技術(shù)大學
【學位級別】：博士
【學位年份】：2019
【中圖分類】：R346

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本文編號：2821169