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E3泛素連接酶TRIM40負向調(diào)控抗病毒天然免疫應(yīng)答及其機制研究

發(fā)布時間:2020-08-20 13:14
【摘要】:天然免疫是宿主抵抗病原微生物入侵的第一道防線。在病毒入侵機體之后,宿主的模式識別受體(PRR,pattern recognition receptors)能夠迅速識別來自病毒的病原相關(guān)分子模式(PAMP,pathogen-associated molecular patterns),并積極做出免疫應(yīng)答。維甲酸誘導(dǎo)基因Ⅰ樣受體家族(RLR,retinoic acid-inducible gene-Ⅰ(RIG-Ⅰ)-like receptors)是新近發(fā)現(xiàn)的RNA識別受體。RLR包括三個成員,分別是 RIG-Ⅰ,黑色素瘤分化相關(guān)抗原 5(MDA5,melanoma differentiation-associated gene 5)和遺傳學(xué)和生理學(xué)實驗室蛋白2(LGP2,laboratory of genetics and physiology 2)。RIG-Ⅰ和MDA5在識別外源RNA之后,可以通過一系列信號活化引起Ⅰ型干擾素及炎性細胞因子的大量表達,從而幫助機體迅速建立起應(yīng)對病毒的狀態(tài)。另一方面,MDA5和RIG-Ⅰ的過量表達及活化還能夠引起自身免疫疾病及自身炎癥疾病的發(fā)生。因此,MDA5及RIG-Ⅰ的表達及活化需受到精確調(diào)控,有關(guān)其精確調(diào)控方式與相關(guān)機制的研究是天然免疫領(lǐng)域的前沿?zé)狳c。泛素化修飾是調(diào)節(jié)RIG-Ⅰ及MDA5分子表達及活性的重要的翻譯后修飾(PTM,post-translation modification)之一。已知 TRIM25(tripartite interaction motif 25)、TRIM4、RNF135(RING finger protein 135)、MEX3C、RNF125、RNF122、c-Cbl 和 CHIP(carboxyl terminus of HSC70-interacting protein)能夠通過對 RIG-Ⅰ進行K63位或K48位泛素化修飾而調(diào)節(jié)RIG-Ⅰ的活化或表達。然而,是否存在通過泛素化修飾從而調(diào)節(jié)MDA5的表達及活性的E3泛素連接酶目前尚不清楚;是否存在能夠精確調(diào)控RLR表達的其他類型泛素化修飾也需要進一步明確。TRIM40是E3泛素連接酶TRIM家族成員之一。TRIM40定位于主要組織相容性復(fù)合體Ⅰ類基因區(qū)(MHC Ⅰ),與其他多個TRIM家族分子共同形成了一個緊密基因簇。多項研究表明,位于該基因簇的TRIM成員在天然免疫調(diào)節(jié)方面具有重要作用,包括TRIM15、TRIM26、TRIM31和TRIM39等。然而,TRIM40分子在天然免疫調(diào)節(jié)中是否發(fā)揮作用尚不清楚。在本文中,我們發(fā)現(xiàn)TRIM40缺陷能夠特異性促進RNA病毒仙臺病毒(SeV,Sendai virus)和水皰性口炎病毒(VSV,vesicular stomatitis virus)感染引起的 IFN-β及炎癥因子的表達,而對LPS和poly(I:C)誘導(dǎo)的信號通路沒有影響。對TRIM40缺陷細胞進行MDA5和RIG-Ⅰ特異性配體(長鏈和短鏈poly(I:C))轉(zhuǎn)染,可發(fā)現(xiàn)IFN-β轉(zhuǎn)錄較野生型細胞均有上調(diào)。通過報告基因檢測IRF3和NF-κB啟動子區(qū)活性,及Western blot檢測SeV感染后信號分子的磷酸化水平,發(fā)現(xiàn)TRIM40特異性抑制RLR介導(dǎo)的IRF3和NF-κB信號通路活化。RNA病毒感染后,TRIM40表達下調(diào),說明TRIM40是抗病毒天然免疫反應(yīng)中的反饋調(diào)節(jié)因子。體內(nèi)實驗發(fā)現(xiàn),Trim40-/-小鼠腹腔注射SeV或VSV病毒后,能引起更強烈的天然免疫反應(yīng),且生存率顯著提高。我們進一步對TRIM40作用機制進行了研究。通過向HEK293T細胞中高表達RLR信號通路中的相關(guān)信號分子進行報告基因?qū)嶒灠l(fā)現(xiàn),TRIM40的作用位點位于MAVS或MAVS上游。免疫共沉淀實驗進一步確認TRIM40能夠與MDA5和RIG-Ⅰ結(jié)合。利用截短體質(zhì)粒及免疫共沉淀實驗發(fā)現(xiàn)TRIM40可以通過其CC(coiled-coil)結(jié)構(gòu)域與 MDA5 和 RIG-Ⅰ 的 CARD(caspase activation and recruitment domain)結(jié)構(gòu)域結(jié)合。chase 實驗證明 TRIM40 參與了 MDA5 和 RIG-Ⅰ的降解過程,同時MDA5和RIG-Ⅰ的降解過程可被蛋白酶體抑制劑逆轉(zhuǎn),說明TRIM40對底物的降解是通過蛋白酶體途徑。二次免疫共沉淀檢測MDA5及RIG-Ⅰ泛素化修飾情況,證實了 TRIM40能夠直接催化MDA5和RIG-Ⅰ的K27位和K48位泛素化修飾。我們利用MDA5及RIG-Ⅰ CARD結(jié)構(gòu)域截短體,證明了 TRIM40能夠通過泛素-蛋白酶體途徑降解MDA5及RIG-Ⅰ CARD結(jié)構(gòu)域并下調(diào)RLR信號通路活化。為明確TRIM40對MDA5和RIG-Ⅰ的作用位點,我們構(gòu)建了位于MDA5 CARD結(jié)構(gòu)域上的點突變體,確定了 TRIM40催化MDA5的多聚泛素化修飾位點是K23、K43和K68。我們的研究揭示了 TRIM40通過介導(dǎo)MDA5、RIG-Ⅰ的K27位和K48位泛素化降解從而抑制RLR信號通路及IFN-β產(chǎn)生的分子機制;首次發(fā)現(xiàn)了 MDA5和RIG-Ⅰ的K27位泛素化并證實K27位泛素化修飾參與了蛋白酶體途徑的降解;首次確定了 MDA5能夠發(fā)生泛素化修飾的位點。我們的發(fā)現(xiàn)豐富了參與抗病毒天然免疫反應(yīng)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)研究,也為抗病毒和自身免疫疾病的未來治療提供了潛在的靶點與新思路。
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R392
【圖文】:

基因,天然免疫,基因簇


人源仞基因位于MHC邋I類分子基因區(qū),介于HLA-A和HLA-E之間;逡逑類似地,鼠源基因則定位于小鼠MHC邋I基因區(qū)相應(yīng)的H2-M及H2-T之逡逑間(圖1.1),與多種TRIM家族分子形成了緊密的基因簇。由于該基因簇內(nèi)多種逡逑TRIM分子均在天然免疫中發(fā)揮重要作用,提示了邋TRIM40也可能參與天然免疫逡逑調(diào)控。逡逑A邐一逡逑0.1Mb逡逑Human邋Chromosome邋6逡逑?番邐I逡逑?邐"""邋t邋r邋T邋T逡逑LU邐0邐<邋O邋LL逡逑i邐iii逡逑工邐a:邐工工工逡逑B邐0.1Mb逡逑Mouse邋Chromosome邋17逡逑i邐?馨寒邐《|(||(|_蠢逡逑I邐i邐I逡逑2邐OH逡逑空邐I空逡逑N邐cr逡逑H逡逑圖1.1邋7W/w洲基因位于MHC邋I類分子基因區(qū)逡逑Figure邋1.1邋Trim40邋gene邋located邋within邋the邋MHC邋class邋I邋region.逡逑(A)邋Schematic邋representation邋of邋the邋MHC-encoded邋TRIM邋family邋member邋genes邋in逡逑human邋chromosome.邋(B)Schematic邋representation邋of邋the邋MHC-encoded邋TRIM邋family逡逑member邋genes邋in邋house邋mouse邋chromosome.逡逑為了研宄TRIM40是否在天然免疫調(diào)控中發(fā)揮作用

基因敲除,效率,病毒,仙臺病毒


TRIM40缺陷細胞能夠顯著上調(diào)RNA病毒仙臺病毒(SeV)及水皰性口腔炎病毒逡逑(VSV)誘導(dǎo)的IFN-p以及炎性細胞因子TNF-a及IL-6分泌,而LPS及poly邋(I:C)逡逑處理后并無變化(圖1.3A-C)。逡逑A邐B逡逑1501邐^邋**邐□邋rr/m40*A邋401邐□邋Trim40tn逡逑:邐.一邋■邋Trim40'邋一邐2邋ns邋■Trim40l逡逑r邋u\mtMl逡逑1邋iJIlll.邋^邋:uik逡逑c逡逑AH邋n逡逑**邐ns邐□邋Trim40H*逡逑^邐^邐■邋Trim4(y逡逑i20-邐n邐d逡逑?邋10.邐t.*邋I逡逑0L.-n|邋111邋lllai逡逑¥孑彡夕f逡逑圖1.3邋TRIM40特異性抑制RNA病毒引起的細胞因子分泌逡逑Figure邋1.3邋TR1M40邋attenuates邋RNA邋virus-induced邋cytokines邋production.逡逑(A)邋ELISA邋analysis邋of邋IFN-P邋expression邋in邋peritoneal邋macrophages邋from邋Trim40+/+逡逑22逡逑

病毒誘導(dǎo),報告基因


在外源性實驗中,HEK293T細胞中過表達TRIM40全長質(zhì)粒能夠顯著抑制逡逑SeV誘導(dǎo)的IFN-p報告基因活性,而高表達缺失RING結(jié)構(gòu)域的TRIM40截短體逡逑質(zhì)粒則對IFN-(3報告基因活性沒有影響(圖1.5)。逡逑.邐ns逡逑%邋15]邐□邋Ctrl逡逑|邐T邋T邋■邋TRIM40逡逑0邋10-邐||邋W 邋TRIM40ARING逡逑^邋C0會逡逑圖1.5邋TRIM40特異性抑制RNA病毒誘導(dǎo)的IFN-P表達逡逑Figure邋1.5邋TRIM40邋attenuates邋RNA邋virus-induced邋IFN-p邋expression.逡逑HEK293T邋cells邋were邋transiently邋transfected邋with邋IFN-P邋reporter邋plasmid,邋together邋with逡逑TRIM40,邋TRIM40邋RING邋domain邋truncation邋mutant邋(ARING)邋or邋control邋plasmid,逡逑infected邋with邋SeV邋for邋12邋h,邋and邋then邋analyzed邋luciferase邋activity.邋Data邋are邋representative逡逑of邋three邋independent邋experiments邋and邋presented邋as邋means邋±邋SD.邋*,p<0.05,邋**,/?<0.01.逡逑為進一步驗證以上現(xiàn)象確實是由TRIM40所引起的,我們利用TRIM40基因逡逑敲除小鼠胚胎成纖維細胞進行了回復(fù)實驗。結(jié)果發(fā)現(xiàn),TR1M40缺陷細胞較野生逡逑型細胞在SeV感染后能夠引起更多的IFN-(3轉(zhuǎn)錄

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本文編號:2798022

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