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高通量人乳頭瘤病毒及人類免疫缺陷病毒假病毒檢測體系的建立及應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2020-08-10 14:38
【摘要】:假病毒檢測技術(shù)在病毒疫苗評價(jià)及抗病毒藥物研究中應(yīng)用廣泛,其中最具代表性的是HPV及HIV的假病毒檢測技術(shù),但現(xiàn)有技術(shù)還存在許多缺陷,特別是檢測通量較低,難以應(yīng)用于大規(guī)模的疫苗臨床評價(jià)和血清流行病學(xué)調(diào)查,而且對于HIV耐藥分析中的弱勢株檢出率較低。本研究基于上述問題,建立了兩種高通量的HPV假病毒檢測技術(shù)和一種HIV假病毒檢測技術(shù),并在中和抗體及耐藥性檢測方面進(jìn)行了應(yīng)用。 通過報(bào)告基因篩選及引入新的結(jié)果判讀技術(shù),建立了兩種高通量HPV中和抗體評價(jià)方法,并對影響檢測的各種因素進(jìn)行了優(yōu)化和驗(yàn)證。利用建立的方法檢測50份疫苗免疫血清樣本,發(fā)現(xiàn)HPV疫苗免疫產(chǎn)生的高滴度中和抗體對親緣關(guān)系較近型別的病毒具有一定的交叉保護(hù)作用;在對HPV自然感染人群樣本檢測中發(fā)現(xiàn),相同亞屬病毒的中和抗體有共同出現(xiàn)的趨勢,出現(xiàn)該趨勢的原因不是抗體的交叉保護(hù),而是不同型別病毒先后感染相同個(gè)體引起的。中和抗體檢測結(jié)果與細(xì)胞學(xué)檢測HSIL+之間無明顯的相關(guān)性。 通過HIV-1骨架載體改造,提高了假病毒構(gòu)建效率和耐藥性檢測效率。在耐藥性樣本檢測中,發(fā)現(xiàn)了與蛋白酶抑制劑NFV相關(guān)的兩個(gè)耐藥性突變位點(diǎn)K20R和I72M,與核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑AZT相關(guān)的兩個(gè)耐藥性位點(diǎn)T69I和F130S。在b12中和抗體表位分析中,發(fā)現(xiàn)了病毒膜蛋白上三個(gè)影響中和抗體b12敏感性的氨基酸位點(diǎn),分別為V2區(qū)的V182L,C2區(qū)的N276S,C3區(qū)的R346S。 本研究中建立的三種方法,極大地提高了檢測通量,能基本滿足現(xiàn)有的檢測需求,在HPV臨床樣本檢測、HIV耐藥性分析及HIV中和抗體表位分析等方面具有較好的應(yīng)用前景。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R392.11
【圖文】:

高通量,假病毒,檢測體系,自然感染


圖 1.1 高通量 HPV 假病毒檢Figure 1.1 Establishment and application ofplatform 2. 高通量 HIV 假病毒檢測體系的隨著 HAART 療法的普遍應(yīng)用,耐藥的上升的趨勢,耐藥 HIV 病毒株的出現(xiàn)也是新耐藥位點(diǎn)的出現(xiàn)和多位點(diǎn)聯(lián)合耐藥病藥性檢測技術(shù)的應(yīng)用都提出了很大的挑耐藥性檢測方法,對于新出現(xiàn)的耐藥位點(diǎn)的高通量包括兩個(gè)方面,一是病毒構(gòu)建的疫人群樣本檢測 自然感染人群樣本

發(fā)光檢測,質(zhì)粒,載體,基因


Gluc載體、Fluc基因、Seap基因及Nanoluc基因(引物見表2.1),用in技術(shù)分別將載體與Fluc、Seap、Nanoluc擴(kuò)增片段連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌后進(jìn)行序列測定,將序列比對無誤的質(zhì)粒連同pCMV-Gluc2質(zhì)粒進(jìn)行大提取。A B C D

假病毒,報(bào)告基因,滴度


將上述四種報(bào)告基因質(zhì)粒的濃度統(tǒng)一調(diào)至1 μg/μl,與HPV16 L1/L2表達(dá)質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染真核細(xì)胞293FT,制備包裝有不同報(bào)告基因的HPV16假病毒。將上述四種假病毒分別系列稀釋后接種293FT細(xì)胞,培養(yǎng)72小時(shí)后,分別加入對應(yīng)的檢測底物,檢測不同稀釋度對應(yīng)的化學(xué)發(fā)光值RLU(relative light unit),以稀釋倍數(shù)的對數(shù)值作橫坐標(biāo),以化學(xué)發(fā)光值的對數(shù)值作縱坐標(biāo),繪制散點(diǎn)圖并做線性回歸,Seap、Gluc和Nanoluc假病毒對應(yīng)的線性相關(guān)系數(shù)R2都在0.99以上(圖 2.1)。同時(shí),以不同報(bào)告基因假病毒稀釋1600倍的RLU值和未加假病毒的細(xì)胞對照的RLU值做柱狀圖(圖 2.2.),發(fā)現(xiàn)未加假病毒的細(xì)胞對照(即實(shí)驗(yàn)檢測本底)Seap >Fluc >Gluc >Nanoluc,相同稀釋度下病毒檢測值與細(xì)胞對照的比值可以反映假病毒的滴度,四種假病毒滴度依次為Nanoluc >Gluc >Seap >Fluc,根據(jù)線性相關(guān)系數(shù)、實(shí)驗(yàn)檢測本底以及病毒滴度的結(jié)果,初步選定Nanoluc和Gluc作為候選報(bào)告基因進(jìn)行進(jìn)一步研究。

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 種輝輝;許四宏;王佑春;;評價(jià)HIV-1抗病毒藥物的重組假病毒法的建立及其初步應(yīng)用[J];藥物分析雜志;2008年06期



本文編號:2788212

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