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F基因型腮腺炎病毒全基因組基因特征分析

發(fā)布時間:2019-09-21 01:53
【摘要】:為了解我國現(xiàn)流行的F基因型腮腺炎病毒全基因組的基因特征,本研究選擇對腮腺炎病毒F基因型參考株MuVi/Shandong.CHN/4.05[F]進(jìn)行全基因組測序,結(jié)合其它來自于GenBank的腮腺炎病毒全基因組序列,共同分析我國流行的F基因型腮腺炎病毒的全基因組特征及其與現(xiàn)有疫苗株的遺傳差異及抗原位點變異情況。通過研究發(fā)現(xiàn),和腮腺炎病毒其它基因型相比,腮腺炎毒株MuVi/Shandong.CHN/4.05[F]全基因組核苷酸差異在3.8%~6.5%之間,其中與A基因型(疫苗株)差異最大,與B和N基因型差異最小。腮腺炎毒株MuVi/Shandong.CHN/4.05[F]和疫苗株在全基因組序列上分別存在26個和25個N-糖基化位點,和疫苗株相比,腮腺炎毒株MuVi/Shandong.CHN/4.05[F]在HN蛋白上第464~466氨基酸位點上增加了一個N-糖基化位點,而其它基因型的腮腺炎病毒在這個位點上也均為N-糖基化位點。另外,腮腺炎毒株MuVi/Shandong.CHN/4.05[F]和疫苗株在其它已知的抗原相關(guān)位點上也存在著氨基酸變異。我國現(xiàn)流行的腮腺炎流行株與腮腺炎病毒其它基因型及疫苗株之間在全基因組上已存在較大的差異,提示需進(jìn)一步加強對國內(nèi)現(xiàn)有腮腺炎流行株與疫苗株之間的遺傳變異分析,系統(tǒng)評價當(dāng)前疫苗的免疫保護(hù)效果。
【作者單位】: 中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所;英格蘭公共衛(wèi)生局病毒病原參考部;
【基金】:國家科技重大專項課題(課題編號:2012ZX10004201-003和2013ZX10004202) 國家自然科學(xué)基金(課題編號:81102170)
【分類號】:R341

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

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【二級參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號:2539134

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