大腸桿菌CFT073雙拷貝pap操縱子動(dòng)力學(xué)模型及致病機(jī)制研究
本文選題:大腸桿菌CFT + 致病機(jī)制 ; 參考:《生物物理學(xué)報(bào)》2013年02期
【摘要】:致病性大腸桿菌CFT073(uropathogenic Escherichia coli CFT073)是一種重要的人體病原菌。基因組學(xué)研究表明其負(fù)責(zé)表達(dá)P菌毛的pap操縱子存在不尋常的雙拷貝現(xiàn)象,且兩份拷貝具有一定的差異性。近年來,人們對(duì)P菌毛調(diào)控系統(tǒng)的分子調(diào)控機(jī)制獲得了一定的認(rèn)識(shí),但pap操縱子的雙拷貝機(jī)制及其生物學(xué)意義還有待于深入研究。作者首先對(duì)雙拷貝pap操縱子的調(diào)控系統(tǒng)建立Markov鏈模型,進(jìn)一步結(jié)合種群動(dòng)力學(xué)方法,研究雙拷貝相互作用對(duì)該菌株種群表型分布演化的影響。模擬結(jié)果表明,合作的雙拷貝種群在更廣泛的環(huán)境下具有更強(qiáng)的適應(yīng)性,并有利于種群更快地建立生存優(yōu)勢(shì)。這一研究對(duì)致病菌有效感染宿主所采用的策略進(jìn)行了定量分析,有助于進(jìn)一步理解CFT073及類似致病菌的致病機(jī)制。
[Abstract]:Pathogenic Escherichia coli (CFT073(uropathogenic Escherichia coli CFT 073) is an important human pathogen. Genomics studies show that the pap operon responsible for the expression of P fimbriae has an unusual double copy phenomenon, and the two copies are different to some extent. In recent years, the molecular regulation mechanism of P pili regulatory system has been recognized, but the double copy mechanism of pap operon and its biological significance need to be further studied. The Markov chain model was established for the regulation system of double copy pap operon, and the effect of double copy interaction on the phenotypic distribution and evolution of the strain was studied with population dynamics method. The simulation results show that the cooperative double-copy population has stronger adaptability in a wider environment and helps the population to establish survival advantages more quickly. This study provides a quantitative analysis of the strategies used to effectively infect the host, which is helpful to further understand the pathogenicity mechanism of CFT073 and similar pathogens.
【作者單位】: 北京大學(xué)工學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系;
【基金】:國(guó)家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(2012BAI06B02) 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(30970667,11021463,61131003,91231119) “973”計(jì)劃項(xiàng)目(2011CB707503) 北京大學(xué)本科生科研訓(xùn)練項(xiàng)目校長(zhǎng)基金項(xiàng)目~~
【分類號(hào)】:R378
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