天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

蚊抗藥性相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄組分析及功能驗(yàn)證

發(fā)布時(shí)間:2018-03-05 20:17

  本文選題:淡色庫(kù)蚊 切入點(diǎn):溴氰菊酯 出處:《南京醫(yī)科大學(xué)》2015年博士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:蚊是重要的醫(yī)學(xué)昆蟲(chóng),能傳播多種疾病,如瘧疾、登革熱、西尼羅河熱、絲蟲(chóng)病、黃熱病等。由于方便、高效和經(jīng)濟(jì)等特點(diǎn),采用殺蟲(chóng)劑化學(xué)防制一直是蚊媒綜合治理策略中的主要方法。然而,殺蟲(chóng)劑長(zhǎng)期、大量地使用導(dǎo)致了蚊抗藥性的發(fā)生和發(fā)展?顾幮砸呀(jīng)成為蚊媒病防制工作中的最大障礙。對(duì)蚊抗藥性相關(guān)基因的研究,最早采用功能克隆法(functional cloning strategy),主要是通過(guò)尋找殺蟲(chóng)劑的靶標(biāo)位點(diǎn)或代謝相關(guān)的解毒酶類,隨后再根據(jù)這些已知功能的蛋白質(zhì)或酶類來(lái)克隆其相應(yīng)編碼基因。這種方法在單基因遺傳性狀研究中具有不可比擬的優(yōu)勢(shì)。其后,許多研究人員使用抑制性差減雜交(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)、基因表達(dá)系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)等方法,鑒定了一些其它蚊抗藥性相關(guān)基因。然而,抗藥性是多個(gè)基因、多重機(jī)制參與的復(fù)雜生物進(jìn)化現(xiàn)象,沒(méi)有某一個(gè)或一類已知基因能夠完整闡明抗藥性機(jī)制。全面系統(tǒng)尋找蚊抗藥性相關(guān)基因并探尋其參與抗藥性機(jī)制是蚊媒防制環(huán)節(jié)中亟待解決的問(wèn)題。近年來(lái),隨著現(xiàn)代生物技術(shù)的發(fā)展,高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)使大規(guī)模篩選抗藥性相關(guān)基因、從整體層面研究蚊抗藥性成為可能。本課題以淡色庫(kù)蚊(Culex pipiens pallens)實(shí)驗(yàn)室種群溴氰菊酯敏感(Laboratory Deltamethrin-Susceptible,Lab-DS)品系和抗性(Laboratory Deltamethrin-Resistant,Lab-DR)品系為實(shí)驗(yàn)材料。通過(guò)Illumina-Solexa高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq),比較了2個(gè)品系預(yù)混樣本的基因表達(dá)情況。本次測(cè)序共檢測(cè)到4961197620對(duì)堿基和55124418條reads,匹配到Vectorbase致倦庫(kù)蚊(Culex pipiens quinquefasciatus)數(shù)據(jù)庫(kù)后,組裝成17679個(gè)已知基因。按照差異倍數(shù)大于2倍(|log2Ratio|≥1),且假陽(yáng)性率(False Discovery Rate,FDR)小于0.001的標(biāo)準(zhǔn),我們共篩選到1826個(gè)差異表達(dá)基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),其中1078個(gè)基因在Lab-DR品系中高表達(dá),748個(gè)基因在Lab-DR品系中低表達(dá)。這些DEGs包括細(xì)胞色素P450單加氧酶(p450s),表皮蛋白(cuticleproteins)、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶(udp-glucuronosyltransferases)、脂肪酶(lipases)、熱休克蛋白(heatshockproteins)、酯酶(esterases)、絲氨酸蛋白酶(serineproteases)、肽酶(peptidases)、三磷酸腺苷結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體(atp-bindingcassettetransporters)等。隨后,對(duì)這些degs進(jìn)行了go(geneontology)功能和kegg(kyotoencyclopediaofgenesandgenomes)通路顯著性富集分析。結(jié)果提示,在degs中顯著富集的go和kegg類別分別是代謝過(guò)程(metabolicprocess)和代謝通路(metabolicpathway)。同時(shí),參照vectorbase致倦庫(kù)蚊數(shù)據(jù)庫(kù),我們?cè)趌ab-ds和lab-dr品系中分別優(yōu)化了8315和8511個(gè)vectorbase致倦庫(kù)蚊基因序列,并分別預(yù)測(cè)了4957和5048個(gè)新轉(zhuǎn)錄本(noveltranscriptunits,ntus)。為了證實(shí)rna-seq結(jié)果的可靠性,我們一方面采用實(shí)時(shí)熒光定量pcr(realtimefluorescentquantitative-polymerasechainreaction,qrt-pcr)對(duì)部分基因差異表達(dá)分析結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果證實(shí),rna-seq和qrt-pcr兩種方法得到的基因差異表達(dá)分析結(jié)果趨勢(shì)一致;另一方面,我們隨機(jī)選擇部分新轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄pcr(reversetranscriptionpcr,rt-pcr)驗(yàn)證,結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了新轉(zhuǎn)錄本的真實(shí)存在。參考1826個(gè)degs的rpkm(readsperkilobasepermillionmappedreads)值及其在lab-ds和lab-dr品系間的差異倍數(shù),我們最終選取了22個(gè)基因作為蚊抗藥性相關(guān)候選基因。其中部分候選基因?qū)儆谝阎每顾幮韵嚓P(guān)基因家族,另一部分屬于潛在新蚊抗藥性相關(guān)基因。基于蚊媒病主要依靠雌蚊傳播,我們使用qrt-pcr方法檢測(cè)了這22個(gè)基因在實(shí)驗(yàn)室種群lab-ds和lab-dr品系淡色庫(kù)蚊雌蚊中的相對(duì)表達(dá)水平。結(jié)果提示,其中4個(gè)基因(chymotrypsin-2,dimethylanilinemonooxygenase,carboxylesterase和venomallergen5)在lab-dr品系較lab-ds品系顯著性高表達(dá)(p0.05)。隨后利用商河(shanghe)和孤島(gudao)兩個(gè)現(xiàn)場(chǎng)種群標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)。最終發(fā)現(xiàn)只有venomallergen5在實(shí)驗(yàn)室和兩個(gè)現(xiàn)場(chǎng)種群的抗性品系較敏感品系顯著性高表達(dá)(p0.05)。因此我們最終確定venomallergen5為后續(xù)功能驗(yàn)證候選基因。我們采用rt-pcr結(jié)合cdna末端快速擴(kuò)增(rapidamplificationofcdnaend,race)技術(shù)進(jìn)行候選基因全長(zhǎng)擴(kuò)增。結(jié)果表明,淡色庫(kù)蚊venomallergen5基因序列全長(zhǎng)912bp,包含開(kāi)放閱讀框(openreadingframe,orf)765bp,共編碼254個(gè)氨基酸(genbank登錄號(hào):kf723295.1)。其推導(dǎo)的氨基酸序列與致倦庫(kù)蚊(culexpipiensquinquefasciatus)、埃及伊蚊(aedesaegypti)、岡比亞按蚊(anophelesgambiae)、黑腹果蠅(drosophilamelanogaster)直系同源基因的一致性分別為100%、70.8%、43.85%和32.95%。淡色庫(kù)蚊venomallergen5編碼的蛋白包含一個(gè)scp樣細(xì)胞外蛋白結(jié)構(gòu)域(spermcoatingprotein-likeextracellularproteindomain),屬于scp超家族。為了證實(shí)venomallergen5與蚊抗藥性相關(guān),我們隨后進(jìn)行了體外和體內(nèi)功能驗(yàn)證。首先我們將外源性pib/v5-his-venomallergen5質(zhì)粒dna轉(zhuǎn)染入蚊細(xì)胞內(nèi),提高venomallergen5基因表達(dá)水平,用cck-8試劑盒檢測(cè)不同濃度溴氰菊酯處理后蚊細(xì)胞的存活率,結(jié)果表明venomallergen5高表達(dá)能夠顯著降低蚊細(xì)胞對(duì)溴氰菊酯的敏感性(p0.05);在另一方面,我們將針對(duì)venomallergen5設(shè)計(jì)的sirna40顯微注射入淡色庫(kù)蚊雌蚊原體腔內(nèi),敲低venomallergen5基因表達(dá)水平,用who成蚊接觸筒法檢測(cè)0.05%溴氰菊酯藥膜暴露后雌蚊的存活率,結(jié)果表明venomallergen5低表達(dá)能夠顯著增加雌蚊對(duì)溴氰菊酯的敏感性(p0.05)。這些結(jié)果表明,venomallergen5是一個(gè)新的蚊抗藥性基因,值得我們進(jìn)一步研究。我們檢測(cè)了venomallergen5在四個(gè)不同溴氰菊酯抗性水平雌蚊品系中的相對(duì)表達(dá)水平。四個(gè)品系蚊的半數(shù)致死濃度(50%larvallethalconcentrations,lc50)分別為0.03、0.85、3.7和7.0mg/l。結(jié)果表明,venomallergen5在3個(gè)抗性品系中的基因表達(dá)水平分別是敏感品系的3.3、4.7和29.7倍(p0.05)。在現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)結(jié)果中,venomallergen5基因表達(dá)水平在商河(shanghe)和孤島(Gudao)現(xiàn)場(chǎng)種群抗性品系(resistant strain)較敏感品系(susceptible strain)顯著性高表達(dá)(P0.05),差異倍數(shù)為60.58和7.34。這些結(jié)果提示,venom allergen 5有望成為蚊抗藥性檢測(cè)靶標(biāo)。我們最后檢測(cè)了venom allergen 5在不同發(fā)育階段(卵、1-4齡幼蟲(chóng)、蛹和成蚊)淡色庫(kù)蚊中的相對(duì)表達(dá)水平。結(jié)果表明,venom allergen 5在淡色庫(kù)蚊所有發(fā)育階段均表達(dá)。在卵、雌蚊和雄蚊階段,venom allergen 5在Lab-DR品系中的基因表達(dá)水平分別是Lab-DS品系的2.24、3.3和12.3倍(P0.05)。本研究為蚊抗藥性機(jī)制研究提供了重要分子基礎(chǔ),也為現(xiàn)場(chǎng)抗藥性檢測(cè)提供了大量候選基因;并證實(shí)venom allergen 5是一個(gè)新的蚊抗藥性基因,有望成為蚊抗藥性檢測(cè)靶標(biāo)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R384.1

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 陳禮智;何新橋;陶水生;馬世全;顧租宜;劉敏華;;淡色庫(kù)蚊的防治試驗(yàn)[J];華東師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);1958年00期

2 繆建吾,鄭建中,韓羅珍;噻鉦派對(duì)淡色庫(kù)蚊的不育作用[J];昆蟲(chóng)學(xué)報(bào);1982年03期

3 劉維德,劉金發(fā);淡色庫(kù)蚊(Culex pipiens pallens Coq.)幼蟲(chóng)的不同發(fā)育階段對(duì)幾種氯化烴類殺蟲(chóng)劑敏感度變化的研究[J];昆蟲(chóng)學(xué)報(bào);1963年03期

4 李輝漢,樊天寶,胡玉祥,張魯昌,苗有光,元素會(huì),王家慶;山東農(nóng)村淡色庫(kù)蚊生態(tài)習(xí)性的調(diào)查研究[J];昆蟲(chóng)學(xué)報(bào);1965年05期

5 王仁賚;光周期對(duì)淡色庫(kù)蚊滯育越冬影響的觀察[J];昆蟲(chóng)學(xué)報(bào);1979年03期

6 陳巧云,姜家良,林國(guó)芳,劉維德;淡色庫(kù)蚊對(duì)敵百蟲(chóng)抗性的研究——水解酶同敵百蟲(chóng)抗性關(guān)系[J];昆蟲(chóng)學(xué)報(bào);1980年04期

7 黃品{,

本文編號(hào):1571722


資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/jichuyixue/1571722.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶efae8***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要?jiǎng)h除請(qǐng)E-mail郵箱bigeng88@qq.com