發(fā)布時(shí)間：2018-01-30 04:42

  本文關(guān)鍵詞： 白假絲酵母菌 多位點(diǎn)序列分型技術(shù) 重復(fù)序列聚合酶鏈反應(yīng) 基因分型　出處：《上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2013年11期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的應(yīng)用多位點(diǎn)序列分型技術(shù)(MLST)和重復(fù)序列聚合酶鏈反應(yīng)(REP-PCR)對(duì)臨床分離出的白假絲酵母菌進(jìn)行分型,并對(duì)兩種方法作出應(yīng)用評(píng)價(jià)。方法收集上海地區(qū)醫(yī)院中真菌性陰道炎分離出的40株白假絲酵母菌,選擇合適引物進(jìn)行擴(kuò)增,通過(guò)電泳比較分析獲得REP-PCR分型。選擇7對(duì)管家基因進(jìn)行PCR反應(yīng)并測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)序列進(jìn)行比對(duì),獲得由7對(duì)管家基因組成的等位基因譜,最終得到相應(yīng)的序列分型。結(jié)果 REP-PCR中Ca22-Ca22引物對(duì)得到電泳條帶最優(yōu),40株白假絲酵母菌共分成7種REP-PCR型;MLST分型得出29種,且均為新型。結(jié)論 MLST分辨率較REP-PCR高,但由于REP-PCR分型方法更為快捷、經(jīng)濟(jì),更適用于實(shí)驗(yàn)室大量菌株分型和臨床分型。MLST則更客觀,更適合用于進(jìn)化學(xué)的研究及全球性流行病學(xué)的調(diào)查研究。
[Abstract]:Objective to identify the clinical isolates of Candida albicans by multilocus sequence typing technique (MLST) and repeat sequence polymerase chain reaction (REP-PCR). Methods 40 strains of Candida albicans isolated from hospitals in Shanghai were collected, and suitable primers were selected to amplify them. REP-PCR typing was obtained by electrophoretic analysis. Seven pairs of housekeeping genes were selected for PCR reaction and sequenced. The sequencing results were compared with standard sequences. The allelic spectrum composed of 7 pairs of housekeeping genes was obtained and the corresponding sequence typing was obtained. Results the Ca22-Ca22 primer pairs in REP-PCR obtained the best electrophoretic bands. 40 strains of Candida albicans were divided into 7 REP-PCR types. Conclusion the resolution of MLST is higher than that of REP-PCR, but the method of REP-PCR typing is faster and more economical. MLST is more suitable for laboratory and clinical typing. MLST is more suitable for chemical research and global epidemiological investigation.
【作者單位】： 上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院檢驗(yàn)科;上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院盧灣分院放射免疫檢驗(yàn)科;
【基金】：上海市衛(wèi)生局資助項(xiàng)目(2009239) 上海市科委生物醫(yī)藥資助項(xiàng)目(11411960500) 上海市醫(yī)學(xué)重點(diǎn)�？平ㄔO(shè)項(xiàng)目(2012年A類21號(hào))~~
【分類號(hào)】：R379
【正文快照】： 白假絲酵母菌是一種常見(jiàn)的條件致病菌。近年來(lái),隨著導(dǎo)管插管、免疫缺陷病和器官移植等問(wèn)題逐漸增多,真菌感染及致死率都呈明顯上升趨勢(shì)。因此,針對(duì)白假絲酵母菌快速準(zhǔn)確的分型對(duì)其致病性、耐藥性和流行病學(xué)調(diào)查等均具有重要意義。目前,應(yīng)用于真菌分型的分子生物學(xué)方法有很多,

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1475319