結(jié)核分枝桿菌小分子熱休克蛋白Hsp16.3的基因克隆及生物信息學(xué)分析
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【摘要】:目的構(gòu)建結(jié)核分枝桿菌小分子熱休克蛋白Hsp16.3原核表達(dá)載體,獲得Hsp16.3蛋白,并應(yīng)用生物信息學(xué)軟件,分析結(jié)核分枝桿菌小分子熱休克蛋白16.3(Hsp16.3)的多種蛋白質(zhì)性質(zhì),以及獲取該基因的相關(guān)信息。方法以結(jié)核分枝桿菌H37Rv株基因組DNA為模板,應(yīng)用PCR方法擴(kuò)增Hsp16.3基因,PET28a為載體,構(gòu)建重組質(zhì)粒PET28a-Hsp16.3并表達(dá),利用Pmtparam、Protseale、HMMTOP、TMHMM、GOR4、ProtFun等軟件預(yù)測和分析結(jié)核分枝桿菌小分子熱休克蛋白16.3的氨基酸組成、理論等電點、結(jié)構(gòu)域、活性位點、疏水性、跨膜區(qū)、糖基化位點、磷酸化位點、二級結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)果成功構(gòu)建了Hsp16.3原核表達(dá)載體PET28a-Hsp16.3,并在宿主菌BL21(DE3)中表達(dá)。推測結(jié)核分枝桿菌小分子熱休克蛋白16.3白分子式為C716H1131N197O225S4,分子量為16227.2,理論等電點為5.00。該蛋白氨基酸序列中含有α-螺旋(Alpha helix)46處,延伸鏈(Extended strand)25處,無規(guī)則卷曲(Random coil)73處及5個磷酸化位點;4個O-糖基化位點;1個前肽裂解預(yù)測位點。結(jié)論 Hsp16.3基因克隆入宿主菌中并成功表達(dá);該蛋白推測是一個親水性不穩(wěn)定蛋白,無跨膜區(qū),可能參與重要的能量代謝及免疫反應(yīng)。
【作者單位】: 石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理生理學(xué)教研室(石河子大學(xué)新疆地方與民族高發(fā)病教育部重點實驗室);
【基金】:國家自然科學(xué)基金(No:81160192,30960355) 石河子大學(xué)科學(xué)技術(shù)研究發(fā)展計劃“自然科學(xué)與計劃創(chuàng)新”重點項目(No:ZRKX2010ZD01)
【分類號】:R378
【正文快照】: 結(jié)核病(tuberculosis,TB)是由結(jié)核分枝桿菌(mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的一種世界性傳染病,也是單一致病菌感染導(dǎo)致死亡率最高的感染性疾病,又稱為癆病和“白色瘟疫”。自有人類以來就有結(jié)核病,他是一種古老的傳染病[1]。近年來隨著人口流動增加、HIV與結(jié)核分枝桿
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,本文編號:1251309
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