骨骼肌的生長(zhǎng)發(fā)育從胚胎期到成年期經(jīng)過(guò)了一系列調(diào)控基因表達(dá)量的變化,并且這些基因的表達(dá)量隨著肌肉生長(zhǎng)的過(guò)程發(fā)生變化,其調(diào)控機(jī)制也非常復(fù)雜。為了更深入的了解肉雞從胚胎期到成年期生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中關(guān)鍵基因的調(diào)控作用,本試驗(yàn)以海揚(yáng)黃雞為試驗(yàn)材料,利用RNA-seq技術(shù),篩選調(diào)控肌肉生長(zhǎng)發(fā)育的差異表達(dá)基因,并研究關(guān)鍵基因Alox5對(duì)成肌細(xì)胞增殖分化的影響以及在此過(guò)程中調(diào)控的差異miRNA。主要研究結(jié)果如下:1.對(duì)海揚(yáng)黃雞不同生長(zhǎng)階段(E12,E16,1d和10w,每個(gè)時(shí)期公母各3只)腿部肌肉組織的轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)公母雞分別檢測(cè)出5743和6150個(gè)差異表達(dá)基因(Fold Change≥2且 FDR≤0.05),且 AHSG、ACACB、PHGDH、MYH1C 和 NTRK2這5個(gè)基因在公母雞不同時(shí)間點(diǎn)之間的對(duì)比均屬于共有差異表達(dá)基因,說(shuō)明這些基因在公母雞不同生長(zhǎng)階段都對(duì)肌肉發(fā)育產(chǎn)生了重要影響。2.對(duì)公母雞差異表達(dá)基因的GO功能注釋結(jié)果發(fā)現(xiàn),公母雞主要富集的GO條目基本一致,其中有一些顯著富集且影響肌肉發(fā)育的條目(P<0.05),如細(xì)胞增殖(cell proliferation)、生長(zhǎng)(...

【文章頁(yè)數(shù)】：122 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖１．２?ｍｉＲＮＡ的生物合成過(guò)程??Ｆｉｇ?１．２?ｍｉＲＮＡ?ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ??１．５．３?ｍｉＲＮＡ靶基因預(yù)測(cè)及作用機(jī)理??

、ＴＲＢＰ?，，?Ｓｔｒａｎｄ?ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ??Ｆ〇Ｔ＾．？Ｒ，ＳＣ?Ｍ？ｕｒｅｍ，ＲＮＡ??ｃｏｍｐｌｅｘ?５－?：?，?－?３＇??３．?１１１１１１１?ｎ?１１?＾?１１?ｉ，ｉ，ｐ?５．??ｍＲＮＡ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ??毒?善??ｍＲＮＡ?ｄ？ｇｒａｄａ�。荆铮�....

圖２．１?ｃＤＮＡ文庫(kù)構(gòu)建圖??Ｆｉｇ?２．１?Ｔｈｅ?ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎ?ｍａｐ?ｏｆ?ｃＤＮＡ?ｌｉｂｒａｒｙ??

?揚(yáng)州大學(xué)博士學(xué)位論文???ＰＣＲ產(chǎn)物，得到最終的文庫(kù)。先使用Ｑｕｂｉｔ２．０進(jìn)行初步定量，稀釋文庫(kù)至１．５ｎｇ／ｕｌ，再??利用Ａｇｉｌｅｎｔ?２１００對(duì)文庫(kù)進(jìn)行質(zhì)檢，符合要求后，使用ＲＴ－ｑＰＣＲ方法對(duì)文庫(kù)的有效濃??度進(jìn)行定量檢測(cè)（文庫(kù)有效濃度＞２ｎＭ），目的是為了確保文庫(kù)....

圖２．２測(cè)序樣品ＲＮＡ質(zhì)量檢測(cè)圖??Ｆｉ２．２?ＲＮＡｕａｌｉｔｄｅｔｅｃｔｉｏｎ??

Ｈ＿ｌｄ＿Ｍｌ?Ｈ＿１０ｒｖ＿Ｍｌ??Ｔｉｉ?ｒｕｉ??３０－?ｉ??泊一??ｉ?Ｉ?１?｜?＜?２０－?．?Ｉ?｜??１０－?！?ｊ?ｊ?ｊ??！?ｆ！?１?一??０－?．．?＇、一?—ｉ－?０－?．Ｖ??—，＿，—，?ｐ＊￣￣ｒ－１－！￣ｉ—?￣￣—ｉ?１?ｒｉ￣?＇?ｉ—ｉ....

圖２．３測(cè)序堿基錯(cuò)誤率分布圖??Ｆｉｇ?２．３?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｂａｓｅ?ｑｕａｌｉｔｙ??

?揚(yáng)州大學(xué)博士學(xué)位論文???說(shuō)，１－１５０?ｎｔ為正向測(cè)序的結(jié)果，１５０－３００?ｎｔ則為反向測(cè)序的結(jié)果。隨著測(cè)序長(zhǎng)度的增??力口，發(fā)生錯(cuò)誤的概率就越高，因此在終止位置錯(cuò)誤率較高，但總的測(cè)序錯(cuò)誤率均不超過(guò)??０．０４?％。結(jié)果說(shuō)明本研究中測(cè)序數(shù)據(jù)堿基讀取的準(zhǔn)確率高。??ＥｎＷ?ｒ....

本文編號(hào)：4027069