新型鴨呼腸孤病毒的分離鑒定及其σC基因遺傳進化分析
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【部分圖文】:
圖1 NDRV分離病毒體外感染細胞后的CPE觀察
分別將5株NDRV分離病毒接種原代CEF及傳代Vero細胞,觀察其CPE。結(jié)果顯示,NDRV-SD19/6304、NDRV-SD19/6307、NDRV-SD19/7304及NDRV-SD19/6201株病毒在兩種細胞中均可增殖,產(chǎn)生明顯CPE(圖1)。而NDRV-SD19/62....
圖2 5株分離病毒的σC基因的RT-PCR擴增結(jié)果
利用本研究設(shè)計合成的NDRVσC基因的特異性引物,對上述5株分離病毒進行RT-PCR擴增。結(jié)果顯示均可獲得約1000bp的目的條帶,與預期一致(圖2)。以上結(jié)果進一步表明,分離的5株病毒均為NDRV。2.7分離病毒σC基因同源性及遺傳進化分析
圖4 兩株NDRV分離病毒σC基因編碼氨基酸序列的比對分析
為進一步探究造成上述分離株在CEF中復制差異產(chǎn)生的原因,本研究選取NDRV-SD19/6201作為適應CEF增殖的代表株,與非適應CEF增殖的NDRV-SD19/6202株的σC蛋白氨基酸序列進行比對,結(jié)果顯示兩株病毒之間共存在13個差異位點。有研究報道顯示,σCC端的aa15....
圖3 NDRV分離株的σC基因核苷酸序列遺傳進化分析
利用Multalin在線軟件對在CEF中復制特性不同的兩株分離病毒NDRV-SD19/6201與NDRV-SD19/6202的σC基因編碼氨基酸序列進行比對分析,結(jié)果顯示兩者之間存在13個氨基酸差異位點,分別位于第P9L、Y16C、T25K、I64T、E65D、L66M、G74S....
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