新型鴨呼腸孤病毒的分離鑒定及其σC基因遺傳進(jìn)化分析
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
圖1 NDRV分離病毒體外感染細(xì)胞后的CPE觀察
分別將5株NDRV分離病毒接種原代CEF及傳代Vero細(xì)胞,觀察其CPE。結(jié)果顯示,NDRV-SD19/6304、NDRV-SD19/6307、NDRV-SD19/7304及NDRV-SD19/6201株病毒在兩種細(xì)胞中均可增殖,產(chǎn)生明顯CPE(圖1)。而NDRV-SD19/62....
圖2 5株分離病毒的σC基因的RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果
利用本研究設(shè)計(jì)合成的NDRVσC基因的特異性引物,對(duì)上述5株分離病毒進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增。結(jié)果顯示均可獲得約1000bp的目的條帶,與預(yù)期一致(圖2)。以上結(jié)果進(jìn)一步表明,分離的5株病毒均為NDRV。2.7分離病毒σC基因同源性及遺傳進(jìn)化分析
圖4 兩株NDRV分離病毒σC基因編碼氨基酸序列的比對(duì)分析
為進(jìn)一步探究造成上述分離株在CEF中復(fù)制差異產(chǎn)生的原因,本研究選取NDRV-SD19/6201作為適應(yīng)CEF增殖的代表株,與非適應(yīng)CEF增殖的NDRV-SD19/6202株的σC蛋白氨基酸序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果顯示兩株病毒之間共存在13個(gè)差異位點(diǎn)。有研究報(bào)道顯示,σCC端的aa15....
圖3 NDRV分離株的σC基因核苷酸序列遺傳進(jìn)化分析
利用Multalin在線軟件對(duì)在CEF中復(fù)制特性不同的兩株分離病毒NDRV-SD19/6201與NDRV-SD19/6202的σC基因編碼氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)分析,結(jié)果顯示兩者之間存在13個(gè)氨基酸差異位點(diǎn),分別位于第P9L、Y16C、T25K、I64T、E65D、L66M、G74S....
本文編號(hào):4026999
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/4026999.html