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基于轉(zhuǎn)錄組測序分析中國西門塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達

發(fā)布時間:2024-11-02 16:57
  中國西門塔爾牛和安格斯牛的肉用性能良好,是內(nèi)蒙古通遼地區(qū)飼養(yǎng)的主要肉牛品種。牛肉背部脂肪沉積情況是衡量牛肉營養(yǎng)價值和生產(chǎn)機能的主要指標(biāo)。對屠宰試驗所得的肉質(zhì)數(shù)據(jù)進行獨立樣本T檢驗,發(fā)現(xiàn)中國西門塔爾牛和安格斯牛在剪切力、滴水損失、熟肉率和背膘厚度都存在極顯著差異(p<0.01)。并對相關(guān)數(shù)據(jù)進行聚類分析,篩選出中國西門塔爾牛和安格斯牛各三頭牛的背膘組織進行送樣測序。通過BGISEQ-500平臺獲取了 6個背膘樣品的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),結(jié)果顯示樣品比對基因組的平均比對率為92.32%,比對基因集的平均比對率為80.69%。一共檢測到21,970個基因,檢測出19,747個新轉(zhuǎn)錄本,其中16,576個是預(yù)測編碼的轉(zhuǎn)錄本,15,643個屬于已知蛋白編碼基因的新的可變剪接亞型,933個屬于新的蛋白編碼基因的轉(zhuǎn)錄本,剩下的3,171個屬于長鏈非編碼RNA。GO功能分類注釋到生物學(xué)過程的差異表達基因為3,149個、細胞組成的差異表達基因為2204個和分子功能數(shù)據(jù)庫中的差異表達基因890個,并將三大功能類進行了單獨的的分類和富集分析。通過KEGG代謝通路分析牛背膘組織的Unigene,參與了 6大類共...

【文章頁數(shù)】:49 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組測序分析中國西門塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達



?方面差異??不顯著;Fbft=13.478,PBFT=0.04<0.05,方差不齊,PBFT=0.007<0.01,表明兩品種牛??在背膘厚度方面差異極顯著;FEMa=0.062,PEMa=0.808>0.05,方差齊,Pema=〇.359>0.05,??表明兩品種牛在眼肌面積....


基于轉(zhuǎn)錄組測序分析中國西門塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達



tter?plot?of?DEGs.??注:X、Y軸均代表基因表達量的對數(shù)值。??3.?2.?7樣品間及組間的基因表達情況??對于多個樣品的表達量數(shù)據(jù),利用維恩圖展示了基因在不同樣品間及組間的表達??情況。安格斯牛的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)中共有19147個基因,中國西門塔爾牛中有1893....


基于轉(zhuǎn)錄組測序分析中國西門塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達



22?基于轉(zhuǎn)錄組測序分析中國西門塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達??DEGs?Number?of?The?Most?Enriched?GOTerm???b?〇?〇gica?_pf〇cess??ce?u?af_comp〇nent??motecutar?Junction??....


基于轉(zhuǎn)錄組測序分析中國西門塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達



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本文編號:4009835

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