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基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析中國(guó)西門(mén)塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2024-11-02 16:57
  中國(guó)西門(mén)塔爾牛和安格斯牛的肉用性能良好,是內(nèi)蒙古通遼地區(qū)飼養(yǎng)的主要肉牛品種。牛肉背部脂肪沉積情況是衡量牛肉營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和生產(chǎn)機(jī)能的主要指標(biāo)。對(duì)屠宰試驗(yàn)所得的肉質(zhì)數(shù)據(jù)進(jìn)行獨(dú)立樣本T檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)中國(guó)西門(mén)塔爾牛和安格斯牛在剪切力、滴水損失、熟肉率和背膘厚度都存在極顯著差異(p<0.01)。并對(duì)相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類(lèi)分析,篩選出中國(guó)西門(mén)塔爾牛和安格斯牛各三頭牛的背膘組織進(jìn)行送樣測(cè)序。通過(guò)BGISEQ-500平臺(tái)獲取了 6個(gè)背膘樣品的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),結(jié)果顯示樣品比對(duì)基因組的平均比對(duì)率為92.32%,比對(duì)基因集的平均比對(duì)率為80.69%。一共檢測(cè)到21,970個(gè)基因,檢測(cè)出19,747個(gè)新轉(zhuǎn)錄本,其中16,576個(gè)是預(yù)測(cè)編碼的轉(zhuǎn)錄本,15,643個(gè)屬于已知蛋白編碼基因的新的可變剪接亞型,933個(gè)屬于新的蛋白編碼基因的轉(zhuǎn)錄本,剩下的3,171個(gè)屬于長(zhǎng)鏈非編碼RNA。GO功能分類(lèi)注釋到生物學(xué)過(guò)程的差異表達(dá)基因?yàn)?,149個(gè)、細(xì)胞組成的差異表達(dá)基因?yàn)?204個(gè)和分子功能數(shù)據(jù)庫(kù)中的差異表達(dá)基因890個(gè),并將三大功能類(lèi)進(jìn)行了單獨(dú)的的分類(lèi)和富集分析。通過(guò)KEGG代謝通路分析牛背膘組織的Unigene,參與了 6大類(lèi)共...

【文章頁(yè)數(shù)】:49 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析中國(guó)西門(mén)塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)



?方面差異??不顯著;Fbft=13.478,PBFT=0.04<0.05,方差不齊,PBFT=0.007<0.01,表明兩品種牛??在背膘厚度方面差異極顯著;FEMa=0.062,PEMa=0.808>0.05,方差齊,Pema=〇.359>0.05,??表明兩品種牛在眼肌面積....


基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析中國(guó)西門(mén)塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)



tter?plot?of?DEGs.??注:X、Y軸均代表基因表達(dá)量的對(duì)數(shù)值。??3.?2.?7樣品間及組間的基因表達(dá)情況??對(duì)于多個(gè)樣品的表達(dá)量數(shù)據(jù),利用維恩圖展示了基因在不同樣品間及組間的表達(dá)??情況。安格斯牛的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)中共有19147個(gè)基因,中國(guó)西門(mén)塔爾牛中有1893....


基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析中國(guó)西門(mén)塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)



22?基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析中國(guó)西門(mén)塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)??DEGs?Number?of?The?Most?Enriched?GOTerm???b?〇?〇gica?_pf〇cess??ce?u?af_comp〇nent??motecutar?Junction??....


基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析中國(guó)西門(mén)塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達(dá)



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本文編號(hào):4009835

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