與PRRSV nsp11互作的宿主細胞蛋白鑒定及生物信息學分析
本文選題:豬繁殖與呼吸綜合征病毒 + 非結構蛋白。 參考:《微生物學通報》2017年12期
【摘要】:【目的】研究豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)nsp11與宿主細胞蛋白之間的相互作用,對于揭示nsp11在病毒復制過程中發(fā)揮的功能至關重要。【方法】在病毒感染細胞的基礎上,利用nsp11的單克隆抗體,采用免疫沉淀結合串聯(lián)質譜的方法,篩選與PRRSV nsp11相互作用的宿主細胞蛋白,并對所篩選出的宿主細胞蛋白進行了GO注釋、COG注釋和KEGG代謝通路注釋;選取篩選出的宿主細胞蛋白IRAK1,利用免疫共沉淀技術和激光共聚焦技術鑒定其與nsp11之間的相互作用!窘Y果】與空白對照組相比,病毒感染組中出現(xiàn)3條差異帶;經質譜分析共篩選得到了201個與nsp11相互作用的宿主細胞蛋白,分別與蛋白質代謝、細胞信號通路轉導以及病原致病性等密切相關;在生物信息學分析的基礎上,實驗驗證了nsp11確與宿主細胞蛋白IRAK1進行相互作用!窘Y論】鑒定出與PRRSV nsp11相互作用的宿主細胞蛋白,生物信息學分析顯示它們在病毒的復制和致病過程中發(fā)揮重要作用。研究結果為探究nsp11的生物學功能指明了方向,也為研究宿主細胞蛋白與病毒蛋白間的相互作用及其調控病毒復制和致病性的分子機制奠定了基礎。
[Abstract]:[objective] to study the interaction between porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSv) nsp11 and host cell proteins, in order to reveal the function of nsp11 in viral replication. The host cell proteins interacting with PRRSv nsp11 were screened by immunoprecipitation and tandem mass spectrometry using monoclonal antibody of nsp11. The selected host cell proteins were annotated by go and KEGG metabolic pathway. The host cell protein IRAK1 was selected and the interaction between IRAK1 and nsp11 was identified by immunoprecipitation and laser confocal technique. [results] compared with the control group, there were three different bands in the viral infection group. A total of 201 host cell proteins interacting with nsp11 were screened by mass spectrometry, which were closely related to protein metabolism, cell signal pathway transduction and pathogenicity. It was verified that nsp11 interacted with host cell protein IRAK1. [conclusion] the host cell proteins interacting with PRRSv nsp11 were identified. Bioinformatics analysis showed that they played an important role in the replication and pathogenesis of the virus. The results provide a basis for the study of the biological function of nsp11 and the interaction between host cell protein and viral protein and the molecular mechanism of regulating viral replication and pathogenicity.
【作者單位】: 中國農業(yè)大學動物醫(yī)學院農業(yè)部動物流行病學重點實驗室;
【基金】:國家科技攻關計劃項目(No.2015BAD12B01-2)~~
【分類號】:S852.651
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本文編號:2094174
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