與PRRSV nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白鑒定及生物信息學(xué)分析
本文選題:豬繁殖與呼吸綜合征病毒 + 非結(jié)構(gòu)蛋白。 參考:《微生物學(xué)通報》2017年12期
【摘要】:【目的】研究豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)nsp11與宿主細(xì)胞蛋白之間的相互作用,對于揭示nsp11在病毒復(fù)制過程中發(fā)揮的功能至關(guān)重要!痉椒ā吭诓《靖腥炯(xì)胞的基礎(chǔ)上,利用nsp11的單克隆抗體,采用免疫沉淀結(jié)合串聯(lián)質(zhì)譜的方法,篩選與PRRSV nsp11相互作用的宿主細(xì)胞蛋白,并對所篩選出的宿主細(xì)胞蛋白進行了GO注釋、COG注釋和KEGG代謝通路注釋;選取篩選出的宿主細(xì)胞蛋白IRAK1,利用免疫共沉淀技術(shù)和激光共聚焦技術(shù)鑒定其與nsp11之間的相互作用!窘Y(jié)果】與空白對照組相比,病毒感染組中出現(xiàn)3條差異帶;經(jīng)質(zhì)譜分析共篩選得到了201個與nsp11相互作用的宿主細(xì)胞蛋白,分別與蛋白質(zhì)代謝、細(xì)胞信號通路轉(zhuǎn)導(dǎo)以及病原致病性等密切相關(guān);在生物信息學(xué)分析的基礎(chǔ)上,實驗驗證了nsp11確與宿主細(xì)胞蛋白IRAK1進行相互作用!窘Y(jié)論】鑒定出與PRRSV nsp11相互作用的宿主細(xì)胞蛋白,生物信息學(xué)分析顯示它們在病毒的復(fù)制和致病過程中發(fā)揮重要作用。研究結(jié)果為探究nsp11的生物學(xué)功能指明了方向,也為研究宿主細(xì)胞蛋白與病毒蛋白間的相互作用及其調(diào)控病毒復(fù)制和致病性的分子機制奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:[objective] to study the interaction between porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSv) nsp11 and host cell proteins, in order to reveal the function of nsp11 in viral replication. The host cell proteins interacting with PRRSv nsp11 were screened by immunoprecipitation and tandem mass spectrometry using monoclonal antibody of nsp11. The selected host cell proteins were annotated by go and KEGG metabolic pathway. The host cell protein IRAK1 was selected and the interaction between IRAK1 and nsp11 was identified by immunoprecipitation and laser confocal technique. [results] compared with the control group, there were three different bands in the viral infection group. A total of 201 host cell proteins interacting with nsp11 were screened by mass spectrometry, which were closely related to protein metabolism, cell signal pathway transduction and pathogenicity. It was verified that nsp11 interacted with host cell protein IRAK1. [conclusion] the host cell proteins interacting with PRRSv nsp11 were identified. Bioinformatics analysis showed that they played an important role in the replication and pathogenesis of the virus. The results provide a basis for the study of the biological function of nsp11 and the interaction between host cell protein and viral protein and the molecular mechanism of regulating viral replication and pathogenicity.
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院農(nóng)業(yè)部動物流行病學(xué)重點實驗室;
【基金】:國家科技攻關(guān)計劃項目(No.2015BAD12B01-2)~~
【分類號】:S852.651
【相似文獻】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 姜宏,聞良珍;人巨細(xì)胞病毒感染誘導(dǎo)宿主細(xì)胞凋亡的實驗研究[J];中華實驗和臨床病毒學(xué)雜志;2002年01期
2 孫理云;;豬鏈球菌2型與宿主細(xì)胞的相互作用[J];中國人獸共患病學(xué)報;2008年08期
3 李公啟;張曉杰;韓俊;;小RNA病毒對宿主細(xì)胞蛋白翻譯的影響[J];疾病預(yù)防控制通報;2013年04期
4 王福生;王宏霞;李予川;胥照平;汪民;;斑點熱群新疆立克次體對宿主細(xì)胞感染過程的形態(tài)學(xué)研究[J];微生物學(xué)雜志;1990年03期
5 陳穎盈;侯連生;;盤基網(wǎng)柄菌——研究致病機制的宿主模型[J];細(xì)胞生物學(xué)雜志;2007年01期
6 楊倩;;病原菌入侵宿主細(xì)胞的機制研究進展[J];免疫學(xué)雜志;2010年02期
7 謝兆輝;;病毒RNA如何逃避宿主細(xì)胞的降解[J];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報;2013年02期
8 王瑞卿;;H和N是什么意思[J];科技術(shù)語研究;2006年02期
9 楊倩;;病原菌與宿主細(xì)胞中的微絲裝配[J];細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志;2010年01期
10 田博,丁志芬;Vero細(xì)胞疫苗生產(chǎn)過程中宿主細(xì)胞蛋白含量分析[J];中國生物制品學(xué)雜志;2005年05期
相關(guān)會議論文 前10條
1 韓黎;紀(jì)蕾;蘇文莉;王菡;梁克為;胡小華;;磷脂酶D影響李斯特菌感染宿主細(xì)胞效率的初步研究[A];2006中國微生物學(xué)會第九次全國會員代表大會暨學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2006年
2 黃碧海;林毅;張志凌;專芳芳;劉安安;田智全;張振鋒;王漢中;龐代文;;借助宿主細(xì)胞對包膜病毒的表面包膜進行標(biāo)記[A];中國化學(xué)會第28屆學(xué)術(shù)年會第3分會場摘要集[C];2012年
3 常維山;翟靜;宋文剛;劉永慶;;宿主細(xì)胞內(nèi)SARS-CoV N蛋白相互作用蛋白的篩選與鑒定[A];第六屆全國免疫學(xué)學(xué)術(shù)大會論文集[C];2008年
4 方彩云;易志剛;劉鋒;劉清平;陸豪杰;袁正宏;楊們原;;HCV亞基因組復(fù)制細(xì)胞中脂筏蛋白質(zhì)組研究[A];中國蛋白質(zhì)組學(xué)第三屆學(xué)術(shù)大會論文摘要[C];2005年
5 榮成博;高福;;G-細(xì)菌粘附的分子機制—假結(jié)核耶爾森氏菌粘附的分子基礎(chǔ)[A];2010年中國科學(xué)院微生物研究所博士后學(xué)術(shù)年會暨第二屆博誼論壇論文摘要集[C];2011年
6 姜帆;殷雷;張英;王大成;;YopT/SycT復(fù)合物的表達(dá)、純化和結(jié)晶條件搜索[A];第十次中國生物物理學(xué)術(shù)大會論文摘要集[C];2006年
7 李傳友;馬s,
本文編號:2094174
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/2094174.html