發(fā)布時間：2017-08-20 08:41

  本文關(guān)鍵詞：干擾素治療早期乙型肝炎病毒的準種進化

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【摘要】：目的應(yīng)用生物信息學(xué)方法研究干擾素-α(IFN-α)治療早期乙型肝炎病毒(HBV)全基因組準種進化及其與病毒學(xué)應(yīng)答的關(guān)系。方法對16例進入免疫清除期的慢性乙型肝炎患者進行IFN-α抗病毒治療,治療12周有6例取得完全病毒學(xué)應(yīng)答,3例部分病毒學(xué)應(yīng)答,7例無應(yīng)答。分別采集治療前和治療12周的患者血清,提取HBV DNA后擴增HBV全基因組,進行分子克隆后測序,對得到的序列進行生物信息學(xué)分析從而研究病毒的準種進化。結(jié)果除了乙肝病毒前C/C基因,在IFN-α治療早期無其他基因準種特征的動態(tài)變化。治療前完全應(yīng)答組前C/C基因氨基酸水平的平均遺傳距離[2.868(1.727~5.411)10~(-2)替換數(shù)/位點]大于無應(yīng)答組[0.917(0.449~3.695)10~(-2)替換數(shù)/位點](P0.001);部分應(yīng)答組[1.904(1.272~2.349)10~(-2)替換數(shù)/位點]大于無應(yīng)答組[0.917(0.449~3.695)10~(-2)替換數(shù)/位點](P=0.006)。治療前完全應(yīng)答組前C/C基因平均非同義替換率[1.410(0.804~3.188)10~(-2)替換數(shù)/位點]大于無應(yīng)答組[0.293(0.205~0.651)10~(-2)替換數(shù)/位點](P=0.008);治療12周部分應(yīng)答組氨基酸水平平均遺傳距離[1.755(0.974~2.172)10~(-2)替換數(shù)/位點]大于無應(yīng)答組[0.869(0.276~1.475)10~(-2)替換數(shù)/位點](P=0.047);部分應(yīng)答組與無應(yīng)答組在IFN-α作用下病毒進化速率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.53)。結(jié)論慢性乙型肝炎免疫清除期,前C/C基因氨基酸水平準種多樣性高的患者在IFN-α治療早期更容易取得病毒學(xué)應(yīng)答。
【作者單位】： 濟南市傳染病醫(yī)院;首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院肝病二科(北京市醫(yī)院管理局重點醫(yī)學(xué)專業(yè)發(fā)展計劃-肝炎專業(yè)ZY201402);
【關(guān)鍵詞】： 肝炎 乙型 慢性 干擾素-α 準種 進化
【基金】：北京市科技計劃課題(D121100003912001)
【分類號】：R512.62
【正文快照】： 2.首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院肝病二科(北京市醫(yī)院管理局重點醫(yī)學(xué)專業(yè)發(fā)展計劃-肝炎專業(yè)ZY201402),北京100015of partial responders[1.755(0.974-2.172)10-2 substitution/site]was significantly higher than that of thenon-responders at week 12[0.869(0.276-1.475)10

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本文編號：705644