本文關(guān)鍵詞：線粒體控制區(qū)的遺傳變異與慢性HBV感染相關(guān)性研究

  更多相關(guān)文章： 乙型肝炎病毒 慢性感染 線粒體DNA 遺傳變異 單倍型類群 相關(guān)性

【摘要】：[目的]以慢性HBV感染者和健康人群為研究對象,對其線粒體DNA控制區(qū)進行擴增、測序并獲取線粒體DNA遺傳變異信息和線粒體DNA單倍型類群；分析研究組間線粒體DNA變異位點和單倍型類群的分布情況,甄別與HBV慢性感染相關(guān)的變異位點和單倍型類群；結(jié)合臨床數(shù)據(jù),揭示候選線粒體DNA變異和單倍型類群與慢性HBV感染臨床表現(xiàn)的相關(guān)性。[方法]提取來自云南的117例慢性HBV感染者及130例健康對照者外周血基因組DNA,對線粒體DNA的控制區(qū)進行PCR擴增及DNA測序；以修訂后的劍橋參考序列(revised Cambridge Refrence Sequence; rCRS)為標準比對序列,獲取所有個體線粒體DNA控制區(qū)突變位點；參照已有的世界人群線粒體DNA系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系樹進行單倍型類群劃分；對慢性HBV感染者和健康人群線粒體DNA控制區(qū)突變和單倍型類群的頻率進行統(tǒng)計,識別差異顯著的母系遺傳組份；并結(jié)合患者臨床相關(guān)信息,統(tǒng)計分析線粒體DNA控制區(qū)突變和單倍型類群的頻率與臨床數(shù)據(jù)的相關(guān)性。[結(jié)果]1)線粒體DNA D-loop區(qū)研究結(jié)果：通過對來自云南漢族的117例HBV慢性感染者和130例健康人群外周血線粒體DNA測序并與修訂后的劍橋參考序列比對,獲得247份線粒體DNA控制區(qū)全長1124bp測序序列,病例組共計152個多態(tài)性變異位點,變異率13.52%,高頻突變?yōu)?7個位點(30.72%)；對照組共計163個多態(tài)性位點,變異率14.50%,高頻突變?yōu)?2個位點(31.90%)。通過對247條序列進行單倍型類群劃分,成功劃分單倍型類群者244條(病例組114例,3例未成功進行單倍型類群歸類,對照組130例),共得到21個單倍型類群,分別為M、M*、M7、M8、C、Z、M9、G、D、N9、Y、A、R、R*、R9、F、 B、B4、B5、K、L3*。結(jié)合前人的數(shù)據(jù)進行主成分分析,結(jié)果顯示我們的HBV感染患者和健康人群均來自云南地區(qū)的漢族人群。2)對病例組與對照組突變位點分布的分析顯示2個多態(tài)性位點(m.523-524AC/del、m.16183AC)在慢性HBV感染人群與健康人群中存在顯著差異(P0.05,0OR1)。慢性HBV感染者攜帶m.523-524AC/del突變頻率(27.35%)顯著低于對照組(43.85%)。慢性HBV感染者攜帶m.16183AC突變頻率(11.97%)顯著低于對照組(26.15%)。3)攜帶突變 m.489TC、m.16189TC、m.16223CT、m.16519TCHBV感染人群ALT、AST水平高于健康人群,其中攜帶m.16223CT、m.16519TC位點突變的TP水平在兩組人群中存在差異。4) HBeAg陽性感染者的mtDNA489TC突變頻率(65.71%)顯著高于HBeAg陰性感染者(39.02%),P=0.008, OR=2.995,95%CI (1.31-6.85).5) HBeAg陽性感染者的m.523-524AC/del突變頻率(11.43%)顯著低于HBeAg陰性感染者(31.15%),P=0.012, OR=1.026,95%CI (0.23-2.35).6)線粒體DNA單倍型類群在慢性HBV感染者和健康人群中的分布沒有差異,在HBeAg陽性和HBeAg陰性慢性HBV感染者中的分布未見差異。[結(jié)論]1)線粒體DNA多態(tài)性位點m.16183 AC和 m.523-524AC/del在健康人群中的頻率顯著高于慢性HBV感染者,這兩個位點變異可能為云南漢族慢性HBV感染潛在的保護因素,也可能未攜帶這兩個位點變異使患者對HBV易感。2)HBeAg陽性慢性HBV感染者m.489TC突變頻率顯著高于HBeAg陰性慢性HBV感染者,m.489TC位點可能是部分云南漢族患者HBeAg持續(xù)陽性的危險因素。3)HBeAg陽性慢性HBV感染者m.523-524AC/del突變頻率低于HBeAg陰性慢性HBV感染者,m.523-524AC/del變異可能與HBeAg消失或血清學轉(zhuǎn)換相關(guān)。4)線粒體DNA突變位點與慢性HBV感染的易感性或抗病性需要擴大樣本量驗證。
【關(guān)鍵詞】：乙型肝炎病毒 慢性感染 線粒體DNA 遺傳變異 單倍型類群 相關(guān)性
【學位授予單位】：昆明醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R512.62
【目錄】：

• 縮略詞表5-6
• 中文摘要6-8
• 英文摘要8-11
• 前言11-15
• 材料與方法15-25
• 結(jié)果25-43
• 討論43-48
• 結(jié)論48-49
• 參考文獻49-54
• 附錄54-66
• 綜述66-76
• 參考文獻71-76
• 攻讀學位期間獲得的學術(shù)成果76-77
• 致謝77-78

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 梅善宗,朱承美;HLA單倍型傳遞概率簡便計算法[J];中國法醫(yī)學雜志;1996年04期

2 謝毓濱;王赤林;彭驊;李雙;謝毓湘;;湖南地區(qū)人群HLA單倍型的多態(tài)性研究[J];臨床輸血與檢驗;2006年02期

3 朱文圣;郭建華;;基于單倍型的復雜疾病基因定位研究[J];數(shù)理統(tǒng)計與管理;2009年02期

4 陳芳琦,趙修竹;HLA擴展單倍型及其生物學意義[J];上海免疫學雜志;1992年02期

5 ;人補體第4成分基因在各種HLA單倍型上的結(jié)構(gòu)特點及其規(guī)律性[J];同濟醫(yī)科大學學報;1995年03期

6 潘尚領(lǐng);陳晶;尹瑞興;劉承武;黃齡瑾;陳文成;羅曉秋;陳進超;黃必冠;羅毅;;線粒體DNA單倍型與廣西壯族自治區(qū)巴馬地區(qū)長壽的關(guān)聯(lián)[J];中華老年醫(yī)學雜志;2006年05期

7 陳興國,孔繁華,張蕊芳,金荔;我國藏族人群補體第四成分單倍型的分布分析[J];中國免疫學雜志;1996年01期

8 曾潔,王憬惺,孫水仙,陳強,米新玉,陳雪黎,宋寧,姚志強;四川造血干細胞捐獻者資料庫HLA-A,B,DRB1基因和單倍型研究[J];中國輸血雜志;2005年05期

9 閻淑清;人類苯丙氨酸羥化酶位點的多態(tài)DNA單倍型及其與苯丙酮尿癥的關(guān)系[J];國外醫(yī)學.遺傳學分冊;1988年03期

10 董永利,楊智麗,石宏,高路,魯靖,程寶文,李開源,昝瑞光,肖春杰;云南18個民族Y染色體雙等位基因單倍型頻率的主成分分析[J];遺傳學報;2004年10期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 謝毓濱;王赤林;彭驊;李雙;謝毓湘;;湖南地區(qū)人群HLA單倍型多態(tài)性的研究[A];中國輸血協(xié)會第四屆輸血大會論文集[C];2006年

2 劉立波;趙桂蘋;文杰;陳繼蘭;鄭麥青;;雞MHC B-L基因SNPs單倍型與免疫性狀關(guān)系的研究[A];中國動物遺傳育種研究進展——第十五次全國動物遺傳育種學術(shù)討論會論文集[C];2009年

3 趙書民;繆曉輝;徐文勝;談順良;;HLA-A*0207-B*4601單倍型與HBV持續(xù)感染相關(guān)[A];中華醫(yī)學會第十二次全國病毒性肝炎及肝病學術(shù)會議論文匯編[C];2005年

4 陳爭;張永科;范安;張亞男;吳艷平;趙倩君;周璨林;毛新民;藏玉亮;葉爾哈孜;哈森別克;愛哈布德力;卡馬力亞;梁玲;古力努爾;馬月輝;饒紹奇;;γ染色體單倍型群頻率分布揭示新疆阿勒泰地區(qū)圖瓦人的種族起源[A];中國遺傳學會第八次代表大會暨學術(shù)討論會論文摘要匯編（2004-2008）[C];2008年

5 史磊;史荔;姚宇峰;褚嘉yP;;廣西壯族HLA基因多態(tài)性及單倍型研究[A];第八次全國醫(yī)學遺傳學學術(shù)會議(中華醫(yī)學會2009年醫(yī)學遺傳學年會)論文摘要匯編[C];2009年

6 侯旭敏;范維琥;;β_2腎上腺能受體基因單倍型與心力衰竭的關(guān)系[A];中華醫(yī)學會心血管病分會第八次全國心血管病學術(shù)會議匯編[C];2004年

7 孫昌;張亞平;;海南黎族人群線粒體DNA序列多態(tài)分析[A];中國遺傳學會七屆一次青年研討會暨上海高校模式生物E——研究院第一屆模式生物學術(shù)研討會論文匯編[C];2005年

8 韓凌霞;肖兵兵;牛成明;韓建林;司昌德;曲連東;;中國MHC特異單倍型SPF雞群的建立[A];中國動物遺傳育種研究進展——第十五次全國動物遺傳育種學術(shù)討論會論文集[C];2009年

9 周敏;夏夢娜;張細權(quán);;cVIPR-1基因2個位點單核苷酸多態(tài)性與產(chǎn)蛋量的相關(guān)分析[A];第十次全國畜禽遺傳標記研討會論文集[C];2006年

10 孔慶鵬;姚永剛;孫昌;Hans-Ju rgen Bandelt;朱春齡;張亞平;;基于全序列的東亞人群mtDNA系統(tǒng)發(fā)育及漢族人群的遺傳分化研究[A];中國的遺傳學研究——中國遺傳學會第七次代表大會暨學術(shù)討論會論文摘要匯編[C];2003年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 鐘艷宇 記者 吳紅月;親緣間單倍型移植有了“優(yōu)化選擇法則”[N];科技日報;2014年

2 藺玉紅;單倍型移植治療再障性貧血獲成功[N];光明日報;2007年

3 閆煈;單倍型移植治療重癥再障[N];健康報;2007年

4 本報記者 余戈;狗的老家在中國[N];北京科技報;2004年

5 覃宏武;你了解單倍型移植嗎？[N];中國婦女報;2006年

6 記者 姜澎;長壽取決于基因開關(guān)？[N];文匯報;2009年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 丁克越;不同單倍型塊定義在單倍型塊結(jié)構(gòu)推斷與htSNPs選擇中的效應[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;2004年

2 李紅杰;中國北方古代人群Y染色體遺傳多樣性研究[D];吉林大學;2012年

3 付玉芹;內(nèi)蒙古中南部古代人群的分子遺傳學研究[D];吉林大學;2006年

4 謝承志;新疆塔里木盆地周邊地區(qū)古代人群及山西虞弘墓主人DNA分析[D];吉林大學;2007年

5 洪坤學;中國四個民族HLA-DRB1、DQA1、DQB1基因多態(tài)性研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;1999年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 吳長會;線粒體控制區(qū)的遺傳變異與慢性HBV感染相關(guān)性研究[D];昆明醫(yī)科大學;2016年

2 曾真;基于cpDNA單倍型的銀杏群體遺傳與譜系分析[D];浙江大學;2008年

3 毛偉高;遺傳印記效應檢驗及基于單倍型推斷Hardy-Weinberg平衡律檢驗的統(tǒng)計方法研究[D];南方醫(yī)科大學;2013年

4 成峰;廣東東莞漢族mtDNA遺傳多態(tài)性的研究[D];暨南大學;2007年

5 范積敏;中國南北方人群HLA-DQA1和DQB1基因多態(tài)性研究[D];南昌大學;2013年

6 王洪志;不同雞MHC單倍型的判定及同種異型抗血清的制備[D];揚州大學;2015年

7 趙紅;對含有缺失基因型數(shù)據(jù)的家系進行單倍型推斷的EM方法[D];東北師范大學;2006年

8 陳雪;廣西壯族與海南黎族人群線粒體DNA群體遺傳關(guān)系的研究[D];南方醫(yī)科大學;2011年

9 崔望;基于Hi-C數(shù)據(jù)的單倍型三維空間結(jié)構(gòu)及功能分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學;2015年

10 劉雪香;中國南北方2個漢族人群MICB基因和中國大陸4個人群HLA-E基因群體遺傳學研究[D];中南大學;2012年

，

本文編號：598343