本文關(guān)鍵詞：丙型肝炎病毒基因分型的方法學建立及初步應(yīng)用，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：研究背景丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus, HCV)傳播的主要途徑是血液傳播,能夠引起丙型病毒性肝炎(以下簡稱“丙型肝炎”或“丙肝”).丙肝呈世界范圍內(nèi)流行,在全球范圍內(nèi)的感染率約為2%.HCV的分型是了解該病毒的重要手段之一.一方面,丙肝的治療則須結(jié)合HCV分型結(jié)果制定療程.有研究表明,對于丙肝的6個基因型,干擾素和利巴韋林聯(lián)合治療后的敏感性和預(yù)后均不同.因此對HCV感染者進行HCV分型有助于優(yōu)化療程,合理用藥和減少副作用.同時進行HCV分子流行病學調(diào)查對于了解HCV的傳播特點,在特殊人群和普通人群中的傳播關(guān)系以及傳播鏈有重要作用,有利于開展疾病的監(jiān)測和干預(yù).因此建立HCV分型方法,同時了解HCV不同亞型在特定地區(qū)和人群的流行情況,具有重要的流行病學意義.目的建立HCV分型的in-house PCR分型方法；獲取中國部分地區(qū)特殊人群哨點監(jiān)測人群樣本的基因亞型信息和人口學信息并進行分析；研究與HCV型別分布有關(guān)聯(lián)的因素；比較不同地區(qū)或者不同人群基因亞型分布的差異.方法根據(jù)中國地區(qū)HCV主要亞型(主要是1b,2a,3a,3b,6a)檢索適合中國部分地區(qū)HCV流行株序列,根據(jù)已有序列設(shè)計合適的引物首先進行小樣本評估擴增效率,然后對HCV抗體陽性的樣本的NS5B區(qū)進行擴增.所得序列選用合適的參考序列和模型做系統(tǒng)進化樹,得到樣本的亞型和傳播關(guān)系方面的信息,結(jié)合人口學資料進行分析.分類資料采用卡方檢驗,計量資料采用t檢驗或者非參數(shù)檢驗結(jié)果所選引物使用小樣本評估擴增效率,所選的22份HCV RNA陽性樣本中,擴增成功20例.可以用于后續(xù)大樣本研究.本研究共采集樣本1315份,其中抗體陽性樣本389份,這389份繼續(xù)進行NS5B區(qū)擴增,最終獲得可用序列225條,其中廣西地區(qū)135條,北京地區(qū)22條,江西地區(qū)22條,湖南地區(qū)46條.4個地區(qū)采樣人群的亞型分布如下：廣西,la 6, 1b 38,3a 22,3b 14,6a 37,6e 2,另有16份樣本未確定基因型；湖南,lb 2,3a 11,3b 16,6a 17;北京,lb 15,2a,6a 1；江西,1b17,2a 5.結(jié)論1.采樣的四個地區(qū)的基因亞型分布差異較大；2.北京出入境人群,江西地區(qū)腎透析人群仍然以1b,2a亞型為主；廣西暗娼人群和女子監(jiān)獄人群,湖南地區(qū)吸毒人群6a比例非常大;廣西地區(qū)暗娼人群和女子監(jiān)獄人群極少見2型HCV感染者,湖南地區(qū)吸毒人群1b亞型感染者少見；3.自建in-house HCV分型方法能夠滿足科研的需要,效果要優(yōu)于其他方法.
【關(guān)鍵詞】：
【學位授予單位】：中國疾病預(yù)防控制中心
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：R512.63
【目錄】：

• 縮略詞表6-7
• 中文摘要7-8
• Abstract8-11
• 1. 前言11-19
• 1.1 HCV概況11-13
• 1.2 HCV分型方法13-14
• 1.3 分型區(qū)段的選擇14
• 1.4 進化樹的構(gòu)建14-15
• 1.5 HCV基因型與治療15-18
• 1.6 HCV的預(yù)防18-19
• 2. 材料與方法19-35
• 2.1 樣本19
• 2.2 參考序列19-21
• 2.3 試劑21
• 2.4 主要儀器21-22
• 2.5 主要耗材22
• 2.6 方法22-35
• 3. 結(jié)果35-40
• 3.1 分型方法的驗證35
• 3.2 所收集樣本的人口學資料以及分型結(jié)果35-40
• 4. 討論40-46
• 4.1 分型方法40-41
• 4.2 廣西壯族自治區(qū)樣本結(jié)果討論41-44
• 4.3 湖南省樣本結(jié)果討論44
• 4.4 北京出入境樣本結(jié)果討論44-45
• 4.5 江西樣本結(jié)果討論45-46
• 5. 結(jié)論46-47
• 參考文獻47-50
• 綜述：HCV基因分型方法研究進展50-59
• 參考文獻54-59
• 致謝59-61
• 附錄61-74
• 附錄161-65
• 附錄265-74
• 發(fā)表文章74-78

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