研究背景及目的:近年來結(jié)核病再次呈現(xiàn)區(qū)域性暴發(fā)的趨勢,全球每年新增確診肺結(jié)核患者多達856萬例,其中5-15%的患者發(fā)展成活動性肺結(jié)核。在結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)感染肺部后,機體產(chǎn)生的一系列免疫應(yīng)答對活動性肺結(jié)核的發(fā)生及發(fā)展至關(guān)重要。同時,結(jié)核分枝桿菌的基因型與表達型差異變化巨大,傳統(tǒng)著眼于單一分子變化的“還原論”研究模式以及目前臨床應(yīng)用的結(jié)核診斷靶標已經(jīng)無法滿足當下結(jié)核感染早期診斷的需求。因此,整合多學科優(yōu)勢,構(gòu)建活動期肺結(jié)核免疫應(yīng)答基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),高通量篩選體液中結(jié)核感染的診斷靶標,對深入探究人感染結(jié)核分枝桿菌后的特異性免疫應(yīng)答機制具有重要意義,并為結(jié)核病臨床早期診斷研究以及特效新藥的研發(fā)奠定基礎(chǔ)。材料及方法:通過NCBI的GEO Datasets數(shù)據(jù)庫,篩選獲得活動期肺結(jié)核患者體液(全血)基因表達譜數(shù)據(jù)構(gòu)成原始數(shù)據(jù)集,運用R語言Limma包中線性模型-經(jīng)驗貝葉斯統(tǒng)計的方法結(jié)合傳統(tǒng)t-檢驗對表達譜數(shù)據(jù)實施非特異性過濾,篩選出差異表達的基因。應(yīng)用DAVID(Database for Annotation,Visualization an...

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
英文縮寫詞表
第1章 緒論
    1.1 肺結(jié)核病的概述
        1.1.1 肺結(jié)核病的流行現(xiàn)狀
        1.1.2 肺結(jié)核病的臨床診斷現(xiàn)狀
        1.1.3 肺結(jié)核病的免疫學概況
    1.2 基因芯片技術(shù)的概述
        1.2.1 基因芯片技術(shù)
        1.2.2 基因芯片技術(shù)應(yīng)用于基因表達分析研究
        1.2.3 基因芯片技術(shù)應(yīng)用于疾病機制研究
        1.2.4 基因芯片技術(shù)應(yīng)用于基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究
    1.3 基因芯片數(shù)據(jù)的分析
        1.3.1 差異基因表達分析
        1.3.2 聚類分析
        1.3.3 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
    1.4 轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的概述
        1.4.1 轉(zhuǎn)錄因子
        1.4.2 轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控作用
        1.4.3 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究現(xiàn)狀
        1.4.4 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的模型
        1.4.5 轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)建立的意義及應(yīng)用
第2章 活動期肺結(jié)核基因芯片數(shù)據(jù)的收集與分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 方法
    2.2 實驗結(jié)果
        2.2.1 基因芯片數(shù)據(jù)的檢索與分析結(jié)果
        2.2.2 差異基因的功能分析
        2.2.3 差異基因的信號通路分析
        2.2.4 差異基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及分析
    2.3 本章小結(jié)
第3章 實驗研究及活動期肺結(jié)核血液診斷基因集的初步建立
    3.1 材料與方法
        3.1.1 實驗材料
        3.1.2 實驗方法
    3.2 實驗結(jié)果
        3.2.1 RNA純度及濃度的測定
        3.2.2 qPCR驗證基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中SPI1、CEBPB、FCGR1A和ICAM1 mRNA的表達情況
        3.2.3 qPCR驗證基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中SPI1、CEBPB、FCGR1A和ICAM1 mRNA的表達水平
        3.2.4 血液診斷基因集的初步建立
    3.3 本章小結(jié)
第4章 討論
第5章 結(jié)論
參考文獻
附錄
作者簡介
致謝



本文編號：4022626