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中山市2014年麻疹病毒分子生物學(xué)特征分析

發(fā)布時(shí)間:2024-03-16 12:00
  目的麻疹病毒學(xué)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)表明,H1基因型是中國(guó)本土優(yōu)勢(shì)基因型。本研究分析廣東省中山市2014年麻疹病毒分子生物學(xué)流行特征,為麻疹消除策略修訂或制定提供數(shù)據(jù)依據(jù)。方法采集廣東省中山市2014-01-01-2014-12-31全年疑似患者的急性期咽拭子,通過RT-PCR和基因測(cè)序分析N基因碳末端450個(gè)核苷酸片段;應(yīng)用BLASTn對(duì)序列進(jìn)行相似性檢索,分析麻疹病毒基因特征,并與WHO推薦的參考株進(jìn)行對(duì)比;采用MEGA對(duì)麻疹核蛋白核苷酸構(gòu)建NJ種系進(jìn)化樹。結(jié)果廣東省中山市麻疹監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室收檢疑似麻疹咽拭子306份,核酸陽(yáng)性213份,陽(yáng)性率69.61%。對(duì)213份咽拭子核酸陽(yáng)性樣品進(jìn)行病毒分離,共分離出98株麻疹病毒,病毒分離率46.01%。除zhongshan2014-5為D8基因型外,其他均是H1基因型。zhongshan2014-5與越南病毒株(Viet Nam:Ho Chi Minh CityAB928200)序列同源性100%,屬于D8型。結(jié)論 H1基因型是中山市2014年流行麻疹病毒的絕對(duì)優(yōu)勢(shì)基因型,中山市首次發(fā)現(xiàn)輸入性D8型麻疹病毒感染病例。

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【部分圖文】:

圖1基于麻疹病毒核蛋白基因碳末端450個(gè)核苷酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

圖1基于麻疹病毒核蛋白基因碳末端450個(gè)核苷酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

Xu等[10]首次對(duì)中國(guó)4個(gè)。ㄗ灾螀^(qū)和直轄市)1993-1994年流行的麻疹野病毒基因型監(jiān)測(cè),并發(fā)現(xiàn)了新的基因型H1和H2。隨后國(guó)內(nèi)20個(gè)省進(jìn)行8年的麻疹病毒學(xué)監(jiān)測(cè),結(jié)果表明,H1基因型是中國(guó)本土優(yōu)勢(shì)基因型[11]。為了解中山市本土麻疹優(yōu)勢(shì)基因流行株,對(duì)2014年本市麻疹核酸陽(yáng)....



本文編號(hào):3929627

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