中山市2014年麻疹病毒分子生物學(xué)特征分析
發(fā)布時間:2024-03-16 12:00
目的麻疹病毒學(xué)監(jiān)測數(shù)據(jù)表明,H1基因型是中國本土優(yōu)勢基因型。本研究分析廣東省中山市2014年麻疹病毒分子生物學(xué)流行特征,為麻疹消除策略修訂或制定提供數(shù)據(jù)依據(jù)。方法采集廣東省中山市2014-01-01-2014-12-31全年疑似患者的急性期咽拭子,通過RT-PCR和基因測序分析N基因碳末端450個核苷酸片段;應(yīng)用BLASTn對序列進(jìn)行相似性檢索,分析麻疹病毒基因特征,并與WHO推薦的參考株進(jìn)行對比;采用MEGA對麻疹核蛋白核苷酸構(gòu)建NJ種系進(jìn)化樹。結(jié)果廣東省中山市麻疹監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室收檢疑似麻疹咽拭子306份,核酸陽性213份,陽性率69.61%。對213份咽拭子核酸陽性樣品進(jìn)行病毒分離,共分離出98株麻疹病毒,病毒分離率46.01%。除zhongshan2014-5為D8基因型外,其他均是H1基因型。zhongshan2014-5與越南病毒株(Viet Nam:Ho Chi Minh CityAB928200)序列同源性100%,屬于D8型。結(jié)論 H1基因型是中山市2014年流行麻疹病毒的絕對優(yōu)勢基因型,中山市首次發(fā)現(xiàn)輸入性D8型麻疹病毒感染病例。
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【部分圖文】:
本文編號:3929627
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圖1基于麻疹病毒核蛋白基因碳末端450個核苷酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
Xu等[10]首次對中國4個。ㄗ灾螀^(qū)和直轄市)1993-1994年流行的麻疹野病毒基因型監(jiān)測,并發(fā)現(xiàn)了新的基因型H1和H2。隨后國內(nèi)20個省進(jìn)行8年的麻疹病毒學(xué)監(jiān)測,結(jié)果表明,H1基因型是中國本土優(yōu)勢基因型[11]。為了解中山市本土麻疹優(yōu)勢基因流行株,對2014年本市麻疹核酸陽....
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