<正>基因組規(guī)模代謝模型(genome-scale metabolic model,GSMM)是通過整合基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、文獻(xiàn)組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)以及代謝組學(xué)等多組學(xué)數(shù)據(jù),建立基因-蛋白質(zhì)(酶)-生化反應(yīng)關(guān)聯(lián)組成的特定微生物代謝網(wǎng)絡(luò)^[1]。GSMM將從基因組獲得的生化反應(yīng)信息與代謝表型進(jìn)行橋接,為從系統(tǒng)上理解微生物生理代謝功能模型提供一個(gè)高效平臺(tái)^[2]。GSMM最初主要應(yīng)用于工業(yè)微生物制造

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 GSMM的構(gòu)建
    1.1 粗略模型的構(gòu)建(creating a draft reconstruction)
    1.2 重構(gòu)模型的手工修正(manual reconstruction refinement)
    1.3 重構(gòu)的代謝網(wǎng)絡(luò)向數(shù)學(xué)模型的轉(zhuǎn)化(conversion from reconstruction to mathematical model)
    1.4 模型的評(píng)估(evaluation of the model)
2 通過GSMM揭示細(xì)菌感染機(jī)制
3 通過GSMM揭示抗生素作用機(jī)制
4 通過GSMM發(fā)現(xiàn)抗菌治療新靶標(biāo)
5 總結(jié)



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