基因組規(guī)模代謝模型在細菌感染治療領(lǐng)域的研究進展
發(fā)布時間:2024-01-27 06:36
<正>基因組規(guī)模代謝模型(genome-scale metabolic model,GSMM)是通過整合基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、文獻組學、蛋白質(zhì)組學以及代謝組學等多組學數(shù)據(jù),建立基因-蛋白質(zhì)(酶)-生化反應(yīng)關(guān)聯(lián)組成的特定微生物代謝網(wǎng)絡(luò)[1]。GSMM將從基因組獲得的生化反應(yīng)信息與代謝表型進行橋接,為從系統(tǒng)上理解微生物生理代謝功能模型提供一個高效平臺[2]。GSMM最初主要應(yīng)用于工業(yè)微生物制造
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 GSMM的構(gòu)建
1.1 粗略模型的構(gòu)建(creating a draft reconstruction)
1.2 重構(gòu)模型的手工修正(manual reconstruction refinement)
1.3 重構(gòu)的代謝網(wǎng)絡(luò)向數(shù)學模型的轉(zhuǎn)化(conversion from reconstruction to mathematical model)
1.4 模型的評估(evaluation of the model)
2 通過GSMM揭示細菌感染機制
3 通過GSMM揭示抗生素作用機制
4 通過GSMM發(fā)現(xiàn)抗菌治療新靶標
5 總結(jié)
本文編號:3886489
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 GSMM的構(gòu)建
1.1 粗略模型的構(gòu)建(creating a draft reconstruction)
1.2 重構(gòu)模型的手工修正(manual reconstruction refinement)
1.3 重構(gòu)的代謝網(wǎng)絡(luò)向數(shù)學模型的轉(zhuǎn)化(conversion from reconstruction to mathematical model)
1.4 模型的評估(evaluation of the model)
2 通過GSMM揭示細菌感染機制
3 通過GSMM揭示抗生素作用機制
4 通過GSMM發(fā)現(xiàn)抗菌治療新靶標
5 總結(jié)
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