Pvs48/45和Pvs47蛋白在中緬邊境地區(qū)的基因多態(tài)性和種群遺傳學(xué)特點(diǎn)研究
發(fā)布時(shí)間:2023-05-04 05:54
目的:由于休眠體的存在和配子體導(dǎo)致的無癥狀傳播,間日瘧原蟲已成為瘧疾消除的重要障礙之一。全球50%以上的間日瘧原蟲感染負(fù)擔(dān)發(fā)生在東南亞地區(qū),特別是大湄公河次區(qū)域(the Greater Mekong Subregion,GMS),中緬邊境就是受威脅地區(qū)之一,該地區(qū)也是我國輸入性瘧疾的重要來源。自2014年以來,GMS的瘧疾下降率開始停滯不前甚至出現(xiàn)逆轉(zhuǎn)趨勢。為了改變這種現(xiàn)狀,各國開始著重開發(fā)傳播阻斷疫苗(Transmission-blocking vaccines,TBVs)。TBVs以瘧原蟲的有性階段為目標(biāo),且TBVs候選抗原的多態(tài)性十分有限,這為開發(fā)廣泛有效的瘧疾疫苗帶來了可能。配子體是瘧原蟲從宿主感染按蚊的唯一發(fā)育階段,因此配子體表面蛋白是重要的TBVs候選抗原。P48/45和P47均是配子體表面蛋白,其中P48/45對雄配子的受精發(fā)揮不可或缺的作用,而P47不僅在雌配子的優(yōu)化受精中發(fā)揮重要作用,還能夠協(xié)助瘧原蟲逃避當(dāng)?shù)匚妹降拿庖呦到y(tǒng)。在確定了抗原功能的基礎(chǔ)之上,研究編碼基因的遺傳多樣性是開發(fā)疫苗的重要內(nèi)容之一。然而,近幾年在中緬邊境缺乏對Pvs48/45多樣性的研究;且在中緬邊...
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞
1 前言
2 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 主要試劑
2.1.2 主要儀器
2.1.3 研究地點(diǎn)以及樣本
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 生物信息學(xué)分析網(wǎng)址及軟件
2.2.2 濾紙血樣本的處理
2.2.3 基因組DNA的提取
2.2.4 基因組DNA擴(kuò)增
2.2.5 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳
2.2.6 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測序
2.2.7 Pvs48/45與Pvs47 遺傳多樣性特點(diǎn)分析
3 結(jié)果
3.1 Pvs48/45和Pvs47 基因擴(kuò)增結(jié)果
3.2 Pvs48/45和Pvs47 基因多態(tài)性分析
3.2.1 Pvs48/45在中緬邊境地區(qū)的突變、基因多態(tài)性和單倍型
3.2.2 Pvs47在中緬邊境地區(qū)的突變、基因多態(tài)性和單倍型
3.3 Pvs48/45和Pvs47 偏離中立性檢驗(yàn)
3.3.1 Pvs48/45物種內(nèi)和物種間中性檢驗(yàn)結(jié)果
3.3.2 Pvs47物種內(nèi)和物種間中性檢驗(yàn)結(jié)果
3.4 重組和連鎖不平衡
3.4.1 Pvs48/45重組和連鎖不平衡
3.4.2 Pvs47重組和連鎖不平衡
3.5 種群分化和種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.5.1 Pvs48/45種群分化和種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.5.2 Pvs47種群分化和種群遺傳結(jié)構(gòu)
3.6 全球單倍型網(wǎng)絡(luò)
3.6.1 Pvs48/45全球單倍型網(wǎng)絡(luò)
3.6.2 Pvs47全球單倍型網(wǎng)絡(luò)
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性和自我評價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡歷
本文編號:3808085
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
Abstract
英文縮略詞
1 前言
2 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 主要試劑
2.1.2 主要儀器
2.1.3 研究地點(diǎn)以及樣本
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 生物信息學(xué)分析網(wǎng)址及軟件
2.2.2 濾紙血樣本的處理
2.2.3 基因組DNA的提取
2.2.4 基因組DNA擴(kuò)增
2.2.5 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳
2.2.6 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測序
2.2.7 Pvs48/45與Pvs47 遺傳多樣性特點(diǎn)分析
3 結(jié)果
3.1 Pvs48/45和Pvs47 基因擴(kuò)增結(jié)果
3.2 Pvs48/45和Pvs47 基因多態(tài)性分析
3.2.1 Pvs48/45在中緬邊境地區(qū)的突變、基因多態(tài)性和單倍型
3.2.2 Pvs47在中緬邊境地區(qū)的突變、基因多態(tài)性和單倍型
3.3 Pvs48/45和Pvs47 偏離中立性檢驗(yàn)
3.3.1 Pvs48/45物種內(nèi)和物種間中性檢驗(yàn)結(jié)果
3.3.2 Pvs47物種內(nèi)和物種間中性檢驗(yàn)結(jié)果
3.4 重組和連鎖不平衡
3.4.1 Pvs48/45重組和連鎖不平衡
3.4.2 Pvs47重組和連鎖不平衡
3.5 種群分化和種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.5.1 Pvs48/45種群分化和種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.5.2 Pvs47種群分化和種群遺傳結(jié)構(gòu)
3.6 全球單倍型網(wǎng)絡(luò)
3.6.1 Pvs48/45全球單倍型網(wǎng)絡(luò)
3.6.2 Pvs47全球單倍型網(wǎng)絡(luò)
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性和自我評價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
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本文編號:3808085
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