宿主蛋白CLDN12和UGGT1參與丙肝病毒入侵的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2022-10-15 14:45
丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)是肝炎、肝硬化甚至肝癌等肝臟疾病的主要致病因素之一。HCV患者多、傳播廣、變異快等特點(diǎn)為其治療帶來了難度。目前HCV主要治療手段是通過直接抗病毒藥物DAA,而靶向HCV宿主因子是另一種抗HCV的策略,人類尚沒有研制出針對(duì)HCV的有效疫苗。HCV生命周期的主要步驟包括病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞,病毒基因組的脫殼,病毒蛋白的翻譯,病毒基因組的復(fù)制以及病毒微粒的組裝和釋放。其中病毒進(jìn)入細(xì)胞的過程由多種共受體介導(dǎo),如CLDN1、CD81、SR-BI及Occludin等。在本論文中,我們確定了 CLDN12和UGGT1可以作為宿主因子在HCV進(jìn)入過程中發(fā)揮重要作用。實(shí)驗(yàn)表明,敲降CLDN12可以抑制HCV進(jìn)入細(xì)胞,而過表達(dá)CLDN12可以促進(jìn)HCV進(jìn)入細(xì)胞。因此我們猜測(cè)CLDN12是HCV的一個(gè)共受體。同時(shí)我們發(fā)現(xiàn),CLDN12同另一個(gè)HCV共受體CLDN1一樣,可以與共受體CD81結(jié)合,這從另一方面支持了我們的假設(shè)。此外,CLDN12與claudins家族蛋白CLDN1、CLDN6、CLDN9一樣,可以和COPⅡ運(yùn)輸途徑中關(guān)鍵的貨物分選蛋白Sec...
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
1 HCV簡(jiǎn)介
1.1 HCV及其發(fā)病率和治療現(xiàn)狀
1.2 HCV的基因分型
1.3 HCV病毒基因組
1.4 HCV的生命周期
1.5 HCV entry過程
2 Claudins以及CLDN12
3 SR-BI
4 糖基化和N糖基化
5 UGGTI
6 研究?jī)?nèi)容概述
材料與方法
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 細(xì)胞
1.2 質(zhì)粒
1.3 抗體
1.4 細(xì)胞培養(yǎng)相關(guān)
1.5 固體化學(xué)藥品
1.6 液體試劑
1.7 SiRNA序列
1.8 Q-PCR引物
1.9 試劑盒
1.10 Buffer配方
1.11 實(shí)驗(yàn)儀器與耗材
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2 HCV病毒株Jcl和假病毒HCVpp的制備
2.3 免疫印跡
2.4 免疫共沉淀
2.5 原核蛋白的表達(dá)與純化
2.6 GST-pull down
2.7 免疫熒光
2.8 Q-PCR
2.9 分子克隆及點(diǎn)突變
2.10 敲降實(shí)驗(yàn)
2.11 蛋白質(zhì)折疊測(cè)定
2.12 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計(jì)
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
第一部分
1.1 CLDN12是HCV共受體
1.1.1 CLDN 12促進(jìn)HCV侵染宿主細(xì)胞
1.1.2 CLDN12和CD81的相互作用
1.2 CLDN12是COPⅡ貨物
1.2.1 CLDN12 tail與Sec24C相互作用
1.2.2 COPⅡ影響CLDN12定位
1.3 宿主因子CLDN12的N-糖基化影響HCV
1.3.1 CLDN12發(fā)生N-糖基化
1.3.2 CLDN12的N-糖基化影響CLDN12細(xì)胞內(nèi)分布
第一部分 總結(jié)
第二部分
2.1 SR-BI與UGGT1和Calnexin的相互作用
2.1.1 質(zhì)譜鑒定分析SR-BI與UGGT1和Calnexin的相互作用
2.1.2 Co-IP驗(yàn)證SR-BI與UGGT1和Calnexin相互作用
2.1.3 SR-BI在Huh7.5.1細(xì)胞中與UGGT1和Calnexin存在共定位
2.2 SR-BI的N-糖基化
2.2.1 SR-BI蛋白水平依賴于UGGT1和N-糖基化
2.2.2 預(yù)測(cè)的九個(gè)位點(diǎn)均參與SR-BI的N-糖基化
2.3 UGGT1升高SR-BI水平,促進(jìn)HCV感染
2.4 SR-BI促進(jìn)UGGT1介導(dǎo)的蛋白質(zhì)折疊
第二部分 總結(jié)
討論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
縮略語
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]丙型肝炎病毒非結(jié)構(gòu)蛋白與宿主細(xì)胞蛋白相互作用的研究進(jìn)展[J]. 張丹,馮國和. 世界華人消化雜志. 2011(02)
[2]四跨膜蛋白超家族與肝炎病毒的關(guān)系[J]. 張黎穎,成軍,紀(jì)冬,劉妍,黨曉燕,王春花,鄧紅,劉敏. 胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志. 2004(01)
碩士論文
[1]基孔肯雅病毒nsP1蛋白棕櫚酰化的研究[D]. 張娜.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2018
[2]病毒蛋白NS3、K7及2C與宿主蛋白相互作用的研究[D]. 李葉.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2018
[3]不同基因型的丙肝病毒NS5A蛋白與PI4KB競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合ACBD3的研究[D]. 楊小潔.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
本文編號(hào):3691496
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
1 HCV簡(jiǎn)介
1.1 HCV及其發(fā)病率和治療現(xiàn)狀
1.2 HCV的基因分型
1.3 HCV病毒基因組
1.4 HCV的生命周期
1.5 HCV entry過程
2 Claudins以及CLDN12
3 SR-BI
4 糖基化和N糖基化
5 UGGTI
6 研究?jī)?nèi)容概述
材料與方法
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 細(xì)胞
1.2 質(zhì)粒
1.3 抗體
1.4 細(xì)胞培養(yǎng)相關(guān)
1.5 固體化學(xué)藥品
1.6 液體試劑
1.7 SiRNA序列
1.8 Q-PCR引物
1.9 試劑盒
1.10 Buffer配方
1.11 實(shí)驗(yàn)儀器與耗材
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2 HCV病毒株Jcl和假病毒HCVpp的制備
2.3 免疫印跡
2.4 免疫共沉淀
2.5 原核蛋白的表達(dá)與純化
2.6 GST-pull down
2.7 免疫熒光
2.8 Q-PCR
2.9 分子克隆及點(diǎn)突變
2.10 敲降實(shí)驗(yàn)
2.11 蛋白質(zhì)折疊測(cè)定
2.12 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計(jì)
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
第一部分
1.1 CLDN12是HCV共受體
1.1.1 CLDN 12促進(jìn)HCV侵染宿主細(xì)胞
1.1.2 CLDN12和CD81的相互作用
1.2 CLDN12是COPⅡ貨物
1.2.1 CLDN12 tail與Sec24C相互作用
1.2.2 COPⅡ影響CLDN12定位
1.3 宿主因子CLDN12的N-糖基化影響HCV
1.3.1 CLDN12發(fā)生N-糖基化
1.3.2 CLDN12的N-糖基化影響CLDN12細(xì)胞內(nèi)分布
第一部分 總結(jié)
第二部分
2.1 SR-BI與UGGT1和Calnexin的相互作用
2.1.1 質(zhì)譜鑒定分析SR-BI與UGGT1和Calnexin的相互作用
2.1.2 Co-IP驗(yàn)證SR-BI與UGGT1和Calnexin相互作用
2.1.3 SR-BI在Huh7.5.1細(xì)胞中與UGGT1和Calnexin存在共定位
2.2 SR-BI的N-糖基化
2.2.1 SR-BI蛋白水平依賴于UGGT1和N-糖基化
2.2.2 預(yù)測(cè)的九個(gè)位點(diǎn)均參與SR-BI的N-糖基化
2.3 UGGT1升高SR-BI水平,促進(jìn)HCV感染
2.4 SR-BI促進(jìn)UGGT1介導(dǎo)的蛋白質(zhì)折疊
第二部分 總結(jié)
討論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
縮略語
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]丙型肝炎病毒非結(jié)構(gòu)蛋白與宿主細(xì)胞蛋白相互作用的研究進(jìn)展[J]. 張丹,馮國和. 世界華人消化雜志. 2011(02)
[2]四跨膜蛋白超家族與肝炎病毒的關(guān)系[J]. 張黎穎,成軍,紀(jì)冬,劉妍,黨曉燕,王春花,鄧紅,劉敏. 胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志. 2004(01)
碩士論文
[1]基孔肯雅病毒nsP1蛋白棕櫚酰化的研究[D]. 張娜.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2018
[2]病毒蛋白NS3、K7及2C與宿主蛋白相互作用的研究[D]. 李葉.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2018
[3]不同基因型的丙肝病毒NS5A蛋白與PI4KB競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合ACBD3的研究[D]. 楊小潔.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
本文編號(hào):3691496
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