目的:分析2008²015年廣州市男男性行為者（Men who have sex with men,MSM）中艾滋病病毒Ⅰ型（Human immunodeficiency virus type 1,HIV-1）感染者的基因亞型和耐藥性（Drug resistance,DR）的分布特征與流行趨勢。方法:收集現(xiàn)住址為廣州市、經(jīng)男男性行為途徑傳播感染、2008²015年在廣州市新確證為HIV-1抗體陽性且樣本量大于140μl的血清樣本。從收集的血清樣本中提取HIV-1病毒RNA,采用巢式聚合酶鏈反應(yīng)（Polymerase chain reaction,PCR）擴(kuò)增病毒RNA的pol區(qū)全部蛋白酶基因（PR）和部分逆轉(zhuǎn)錄酶基因（RT）序列片段,將擴(kuò)增成功的PCR產(chǎn)物送至第三方檢測公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果通過Chromas軟件進(jìn)行查看、編輯和拼接。HIV-1基因亞型通過FastTree 2.1.8軟件的最大似然法（Maximum-likelihood,ML）構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹進(jìn)行確定,HIV-1耐藥情況通過將拼接成功的序列導(dǎo)入美國斯坦福大學(xué)HIV耐藥數(shù)據(jù)庫（h... 

【文章來源】：廣東藥科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

HIV-1基因亞型種類分布特征

圖 1 HIV-1 的基因組結(jié)構(gòu)及對應(yīng)的 HXB2 位置示意圖4.2 HIV-1 基因分型我國目前流行的 HIV-1 毒株亞型種類較多，主要流行亞型有 B、CRF01_AE、CRF07_BC 和 CRF08_BC，并傾向以重組毒株為主[3]，且不同傳播途徑感染人群毒株亞型分布也有明顯差異，血液傳播人群以 B 亞型為主，性傳播人群以 AE 亞型為主[4-8]。已有研究結(jié)果顯示，截止到 2015 年，我國性傳播人群的 HIV-1 基因亞型流行趨勢是 B 亞型呈下降趨勢，CRF01_AE 和 CRF07_BC 呈上升趨勢[9]。自 2004 年以來，我國 HIV-1 感染者中 MSM 者所占比率明顯增加[10]，所有結(jié)果都顯示 CRF01_AE 亞型是我國目前 HIV-1 流行的優(yōu)勢毒株。了解 HIV-1 基因亞型的分布情況與流行趨勢，不僅有助于追蹤 HIV-1 傳染源和提前制定預(yù)防控制措施，其在病因?qū)W研究、耐藥性分析、抗病毒藥物治療及疫苗研制等方面都具有重要作用。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]2016年12月全國艾滋病性病疫情[J]. NCAIDS;NCSTD;China CDC;.  中國艾滋病性病. 2017(02)
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博士論文
[1]我國部分地區(qū)HIV-1傳播耐藥分析及深度測序?qū)^發(fā)性耐藥的研究[D]. 童翾.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2014



本文編號：3630799