廣西三城市HIV-1型流行毒株gag基因亞型分析
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【摘要】:目的了解廣西2008年及以后確診的HIV-1感染者流行病學及HIV-1亞型分布情況,從而進一步掌握廣西最近的HIV-1流行毒株的分布規(guī)律、感染來源,并大體推測出其流行和蔓延規(guī)律,為廣西艾滋病的預防控制策略的制定提供依據(jù),甚至為全國的艾滋病預防控制工作的開展提供有價值的參考資料。方法分別在桂林、來賓、欽州采取樣本100例、102例和103例,所有研究對象都經(jīng)WB實驗確認為HIV-1感染者。對研究對象進行問卷調查、收集流行病學資料,包括病人基本信息(年齡、性別、職業(yè)、文化程度等)、有可能的感染途徑、確診時間、最近一次的病毒載量等;采集抗凝全血10mL、提取病毒RNA、用RT-PCR進行gag基因擴增并將陽性擴增產(chǎn)物送北京博邁德公司進行Sanger法測序,然后采用Bioedit、Simplot和MEGA 5.05等相關生物學軟件對所得序列進行序列的比對校正、亞型分析和系統(tǒng)進化分析。結果1.研究對象共305人,流行病學特征統(tǒng)計如下:⑴男性多于女性,男性患者占66.56%(203/305),女性患者占33.44%(102/305),男女比例為1.99:1(203/102);⑵20~49歲年齡組患者占56.72%(173/305),≥50歲年齡組患者的構成比達到44.62%(130/305);⑶農(nóng)民所占比例最大,超過了一半,為50.82%(155/305),其次為家務及待業(yè)人員13.77%(42/305)、工人及民工12.13%(37/305),學生和離退休人分別占到了2.3%(7/305)和5.57%(17/305);⑷初中及以下學歷人數(shù)的構成比為76.39%(233/305),大專及以上學歷人數(shù)占到了4.92%(15/305);⑸異性性接觸傳播占絕大部分為95.74%(292/305),同性性傳播、注射毒品傳播所占比例較小;⑹已婚人數(shù)占67.87%(207/305);未婚、離異或喪偶分別占16.72%(51/305)和14.75%(45/305)。2.擴增與測序概況:共305份血漿樣本,成功擴增gag區(qū)175例;測序成功得到基因序列155份。3.亞型判定及分布⑴最終成功擴增得到155份樣本的gag基因序列,共發(fā)現(xiàn)4種亞型:CRF01-AE亞型124例,CRF07-BC亞型12例,CRF08-BC亞型14例,B亞型5例。⑵各地區(qū)均以CRF01_AE為主,5例B亞型均分布在桂林地區(qū),CRF07-BC亞型、CRF08-BC亞型在各地區(qū)均有分布。結論1.根據(jù)流行病學資料結果,我們可以得出以下結論:應重視女性性病的治療、更加重視婚檢、孕檢的艾滋病抗體篩查,關注老年人、學生經(jīng)性接觸感染艾滋病的現(xiàn)象,加大對已婚患者的監(jiān)管力度,采取針對低文化水平人群的有效防治措施。2.通過對廣西三城市HIV-1流行毒株gag區(qū)的擴增測序結果,我們發(fā)現(xiàn)了4種亞型:CRF01-AE亞型124例,CRF07-BC亞型12例,CRF08-BC亞型14例,B亞型5例,提示廣西地區(qū)HIV-1流行毒株存在亞型多樣性。3.廣西各地區(qū)以異性性接觸傳播為主要傳播途徑,主要流行亞型為CRF01_AE,可能來自于國內毒株。隨著主要傳播途徑和亞型的變化,迫切需要對高危人群進行宣傳教育和行為干預以阻斷HIV/AIDS的流行和傳播。4.從分子水平上證實了廣西地區(qū)的HIV-1流行毒株亞型和感染途徑存在多樣性。
【關鍵詞】:HIV-1 流行特征 亞型 gag基因
【學位授予單位】:桂林醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R512.91
【目錄】:
- 中文摘要5-7
- ABSTRACT7-10
- 英漢縮略詞對照表10-11
- 前言11-16
- 1 實驗材料16-19
- 1.1 研究對象16
- 1.2 主要實驗儀器16-17
- 1.3 主要實驗試劑17-18
- 1.4 主要耗材18
- 1.5 相關軟件18-19
- 2 實驗方法19-23
- 2.1 提取血漿病毒RNA19-20
- 2.2 逆轉錄/巢式PCR(RT/Nest-PCR)20-22
- 2.3 序列分析22-23
- 3 結果23-27
- 3.1 gag區(qū)電泳圖23
- 3.2 流行病學調查結果23-24
- 3.3 基因分型結果24-27
- 4 結論27-29
- 參考文獻29-33
- 綜述33-42
- 參考文獻39-42
- 攻讀學位期間發(fā)表的學術論文目錄42-43
- 致謝43-44
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