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廣西三城市HIV-1型流行毒株gag基因亞型分析

發(fā)布時間:2017-05-09 20:12

  本文關(guān)鍵詞:廣西三城市HIV-1型流行毒株gag基因亞型分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的了解廣西2008年及以后確診的HIV-1感染者流行病學(xué)及HIV-1亞型分布情況,從而進(jìn)一步掌握廣西最近的HIV-1流行毒株的分布規(guī)律、感染來源,并大體推測出其流行和蔓延規(guī)律,為廣西艾滋病的預(yù)防控制策略的制定提供依據(jù),甚至為全國的艾滋病預(yù)防控制工作的開展提供有價值的參考資料。方法分別在桂林、來賓、欽州采取樣本100例、102例和103例,所有研究對象都經(jīng)WB實(shí)驗(yàn)確認(rèn)為HIV-1感染者。對研究對象進(jìn)行問卷調(diào)查、收集流行病學(xué)資料,包括病人基本信息(年齡、性別、職業(yè)、文化程度等)、有可能的感染途徑、確診時間、最近一次的病毒載量等;采集抗凝全血10mL、提取病毒RNA、用RT-PCR進(jìn)行g(shù)ag基因擴(kuò)增并將陽性擴(kuò)增產(chǎn)物送北京博邁德公司進(jìn)行Sanger法測序,然后采用Bioedit、Simplot和MEGA 5.05等相關(guān)生物學(xué)軟件對所得序列進(jìn)行序列的比對校正、亞型分析和系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)果1.研究對象共305人,流行病學(xué)特征統(tǒng)計(jì)如下:⑴男性多于女性,男性患者占66.56%(203/305),女性患者占33.44%(102/305),男女比例為1.99:1(203/102);⑵20~49歲年齡組患者占56.72%(173/305),≥50歲年齡組患者的構(gòu)成比達(dá)到44.62%(130/305);⑶農(nóng)民所占比例最大,超過了一半,為50.82%(155/305),其次為家務(wù)及待業(yè)人員13.77%(42/305)、工人及民工12.13%(37/305),學(xué)生和離退休人分別占到了2.3%(7/305)和5.57%(17/305);⑷初中及以下學(xué)歷人數(shù)的構(gòu)成比為76.39%(233/305),大專及以上學(xué)歷人數(shù)占到了4.92%(15/305);⑸異性性接觸傳播占絕大部分為95.74%(292/305),同性性傳播、注射毒品傳播所占比例較小;⑹已婚人數(shù)占67.87%(207/305);未婚、離異或喪偶分別占16.72%(51/305)和14.75%(45/305)。2.擴(kuò)增與測序概況:共305份血漿樣本,成功擴(kuò)增gag區(qū)175例;測序成功得到基因序列155份。3.亞型判定及分布⑴最終成功擴(kuò)增得到155份樣本的gag基因序列,共發(fā)現(xiàn)4種亞型:CRF01-AE亞型124例,CRF07-BC亞型12例,CRF08-BC亞型14例,B亞型5例。⑵各地區(qū)均以CRF01_AE為主,5例B亞型均分布在桂林地區(qū),CRF07-BC亞型、CRF08-BC亞型在各地區(qū)均有分布。結(jié)論1.根據(jù)流行病學(xué)資料結(jié)果,我們可以得出以下結(jié)論:應(yīng)重視女性性病的治療、更加重視婚檢、孕檢的艾滋病抗體篩查,關(guān)注老年人、學(xué)生經(jīng)性接觸感染艾滋病的現(xiàn)象,加大對已婚患者的監(jiān)管力度,采取針對低文化水平人群的有效防治措施。2.通過對廣西三城市HIV-1流行毒株gag區(qū)的擴(kuò)增測序結(jié)果,我們發(fā)現(xiàn)了4種亞型:CRF01-AE亞型124例,CRF07-BC亞型12例,CRF08-BC亞型14例,B亞型5例,提示廣西地區(qū)HIV-1流行毒株存在亞型多樣性。3.廣西各地區(qū)以異性性接觸傳播為主要傳播途徑,主要流行亞型為CRF01_AE,可能來自于國內(nèi)毒株。隨著主要傳播途徑和亞型的變化,迫切需要對高危人群進(jìn)行宣傳教育和行為干預(yù)以阻斷HIV/AIDS的流行和傳播。4.從分子水平上證實(shí)了廣西地區(qū)的HIV-1流行毒株亞型和感染途徑存在多樣性。
【關(guān)鍵詞】:HIV-1 流行特征 亞型 gag基因
【學(xué)位授予單位】:桂林醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R512.91
【目錄】:
  • 中文摘要5-7
  • ABSTRACT7-10
  • 英漢縮略詞對照表10-11
  • 前言11-16
  • 1 實(shí)驗(yàn)材料16-19
  • 1.1 研究對象16
  • 1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器16-17
  • 1.3 主要實(shí)驗(yàn)試劑17-18
  • 1.4 主要耗材18
  • 1.5 相關(guān)軟件18-19
  • 2 實(shí)驗(yàn)方法19-23
  • 2.1 提取血漿病毒RNA19-20
  • 2.2 逆轉(zhuǎn)錄/巢式PCR(RT/Nest-PCR)20-22
  • 2.3 序列分析22-23
  • 3 結(jié)果23-27
  • 3.1 gag區(qū)電泳圖23
  • 3.2 流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果23-24
  • 3.3 基因分型結(jié)果24-27
  • 4 結(jié)論27-29
  • 參考文獻(xiàn)29-33
  • 綜述33-42
  • 參考文獻(xiàn)39-42
  • 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄42-43
  • 致謝43-44

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本文編號:353216

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