miR-125b-5p在泡型包蟲病患者中的驗證、分子調控和靶基因預測
發(fā)布時間:2021-10-19 11:24
目的:1)檢測hsa-miR-125b-5p在泡型包蟲病患者的血清及肝臟病灶邊緣帶組織中的表達;2)體外慢病毒轉染Huh7細胞使hsa-miR-125b-5p過表達,檢測細胞增殖活力的改變;3)初步預測和分析hsa-miR-125b-5p的靶基因,為進一步尋找泡型包蟲病早期診斷的分子標志物提供一定的理論基礎。方法:1)利用熒光定量PCR檢測22份泡型肝包蟲病患者及22份健康對照血清中hsa-miR-125b-5p的相對表達量;2)利用熒光定量PCR檢測16個泡型包蟲病患者肝病灶的邊緣帶與遠離病灶的肝組織中hsa-miR-125b-5p的相對表達量;3)構建慢病毒載體轉染Huh7細胞,使hsa-miR-125b-5p過表達,用CCK-8試劑盒處理轉染后的Huh7細胞,然后用酶標儀檢測450nm波長處的OD值,統(tǒng)計分析得出其增殖活力是否發(fā)生變化;4)用miRDB、star Base、miRwalk和miRTarbase四個數(shù)據(jù)庫資源預測hsa-miR-125b-5p可能的靶基因,并進行整合。然后利用Enrichr數(shù)據(jù)庫、KEGG數(shù)據(jù)庫和STRING數(shù)據(jù)庫進行GO分析、通路分析和構建靶蛋白的...
【文章來源】:青海大學青海省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
血清中hsa-miR-125b-5p及內參U6的擴增曲線
8圖2血清中hsa-miR-125b-5p及內參U6的溶解曲線Figure2Dissolutioncurveofhsa-miR-125b-5pandinternalreferenceU6inserum1.2.2血清中hsa-miR-125b-5p的相對表達量如表2所示,實驗組與對照組的相對表達量分別為2.440±0.753和1.032±0.262,說明hsa-miR-125b-5p在泡型包蟲病患者組血清中的表達量要高于健康對照組。柱狀圖見圖3。表2實時熒光定量pcr數(shù)據(jù)統(tǒng)計表(血清)Table2StatisticstableofRT-qPCR(serum)組別性別年齡例數(shù)相對表達量P值實驗組男42.09±14.54112.440±0.753P<0.0001女42.54±10.9911對照組男55.72±12.74111.032±0.262女49.27±12.7411
11圖4肝組織中hsa-miR-125b-5p及內參U6的擴增曲線Figure4Amplificationcurveofhsa-miR-125b-5pandinternalreferenceU6inliver圖5肝組織中hsa-miR-125b-5p及內參U6的溶解曲線Figure5Dissolutioncurveofhsa-miR-125b-5pandinternalreferenceU6inliver2.2.2肝組織中hsa-miR-125b-5p的相對表達量實驗組相對表達量為1.932±0.682,對照組相對表達量為1.001±0.049,表明泡型包蟲病患者肝病灶邊緣帶中的hsa-miR-125b-5p表達量要高于自身遠離病灶的肝組織,跟血清中的表達趨勢相同。具體統(tǒng)計見表3,柱狀圖見圖6。表3實時熒光定量pcr數(shù)據(jù)統(tǒng)計表(肝)Table3StatisticstableofRT-qPCR(liver)組別年齡例數(shù)相對表達量P值實驗組45.05±11.55161.932±0.682P<0.0001對照組1.001±0.049
【參考文獻】:
期刊論文
[1]非酒精性脂肪性肝病防治指南(2018更新版)[J]. National Workshop on Fatty Liver and Alcoholic Liver Disease, Chinese Society of Hepatology;Chinese Medical Association Fatty Liver Expert Committee, Chinese Medical Doctor Association;. 傳染病信息. 2018(05)
[2]包蟲病的危害與控制策略的選擇[J]. 張文寶,郭剛,李軍. 中國動物保健. 2017(07)
[3]棘球蚴病防治成就及面臨的挑戰(zhàn)[J]. 溫浩,吐爾干艾力·阿吉,邵英梅,林仁勇,李海濤,吐爾洪江·吐遜,呂國棟,張文寶. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2015(06)
[4]mi R-122 negatively correlates with liver fibrosis as detected by histology and FibroScan[J]. Tünde Halász,Gábor Horváth,Gabriella Pár,Klára Werling,András Kiss,Zsuzsa Schaff,Gábor Lendvai. World Journal of Gastroenterology. 2015(25)
[5]慢病毒載體及其研究進展[J]. 孟凡榮,陳琛,萬海粟,周清華. 中國肺癌雜志. 2014(12)
[6]TGF-β/Smad信號轉導通路與肝纖維化研究進展[J]. 付玲珠,鄭婷,張永生. 中國臨床藥理學與治療學. 2014(10)
[7]Circulating microRNAs in patients with non-alcoholic fatty liver disease[J]. Serkan Dogan,Gokmen Zararsiz,Sebnem Gursoy,Kadri Guven,Omer Ozbakir,Munis Dundar,Mehmet Yucesoy. World Journal of Hepatology. 2014(08)
[8]棘球蚴病流行病學研究進展[J]. 齊顏鳳,伍衛(wèi)平. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2013(02)
[9]生物信息學重大基礎科學問題及關鍵技術——第51期“雙清論壇”綜述[J]. 趙屹,谷瑞升,杜生明. 中國科學基金. 2012(02)
[10]肝星狀細胞主要信號轉導通路與肝纖維化的關系[J]. 汪美鳳,平鍵,成揚. 實用肝臟病雜志. 2010(06)
碩士論文
[1]帕金森病相關基因的篩選及生物信息學分析[D]. 陳光樂.南方醫(yī)科大學 2015
[2]miR-19b與TGF-β1交互作用對肝星狀細胞增殖影響機制研究[D]. 王麗敏.新疆大學 2014
本文編號:3444776
【文章來源】:青海大學青海省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
血清中hsa-miR-125b-5p及內參U6的擴增曲線
8圖2血清中hsa-miR-125b-5p及內參U6的溶解曲線Figure2Dissolutioncurveofhsa-miR-125b-5pandinternalreferenceU6inserum1.2.2血清中hsa-miR-125b-5p的相對表達量如表2所示,實驗組與對照組的相對表達量分別為2.440±0.753和1.032±0.262,說明hsa-miR-125b-5p在泡型包蟲病患者組血清中的表達量要高于健康對照組。柱狀圖見圖3。表2實時熒光定量pcr數(shù)據(jù)統(tǒng)計表(血清)Table2StatisticstableofRT-qPCR(serum)組別性別年齡例數(shù)相對表達量P值實驗組男42.09±14.54112.440±0.753P<0.0001女42.54±10.9911對照組男55.72±12.74111.032±0.262女49.27±12.7411
11圖4肝組織中hsa-miR-125b-5p及內參U6的擴增曲線Figure4Amplificationcurveofhsa-miR-125b-5pandinternalreferenceU6inliver圖5肝組織中hsa-miR-125b-5p及內參U6的溶解曲線Figure5Dissolutioncurveofhsa-miR-125b-5pandinternalreferenceU6inliver2.2.2肝組織中hsa-miR-125b-5p的相對表達量實驗組相對表達量為1.932±0.682,對照組相對表達量為1.001±0.049,表明泡型包蟲病患者肝病灶邊緣帶中的hsa-miR-125b-5p表達量要高于自身遠離病灶的肝組織,跟血清中的表達趨勢相同。具體統(tǒng)計見表3,柱狀圖見圖6。表3實時熒光定量pcr數(shù)據(jù)統(tǒng)計表(肝)Table3StatisticstableofRT-qPCR(liver)組別年齡例數(shù)相對表達量P值實驗組45.05±11.55161.932±0.682P<0.0001對照組1.001±0.049
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[8]棘球蚴病流行病學研究進展[J]. 齊顏鳳,伍衛(wèi)平. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2013(02)
[9]生物信息學重大基礎科學問題及關鍵技術——第51期“雙清論壇”綜述[J]. 趙屹,谷瑞升,杜生明. 中國科學基金. 2012(02)
[10]肝星狀細胞主要信號轉導通路與肝纖維化的關系[J]. 汪美鳳,平鍵,成揚. 實用肝臟病雜志. 2010(06)
碩士論文
[1]帕金森病相關基因的篩選及生物信息學分析[D]. 陳光樂.南方醫(yī)科大學 2015
[2]miR-19b與TGF-β1交互作用對肝星狀細胞增殖影響機制研究[D]. 王麗敏.新疆大學 2014
本文編號:3444776
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