目的了解上海市浦東新區(qū)2014—2015年進(jìn)入治療的HIV-1感染者的基因特性及耐藥情況。方法以巢式RT-PCR方法擴(kuò)增91份治療前HIV-1感染者樣品HIV-1聚合酶片段,測(cè)序,構(gòu)建進(jìn)化樹并進(jìn)行HIV-1基因亞型分析,將獲得的核酸序列提交至斯坦福大學(xué)HIV耐藥數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行耐藥位點(diǎn)分析。結(jié)果 91份樣品測(cè)序成功53份,其中CRF01_AE重組體占67.9%（36/53）,B亞型占7.5%（4/53）,C亞型占3.8%（2/53）,CRF07_BC重組體占20.8%（11/53）。在53條基因序列中41條檢測(cè)到與HIV-1蛋白酶抑制劑（PIs）和逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑（RTIs）相關(guān)的共計(jì)66個(gè)突變位點(diǎn),其中4個(gè)耐藥突變位點(diǎn)與非核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑（NNRTIs）及核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑（NRTIs）耐藥相關(guān),原發(fā)耐藥率為7.5%（4/53）;37條基因序列檢測(cè)到的62個(gè)突變位點(diǎn)與HIV-1 PIs和RTIs繼發(fā)耐藥性突變或基因的多形態(tài)改變相關(guān)。結(jié)論 2014—2015年進(jìn)入治療的HIV-1感染者基因多種亞型并存,以CRF01_AE重組體為... 

【文章來源】：上海預(yù)防醫(yī)學(xué). 2016,28(12)

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【文章目錄】：
1 對(duì)象與方法
    1.1 對(duì)象
    1.2 方法
        1.2.1 樣品采集及處理
        1.2.2 HIV-1核酸提取
        1.2.3 HIV-1蛋白酶區(qū)、逆轉(zhuǎn)錄酶區(qū)的擴(kuò)增及測(cè)序
        1.2.4 亞型及耐藥位點(diǎn)分析
    1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 基本流行病學(xué)特征
    2.2 進(jìn)化樹構(gòu)建和亞型分析
    2.3 HIV-1蛋白酶和逆轉(zhuǎn)錄酶區(qū)相關(guān)突變位點(diǎn)分析
    2.4 HIV-1蛋白酶抑制劑(PIs)和逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(RTIs)耐藥相關(guān)基因突變分析
        2.4.1 PIs耐藥相關(guān)基因突變分析
        2.4.2 RTIs耐藥相關(guān)基因突變分析
    2.5 HIV-1基因亞型與耐藥突變位點(diǎn)的關(guān)系
    2.6 HIV-1基因亞型與耐藥的關(guān)系
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]吉林省HIV-1耐藥警戒線調(diào)查分析[J]. 臧�；�,燕晶,郭琪,孫柳燕,邢輝.  中國(guó)衛(wèi)生工程學(xué). 2015(06)
[2]上海市常住人口HIV-1感染者基因亞型和耐藥性突變橫斷面研究[J]. 薛以樂,宮菊麗,鄭曉虹,蓋晶,張瑋,寧鎮(zhèn),莊鳴華,潘啟超,盧偉,鐘平,康來儀.  診斷學(xué)理論與實(shí)踐. 2007(03)



本文編號(hào)：3329559