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上海市浦東新區(qū)2014—2015年HIV-1感染者治療前基因特性及耐藥分析

發(fā)布時間:2021-08-08 07:59
  目的了解上海市浦東新區(qū)2014—2015年進入治療的HIV-1感染者的基因特性及耐藥情況。方法以巢式RT-PCR方法擴增91份治療前HIV-1感染者樣品HIV-1聚合酶片段,測序,構(gòu)建進化樹并進行HIV-1基因亞型分析,將獲得的核酸序列提交至斯坦福大學HIV耐藥數(shù)據(jù)庫進行耐藥位點分析。結(jié)果 91份樣品測序成功53份,其中CRF01AE重組體占67.9%(36/53),B亞型占7.5%(4/53),C亞型占3.8%(2/53),CRF07BC重組體占20.8%(11/53)。在53條基因序列中41條檢測到與HIV-1蛋白酶抑制劑(PIs)和逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(RTIs)相關(guān)的共計66個突變位點,其中4個耐藥突變位點與非核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NNRTIs)及核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NRTIs)耐藥相關(guān),原發(fā)耐藥率為7.5%(4/53);37條基因序列檢測到的62個突變位點與HIV-1 PIs和RTIs繼發(fā)耐藥性突變或基因的多形態(tài)改變相關(guān)。結(jié)論 2014—2015年進入治療的HIV-1感染者基因多種亞型并存,以CRF01AE重組體為... 

【文章來源】:上海預(yù)防醫(yī)學. 2016,28(12)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 對象與方法
    1.1 對象
    1.2 方法
        1.2.1 樣品采集及處理
        1.2.2 HIV-1核酸提取
        1.2.3 HIV-1蛋白酶區(qū)、逆轉(zhuǎn)錄酶區(qū)的擴增及測序
        1.2.4 亞型及耐藥位點分析
    1.3 統(tǒng)計學分析
2 結(jié)果
    2.1 基本流行病學特征
    2.2 進化樹構(gòu)建和亞型分析
    2.3 HIV-1蛋白酶和逆轉(zhuǎn)錄酶區(qū)相關(guān)突變位點分析
    2.4 HIV-1蛋白酶抑制劑(PIs)和逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(RTIs)耐藥相關(guān)基因突變分析
        2.4.1 PIs耐藥相關(guān)基因突變分析
        2.4.2 RTIs耐藥相關(guān)基因突變分析
    2.5 HIV-1基因亞型與耐藥突變位點的關(guān)系
    2.6 HIV-1基因亞型與耐藥的關(guān)系
3 討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]吉林省HIV-1耐藥警戒線調(diào)查分析[J]. 臧;,燕晶,郭琪,孫柳燕,邢輝.  中國衛(wèi)生工程學. 2015(06)
[2]上海市常住人口HIV-1感染者基因亞型和耐藥性突變橫斷面研究[J]. 薛以樂,宮菊麗,鄭曉虹,蓋晶,張瑋,寧鎮(zhèn),莊鳴華,潘啟超,盧偉,鐘平,康來儀.  診斷學理論與實踐. 2007(03)



本文編號:3329559

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