基于TP0136蛋白異質(zhì)性建立一種新的蒼白密螺旋體分子分型方法
發(fā)布時(shí)間:2021-08-01 19:20
目的基于蒼白密螺旋體屬(TP)TP0136蛋白的異質(zhì)性,建立一種新的TP分子分型方法。方法從GenBank中查詢9株梅毒蒼白密螺旋體(TPA)、3株雅司蒼白密螺旋體(TPE)、1株未分類的類人猿密螺旋體(FB)和1株地方密螺旋體(TEN)的TP0136開放閱讀框(ORF)氨基酸序列并進(jìn)行多重序列比對(duì),得出TP0136蛋白分子分型結(jié)果。利用建立的TP0136蛋白分子分型方法,對(duì)2015年1月至2018年12月南方醫(yī)科大學(xué)皮膚病醫(yī)院收集的23株TPA臨床分離株進(jìn)行分類,并將分型結(jié)果與傳統(tǒng)的Arp/Tpr/TP0548三基因分型方法進(jìn)行比較。結(jié)果 TP0136蛋白在不同種TP株中具有高度異質(zhì)性,根據(jù)TP0136氨基酸序列,TPE、FB和TEN分為Ⅰ~Ⅳ 4個(gè)亞型,TPA分為Ⅴ~Ⅹ 6個(gè)亞型,TPA臨床株分為Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ 4個(gè)亞型。通過(guò)TPA傳統(tǒng)的三基因分型方法可將23株TPA臨床株分為13D/d、14D/f、14D/g、15D/f、16A/e 5型。將TP0136分型法與傳統(tǒng)分型法相結(jié)合,可將上述臨床株進(jìn)一步細(xì)分為10型,其中14D/f型應(yīng)用TP0136分型法可進(jìn)一步分為3個(gè)亞型。結(jié)論 T...
【文章來(lái)源】:中華皮膚科雜志. 2020,53(07)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]梅毒螺旋體的基因分型與臨床意義[J]. 劉進(jìn)權(quán),許卜方,胡文龍,王千秋. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2018 (06)
[2]三基因分型法檢測(cè)梅毒螺旋體基因型別[J]. 彭銳銳,尹躍平,魏萬(wàn)惠,王紅春,張津萍,陳祥生. 中華皮膚科雜志. 2011 (11)
本文編號(hào):3316102
【文章來(lái)源】:中華皮膚科雜志. 2020,53(07)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]梅毒螺旋體的基因分型與臨床意義[J]. 劉進(jìn)權(quán),許卜方,胡文龍,王千秋. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2018 (06)
[2]三基因分型法檢測(cè)梅毒螺旋體基因型別[J]. 彭銳銳,尹躍平,魏萬(wàn)惠,王紅春,張津萍,陳祥生. 中華皮膚科雜志. 2011 (11)
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